Resumo microbiologia

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7/02/2018
O que é microbiologia? É o estudo dos microrganismos, como bactérias, vírus e fungos. 
0,2mm é o que o olho humano pode ver (resolução olho humano)
Na evolução dos seres vivos no planeta, temos os fósseis bacterianos mais antigos com 4,5 bilhões de anos.
A bactéria pode ser usada na produção de queijo, bolo, pão... o fermento biológico é uma levedura.
Relação micróbios X seres “superiores”
Mineiros= gênero Thiobacillus. Absorvem e acumulam muitos minérios nas jazidas de cobre e urânio dos eua. São necessários mais de 1 milhão de bactérias para absorver 1 grama de minério.
Adubadores= bactérias que conseguem captar nitrogênio do ar, vivendo associadas as raízes das plantas, suprindo-as de metabólitos nitrogenados.
Produtores de alimentos= Bactérias e fungos que participam de forma ativa na produção de queijo, pão, chocolate, vinho e cerveja. 
Geneticistas= 
Farmacêuticos= 
Lixeiros=
Produção de linho e fermentação da matéria prima(caldo de cana) que depois de destilada é usada como álcool.
21/02/2018
Bactéria tem DNA circular, um dna mais simples, há bilhões de anos.
Nós temos DNA linear que é mais complexo que o circular para realizar seus processos (em qualquer situação: transmissão, replicação, qtd de genes presentes no dna...). Funciona de uma forma mais controlada. 
Quando paramos um tratamento de antibiótico no meio do caminho, prejudicamos o tratamento. Aquela bactéria que estava meio morta, mas meio viva, vai retornar. Algumas naturalmente são mais resistentes. Vai gerar uma mutação (uma mudança no dna). Nós não induzimos a resistência, ela surge aleatoriamente e naturalmente com uma mudança no dna. E a bactéria fica sujeita a esse tipo de alteração por culpa da formação desse dna e da maquinaria que funciona acessória a ele.
Dna principal é circular, mesmo não parecendo. 
Fita principal e plasmídeos são pedaços de ácidos nucleicos/ bases nitrogenadas que se estabelecem de uma forma circular. Plasmídeo é bem pequeno quando comparado ao dna principal. O plasmídeo está associado ao dna. Plasmídeo é um dna extra, com genes acessórios e características especiais e com resistências e metabolismos diferenciados. Eles são pequenos círculos de DNA diferente do DNA cromossômico que confere uma resistência a antibióticos. 
Cerveja, queijo, insulina...coisas que utilizamos no nosso dia a dia mas que pegamos de funções/metabolismos de microrganismos.
O que da resistência a uma bactéria são os plasmídeos (uma de suas funções).
Parede celular é proteção
Metabolismo- vão captar nutrientes do meio ou realizar a própria transformação. Então temos fungos e bactérias autotróficas.
A taxa de mutação de uma bactéria é muito rápida e diferente da nossa. O nosso DNA muda porém há um controle.
Propriedades de algumas células:
Diferenciação ou formação de esporos= de uma parte dele nasce um esporo, uma mini célula e que quando tem acesso com um ambiente com os nutrientes necessários (obtenção de alimentos), ele vai crescer de novo como um indivíduo completo e maduro-são estágios diferentes no ciclo de vida dele.
Comunicação= Quando uma célula percebe o ambiente através de liberação química e altera seu metabolismo, se comunicando com outras células.
Intercâmbio gênico= Troca de material genético por meio de vários mecanismos. (conjugação, transformação, transdução)
Motilidade= Algumas bactérias realizam a autopropulsão (possuem flagelos que são como suas pernas e pés) 
Esporos servem para disseminação ou dispersão. Eles são pequenos e mais leves e conseguem chegar a outros lugares que a célula mais pesada não consegue.
Existem bactérias que vivem em condições extremas: altas temperaturas, baixas temperaturas, pressão, salinidade...
Cisto é uma célula eucariota que vive protegida por hospedeiro e tem membrana. Quando ela sai do hospedeiro, ela cria uma parede celular. O cisto é a presença da parede.
Por que a bactéria não precisa se tornar um cisto? Porque ela naturalmente já tem uma parede celular. 
28/02/2018
Morfologia bacteriana
Coco- homogêneo em tamanho (micrococo, diplococo, tétrade, sarcina, estafilococo, estreptococo)
Bacilo – variação de forma e tamanho
Espirilo – corpo rígido e se move por flagelo externo
Espiroqueta – corpo flexível e se move por contração do citoplasma
Talo/hifa
Bactéria filamentosa
Vibrião 
Ultraestruturas: 
Membrana plasmática: 
-função: transporte de nutrientes e impede extravasamento; ancoragem de proteínas; conservação de energia. – transportador abc são proteínas. 
Parede celular
Composto de peptídeos glicanos ou mureina, que confere a rigidez
-função: impede que a célula estoure por causa da alta tonicidade; proteção; suporte de antígeno somático bacteriano (protege a si mesma e o organismo que infecta).
Flagelo
-estrutura basal+gancho+longo filamento (proteína=flagelina-movimento rotacional). Não possui membrana, só flagelina.
Atríquia- sem flagelo
Monotriquia- único flagelo(unipolar)
Anfitriquia- único flagelo (bipolar)
Lofotriquia- tufo (uni ou bipolar)
Peritriquia- por toda a bactéria
Pili e Fímbria
-Pili tem capacidade de crescer, com função de adesão e troca de informação (conjugação). De 1 a 10/célula
-Fímbria=estrutura proteica relacionada a adesão, menor e mais fina que o flagelo. (1000 ou mais por célula)
Glicocálice 
Conjunto de receptores, percepção do meio.
-cápsula: organizada e acoplada firmemente a parede celular
-camada limosa: desorganizada e frouxamente acoplada a parede celular 
Corpos de inclusão de reserva
-espécie de vacúolos, porém sem a membrana, sendo apenas um aglomerado. Armazenamento de substância de reserva.
Corpos de inclusão de minerais 
-Acúmulo mineral dentro das bactérias (presentes em bactérias quimiolitotróficas)
Vesícula de gás:
-São organismos planctônicos que permitem a flutuação na coluna d’água.
Endosporos
-Células altamente diferenciadas que possuem alta resistência ao calor (endósporos terminais, sub terminais e centrais). 
Gram positiva X Gram negativa
-1 membrana citoplasmática -2 membranas 
-Colocação roxa - Coloração rosa 
-Camada mais espessa -Camada mais fina
de peptideoglicano
-2 espaços periplasmáticos -1 espaço periplasmático
-parede mais espessa, e o corante não -Parede fininha, quando se coloca o solvente
 consegue sair, e ela fica toda roxa ele vai entrar, eluir esse corante e retirar ele 
21/03/2018 
A reprodução bacteriana acontece por divisão binária ou cissiparidade (são sinônimos): 
Ela vai ficar mais alongada, mais comprida, então tem a fase de elongação. Depois ela tem que fazer o septo, que é um corte. A bactéria como não tem só uma membrana e sim, uma parede celular, que é resistente, dura, não tem como “estrangular” a parede. Então para poder dividir as células é preciso haver o inicio da formação do septo, que é a divisão da parede celular da bactéria. A partir do momento que esse septo vai aprofundando, a bactéria vai tomando forma. Ela so consegue se dividir em 2 indivíduos separados a partir do momento que septo consegue se formar e separar as duas partes, de forma que formam uma membrana pra cada lado. Se for tirada ou não funcionar a proteína que coordena a formação de septo (proteína FTs), a divisão não vai ocorrer por completo.
Tem que acontecer várias coisas dentro e fora da bactéria para ocorrer a divisão.
Morfologicamente dividida em 3 etapas:
Elongação: crescimento do volume da célula –duplicação do material genético (preparação pra célula se dividir).
Invaginação: começa a formar o septo(senão houver essa formação, não vai haver a separação delas).
Separação: “final”, o septo separa as duas partes, formando 2 novas bactérias com suas paredes celulares formadas. Senão houver separação total, NÃO significa que não houve individualização da bactéria. Ela só nãodesgruda completamente pq há uma parede grudada na outra.
Ex:diplococo, tétrade, estafilococos, estreptococos. Porem são individualizadas. 
Bactéria tem alta tonicidade (concentrações de sais dentro dela) - ela não faz a mesma regulação que as nossas células fazem, de se temos mto sal dentro da célula, ela começa a colocar agua e agua.
A bactéria não rompe por conta da sua parede celular que dá proteção. Elas vivem em sistema de alta tonicidade, ou seja, alta concentração de partículas, de soluto dentro dela. Então você teria bastante entrada de água para regular o sistema. Ela fica turgida, inchada, mas não rompe.
Nossas células tem um citoesqueleto bem complexo. Bactéria tem algo similar, mas não o citoesqueleto. 
A célula por si só não vai se separar sozinha, não vai formar septo. É preciso que algo faça com que essa parede comece a formação desse septo. Então existe um anel formado de proteína que vai começar a separar e formar o septo. Começa a clivar os peptídeos glicanos que formam a parede. Esse anel é chamado de anel FtsZ. A formação do septo ocorre sempre no meio da bactéria.
A proteína está espalhada na célula e quando tem o sinal pra começar o processo de divisão, ela vai se agrupando no centro, pq existe um fluxo de outras proteínas coordenando a formação desse anel. As proteínas vão se agrupando no centro, formam o anel, e vão separando e formando o septo. 
As proteínas acessórias tem como função ancorar o anel a parede, para que não fiquem soltas. São elas as ZipA e FtsA. 
Todo esse complexo (do anel e das proteínas de ancoramento) é chamado de divisiossomo. NÃO é so a formação do anel. É tudo que permite o anel consiga se ancorar e começar o processo de formação do septo.
E porque vai sempre se formar no meio???? Esse processo de formação do anel tem que ser coordenado de alguma forma. Isso vem de oscilações proteicas (MinCD e MinE). Elas ficam igual molas na célula, fazendo movimentos circulares, das extremidades para o meio, de direções opostas. 
A oscilação de minC e minD vai diminuir durante a formação do septo e volta depois. O movimento mais forte de acumulo é dadoo pelo MinCD, mas a MinE também lidera esse movimento oscilatório, ela é um disparador.
- Replicação do DNA bacteriano: 
 No processo de replicação do dna, a célula realiza forquilhas de replicação, que é quando o dna forma bolhas, ele vai se abrindo em vários locais. Se o dna bacteriano não formasse várias forquilhas, se ele fosse so se abrir e a medida que fosse se abrindo ele vai consumindo uma nova fita, a célula ia demorar cerca de 1h, e agora leva 20 minutos. Por isso ela se divide rapidamente. 
Então, esse tempo de gerar a célula é bem rápido por conta da formação de múltiplas forquilhas de replicação ao longo do dna circular dele.
Microtubulos que participam do processo de divisão
Actina que vai ancorar e dar forma a membrana. Conjunto de proteínas que da sustentação a todo esse arcabouço 
Citoesqueleto bacteriano é um citoesqueleto primitivo.
Se a bactéria se mantém de uma forma de cocos ou espiroqueta ou bastão, por exemplo, quem dá essa forma, quem sustenta e quem ancora são o grupo de proteínas MreB (são análogas a actina, que são as que dão forma a membrana já que a bactéria não tem). Essas proteínas vão ancorar de tal forma permitindo que aquela forma da bactéria se mantenha mesmo durante e depois do processo de divisão bacteriana. Mesmo com o movimento oscilatório funcionando. 
Fts são análogas as tubulinas das nossas células.
Como essa bactéria vai crescer? A partir da formação do anel, e faixas na parede celular são formadas e crescem na direção da formação do anel ftsZ. Entao a partir disso, novos proteinosglicanos são adicionados a parede e por isso cresce. Septo além de estrangular e formar a divisão da parede, ela nucleia a formação de nova parede. Mais parede vai sendo construída no centro e vai empurrando.
Coisas que podem acontecer: (intercâmbio gênico) 
Transformação: bactérias podem inserir no seu material genético restos ou fragmentos de dna perdidos por outra células estouradas.
Conjugação: Seria um tipo de “reprodução sexuada”, você tem a formação de um indivíduo diferente através dessa troca de material genético. 2 bactérias onde há a formação do pili e a partir dele, plasmídeo saindo de uma e se inserindo na outra. Podem passar resistência de uma para outra através do plasmídeo.
Transdução: existem vários vírus que infectam bacterias, tem que inserir o dna deles no citoplasma da bactéria, mas bactéria não tem núcleo e vai parar direto no dna bacteriano. Quando os dnas virais se multiplicarem de forma absurda, eles vão conseguir romper a parede da bactéria liberando esses dna virais e vários vírus são liberados-disseminação viral.
Endosporos: produção de esporos quando em escassez e nutrientes.
- Com a compactação do DNA, o septo começa a isolar o DNA replicado e parte do citoplasma, ocorrendo o isolamento total. O septo, então, circunda a parte isolada formando o pré-esporo. A camada peptideoglicana irá se formar entre as camadas. Forma-se o revestimento do endósporo e a célula se rompe. O esporo é liberado da célula.
Tipos de meio de cultura:
Sólido (para isolamento de colônia de bactérias-1.5%); semi-sólido (para observação de motilidade) e líquido (para enriquecimento bacteriano). 
O meio de cultura é o alimento da bactéria, ele tem os nutrientes necessários para a célula. 
O realizado em sala de aula foi o meio sólido. O que confere o meio sólido é o AGAR (polissacarídeo complexo). Foi um meio indefinido, pois por mais que estejam medidos, não se soube ao certo o que tem dentro de cada um, as proteínas, aminoácidos e etc.
Tryptone, extrato de levedura, cloreto de sódio e AGAR.
28/03/2018
Crescimento bacteriano- fases
“A oferta de nutrientes é o principal fator que limita o crescimento bacteriano.”
Fase Lag: é a fase do reconhecimento, um período de adaptação com metabolismo alto, porém sem divisão celular. A duração dessa fase vai depender do meio de cultura.
Fase Log: Vai ocorrer uma rápida divisão celular, e as bactérias vão crescer de forma exponencial. É a fase onde tem mais disponibilidade de alimento. Vai ser uma reta cuja inclinação vai depender da velocidade da divisão dessas bactérias.
Fase Estacionária: Momento em que não tem tanto nutriente disponível e, com isso, a mesma quantidade de bactérias que morre é a mesma que nasce, havendo um equilíbrio.
Fase de declínio: As bactérias passam a morrer mais rápido que as que estão nascendo.
O que irá determinar o crescimento das bactérias são os fatores limitantes: Temperatura; Ph; Oxigenação e Salinidade. 
Você terá tipos diferentes de bactérias que terão algum desses fatores como limitante:
Temperatura> psicrófilas, mesófilas, termófilas e termofilas extremas
Ph> acidófilas e alcalofilas
Oxigenação> aeróbicas, anaeróbicas, microaerofilas, anaeróbicas facultativas e aerotolerantes.
Salinidade> bactérias halófilas