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02/12/2015 1 Replicação do DNA Prof. Dr. Helton Colares Iguatu-CE, Novembro de 2015 Faculdade de Educação, Ciências e Letras de Iguatu – FECLI Disciplina: Biologia Molecular Dogma Central da Biologia Molecular Moderna 02/12/2015 2 Metabolismo do DNA 1. Replicação do DNA 2. Reparo do DNA 3. Recombinação do DNA 1) Conceito: Os Ácidos Nucléicos são macromoléculas, formadas por seqüências de nucleotídeos, especializadas no armazenamento, na transmissão e no uso da informação genética. Existem dois tipos de Ácidos Nucléicos: a) DNA (Ácido Desoxirribonucléico) b) RNA (Ácido Ribonucléico) 2) Composição Química Os Ácidos Nucléicos são compostos por monômeros chamados nucleotídeos. Estrutura de um nucleotídeo: 1 Fosfato 1 Pentose 1 Base Nitrogenada Nucleotídeo Revisão 02/12/2015 3 Diferenças entre DNA e RNA – Adenina – Guanina – Citosina – Timina – Adenina – Guanina – Citosina – Uracila Purinas Pirimidinas Bases Nitrogenadas DNA RNA Desoxirribose Ribose Fita dupla Fita simples Açúcar Ligação Fosfodiéster As Ligações fosfosdiésteres unem os nucleotídeos sucessivos • Um grupamento fosfato liga o carbono 5’ da pentose de um nocletídeo ao carbo 3’ da pentose do nucleotídeo seginte •Esqueleto hidrofílico; •O esqueleto covalente do DNA e do RNA está sujeito à hidrólise lenta e não enzimática da ligação Fosfodiéster. 02/12/2015 4 • 2 cadeias independentes • Dupla hélice, sentido direito • Hélices anti-paralelas; • Complementariedade das bases • Eixo externo hidrofílico - deoxiribose + fosfato; • Bases hidrofóbicas (planas) empilhadas no interior da hélice; • Bases ligadas pontes de H+ Modelo da Dupla hélice de DNA Pareamento específico das bases no DNA C G Pontes de H T A 02/12/2015 5 Replicação DNA É um processo enzimático através do qual uma nova fita dupla de DNA é produzida tendo uma fita preexistente como molde. Biossíntese de Ácidos Nucléicos – Replicação do DNA • DNA ocupa uma posição central como repositório das informações genéticas • Suas seqüências de nucleotídeos (genes) codificam todos RNAs e proteínas celulares • Portanto, deve ser preservado sem alterações e transmitido de uma geração para outra intacto • Complicadores do processo: – Tamanho da molécula – Compactação e ligação a outras proteínas – Velocidade – Simultaneidade – Momento certo dentro do ciclo celular – Fidelidade Modelo: E. coli 02/12/2015 6 Ciclo celular Interfase: •Fase G1: crescimento. •Fase S: DNA é replicado. •Fase G2: preparação para a divisão celular. Fase Mitótica: •Prófase; •Metáfase; •Anáfase; •Telófase; REGRAS DA REPLICAÇÃO 1. A replicação é um processo semi-conservativo 02/12/2015 7 Formam –se 2 moléculas de DNA idênticas Fita original (velha) Fita original (velha) Fita NOVA 2. A replicação tem início em uma origem e depois procede bidirecionalmente Procarioto: Única origem de replicação Eucarioto: Várias origens de replicação REGRAS DA REPLICAÇÃO 02/12/2015 8 Forquilha de replicação: Região do DNA onde ocorre a replicação do DNA FORQUILHA DE REPLICAÇÃO 3. A síntese de DNA é feita na direção 5´ 3´e é semidescontínua Fita contínua (líder) Fita descontínua REGRAS DA REPLICAÇÃO 02/12/2015 9 DnaA Reconhece a origem e abre a dupla fita em sítios específicos DnaB (helicase) Desenrola o DNA SSB Liga a fita simples de DNA impedindo o reanelamento das mesmas. Primase (DnaG) Sintetiza os primers de RNA DNA Polimerase III Sintese da fita nova DNA Polimerase I Preenche as lacunas e excisa os primers DNA Ligase Liga os fragmentos DNA girase Alivia a tensão torsional gerada pela abertura da dupla-fita Dam Metilase Metila as sequências GATC na OriC PRINCIPAIS PROTEÍNAS ENVOLVIDAS NA REPLICAÇÃO DO DNA Principais enzimas envolvidas no processo: responsáveis pela adição de nucleotídeos e reparo Síntese de DNA: adição de nucleotídeos a extremidade 3´OH da cadeia em crescimento; Necessidade de um iniciador (Primer); Necessidade de um molde; Matéria-prima: desoxiribonucleosídeo 5´trifosfato Sentido da síntese sempre é 5’ 3’ As DNA-polimerases tem atividade revisora (sentido 3’ 5’). DNA Polimerases 02/12/2015 10 DNA Polimerases São conhecidas cinco DNA polimerases: •Pol I: Excisão dos iniciadores e preenchimento dos espaços; atua nos processos de replicação, recombinação e reparo; •Pol II: Importante em um sistema de reparo; •Pol III: principal enzima polimerizadora (alongamento da fita); é a mais complexa (10 subunidades). •Pol IV e Pol V: Envolvidas em processos não usuais de reparo. Pol I PolII PolIII Polimerização 5’ 3’ + + + At. Revisora 3’ 5’ + + + At. Revisora 5’ 3’ + - - Número de subunidades 1 4 10 Tamanho em kDa 103 90 ~900 Velocidade de Polimerização(nt/seg) 16-20 40 250-1000 Processividade 3-200 1500 500000 (nt adicionados antes da dissociação do molde) DNA Polimerases 02/12/2015 11 ESTÁGIOS DA REPLICAÇÃO 1. INICIAÇÃO 2. ALONGAMENTO 3. TERMINAÇÃO 1. INICIAÇÃO ORIGEM DA REPLICAÇÃO – OriC : - 245 pb ; - 3 repetições de 13 pb; - 4 repetições de 9 pb; (A=T) É a única etapa do processo de replicação que é regulado 02/12/2015 12 Montagem do Replissomo • Retirada das histonas • DNA helicase – Quebra pontes de H • Proteínas de ligação a fita simples (SSB) • DNA topoisomerases – Tiram a tensão • Envolve duas operações distintas, mas relacionadas: 1. Síntese da fita líder 2. Síntese da fita atrasada. 2. ALONGAMENTO 02/12/2015 13 Replissomo A proteína DNA B (helicase) é responsável pelo movimento para frente da forquilha Cada centro catalítico da DNA PolIII sintetiza uma das fitas-filhas Proteínas SSB mantem as fitas parentais separadas Replicação das fitas • Fita líder – Primase age uma vez • Fita Atrasada – Primase age várias vezes – 1967, Fragmentos de Okasaki 02/12/2015 14 1. Síntese de um RNA primer pela primase na origem de replicação 2. Desoxirribunocleotídeos são adicionados pela DNA polimerase III continuamente a partir da forquilha de replicação 2. ALONGAMENTO SÍNTESE DA FITA LÍDER SÍNTESE DA FITA ATRASADA 1. Síntese de um RNA primer pela primase (DnaG) na origem de replicação 2. Síntese dos fragmentos de Okasaki 3. Uma só polimerase: são criadas alças para aproximar os dois pontos de replicação ( das duas fitas) 4. Processo repetido diversas vezes 2. ALONGAMENTO 02/12/2015 15 Fragmentos de Okasaki ocorrem na fita descontínua A DNA polimerase III é responsável pela síntese da maior parte do DNA A DNA polimerase I remove o primer de RNA e preenche as lacunas A DNA ligase sela as quebras -Procariotos: DNA circular, quando as duas forquilhas de replicação se encontram ela termina. Ainda há o sistema Ter-tus. -Eucariotos: seqüências de nucleotídeos específicas no final dos cromossomos, incorporadas a telômeros.3. TERMINAÇÃO 02/12/2015 16 -A iniciação é a única fase regulada da replicação, de forma que só ocorra uma vez por ciclo celular ; -afetada pela metilação de DNA -DAM metilase na (5´) GATC sobre a fita parental REGULAÇÃO PARTICULARIDADES DOS EUCARIOTOS Diferenças fundamentais : - estrutura nucleoproteica complexa; - molécula de DNA maior ( 150 x 106 vs 4,7 x 106); - cromossomos lineares. Soluções: - maquinário enzimático mais complexo; - múltiplas origens de replicação; - telômeros.
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