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Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas São unidades as quais ligadas entre si, dão origem as proteínas. Prof. (a)- Pâmella Souza Disc. Bioquímica Humana • Conhecer as unidades formadoras de uma proteína; • Identificar e reconhecer os aminoácidos; • Reconhecer os tipos de ligações existentes entre as unidades de aminoácidos; • Conhecer as estruturas de uma proteína; OBJETIVO Proteínas são as moléculas biológicas mais abundantes, ocorrendo em todas as células e em toda parte! Milhares de ≠ tipos podem ser encontradas em uma única célula! É a principal forma pela qual a informação genética se expressa! Luz= reação entre a luciferina e ATP. Queratina= componente estrutural • ENZIMAS E HORMÔNIOS: Catalisam e regulam as reações que ocorrem no organismo. MÚSCULOS E TENDÕES: Proporcionam ao corpo os elementos do movimento. PELE E CABELO: Oferecem revestimento externo. HEMOGLOBINA E ALBUMINA: Transporte de oxigênio e moléculas essenciais para a vida. ANTICORPOS: Meios de proteção contra doenças. As proteínas apresentam uma incrível diversidade de funções e, ainda assim, apresentam todas em comum a característica estrutural de serem polímeros de aminoácidos. Vamos descrever as propriedades dos aminoácidos- blocos constitutivos simples são unidos para formar as proteínas - as quais apresentam estruturas tridimensionais únicas - , tornando-as capazes de desempenhar funções biológicas específicas. • Proteínas são compostas por repetições de aminoácidos As proteínas são formadas a partir da ligação em sequência de apenas 20 aminoácidos (entre outros especiais), ligados covalentemente. Embora mais de 300 diferentes aminoácidos tenham sido descritos a partir de fontes naturais, apenas 20 deles são normalmente encontrados como constituintes de proteínas em mamíferos. • Molécula orgânica constituída por, um grupo amina, um grupo carboxílico e uma cadeia lateral R; Existem cerca de 20 aminoácidos presentes nas proteínas, sendo todos eles α-aminoácidos; α-aminoácidos: o grupo amina e o grupo carboxilo estão ligados ao mesmo carbono (carbono- α); Devido ao seu arranjo tetraédrico, os quatro grupos diferentes podem ocupar dois arranjos espaciais únicos e, portanto, os aa possui dois esterioisômeros. Estereoisómeros- Mesma fórmula de estrutura Diferente fórmula estereoquímica (os átomos assumem diferentes posições relativas no espaço). C3H7NO2 Classificação dos aa, dá- se, de acordo com sua cadeia lateral R Classificação quanto à: Polaridade (polar ou apolar) – determina a tendência para interagir com a água; Carga (positivo ou negativo) – propriedades ácido-base; Aromáticos; Aromáticas- contêm anéis benzênicos ou anéis de átomos similares; Alinfáticos- não contêm anéis aromáticos. Serina Treonina Cisteina Asparagina Glutamina Aminoácidos polares, não carregados. •Solubilidade intermediária em água (hidrofílico) contém grupos capazes de formar pontes de H+ com água •Serina e treonina Grupos hidroxil- participa da formação de pontes de H •Asparagina e glutamina Grupo amida e carbonila > •Cisteína Grupo sulfidrila Ligações dissulfeto Determina sua polaridade Aminoácidos apolares, alinfáticos e hidrofóbicos Glicina Alanina Prolina Valina Leucina Isoleucina Metionina• Ligações de Van der Waals •Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina Interações hidrofóbicas, estabilizando a proteína •Glicina Menor aminoácido, de estrutura simples •Metionina Possui átomo de enxofre (capaz de fazer ligações dissulfeto), possui um grupo tioéter •Prolina Iminoácido, menor flexibilidade estrutural Mantido em conformação rígidaV a n d e r W a a ls - s o m a d a s fo rç a s a tr a ti v a s o u re p u ls iv a s , (q u e n ã o s ã o lig a ç õ e s c o v a le n te s e n tr e m o lé c u la s o u fo rç a s d e v id o à in te ra ç ã o e le tr o e s tá ti c a d e ío n s . Aminoácidos apolares, alinfáticos e hidrofóbicos Único aa que possui um grupo imino, em vez de um grupo amino (H3N) A geometria única da molécula da prolina contribui para a formação da estrutura fibrosa do colágeno Aminoácidos carregados positivamente. Lisina Arginina Histidina • Aminoácidos básicos (Carga positiva)- são aceptores de prótons Lisina- segundo grupo amino Arginina- grupo guanidina Histidina- grupo aromático imidazol Aminoácidos negativos. Aspartato Glutamato •Aminoácidos ácidos (Carga negativa)- são doadores de prótons –Possuem segundo grupo ácido carboxílico Aminoácidos aromáticos. Fenilalanina Tirosina Triptofano • Aminoácidos hidrofóbicos • Tirosina- Forma pontes de hidrogênio com a água devido seu grupo hidroxil • Modificações pós-traducionais Fosforilação do OH da tirosina • Fenilalanina –Mais apolar • • Modificações pós-traducionais • 4-hidroxiprolina- derivado da prolina • Proteína da parede celular de vegetais e fibras do • tecido conjuntivo (colágeno) • 5-hidroxilisina- derivado da lisina Conjuntivo (colágeno) • 6-N-metil-lisina • Proteína contrátil do musculo- miosina • Gama-carboxiglutamato Proteína importante da cascata de coagulação- protrombina • Fosforilação de resíduos • Desmosina- derivado de 4 resíduos de lisina Proteína elastina • Selenocisteína Selênio ao invés de enxofre na Cisteina É adicionado durante a tradução por mecanismo específico e regulado • Sofrem uma reação ácido-base intramolecular e existem primariamente (pH fisiológico: 7,4) na forma de um íon dipolar, ou zwitterion (do alemão zwitter, “híbrido”) Tanto os aminoácidos livres quanto alguns aminoácidos combinados por meio de ligações peptídicas podem atuar como tampões. A relação quantitativa entre a concentração de um ácido fraco (HA) e sua base conjugada (A-) é descrita pela equação de Henderson-Hasselbalch. Derivação da equação Considere a liberação de um próton por um ácido fraco, representado por HA: HÁ H+ + A- (ácido Próton Base conjugada fraco) O "sal" ou a base conjugada, A-, é a forma ionizada de um ácido fraco. Por definição, a constante de dissociação do ácido, K., é: Então se isolarmos o pH, teremos a equação: • -Quanto > o Ka, mais forte o ác. -Quanto < o Ka, manos ác. foi dissociado Um tampão é uma solução que resiste a mudanças de pH quando se adicionam pequenas quantidades de ácido ou base. Um tampão pode ser produzido pela mistura de um ácido fraco (HA) com sua base conjugada (A-). A capacidade tamponante máxima ocorre quando o pH for igual ao pK., Sistema tampão do bicarbonato, a equação de Henderson- Hasselbalch prediz como mudanças na [HC03] e na pC02 influenciam o pH fisiológico. pCO2- ácido [HC03]- básico • Forma protonada Íon dipolar Forma desprotonada Equivalente de OH- adicionados • - São ligações covalenteas quais são ligações amida entre o grupo carboxila de um aminoácido e o grupo amino de outro, não são rompidas por condições desnaturantes, como aquecimento ou altas concentrações de uréia. Deve haver uma exposição prolongada a um ácido ou a uma base forte em temperaturas elevadas para hidrolisar essas ligações de forma não-enzimática. • Ligações peptídicas- são reações de condensação entre dois ou mais aa com a formação de uma molécula de água. Através das ligações peptídicas, o que pode acontecer ??? - A ligaçãopeptídica tem um caráter de dupla ligação parcial, isto é, é mais curta do que uma ligação simples e é rígida e planar. • Formação de di, tri, tetra, penta, oligo e polipeptídeo. Desta forma- a sequencia de aa unidos por ligações peptídicas constituem a estrutura primária das proteínas •Outras interações podem atuar na estrutura proteica e que também mantem a estrutura da mesma •Outras interações podem atuar na estrutura proteica e que também mantem a estrutura da mesma Interações hidrofóbicas e hidrofílicas entre as cadeias laterais dos aa • Realizada pela interação entre dois resíduos de cisteína de uma mesma cadeia ou de cadeias separadas • São também conhecidos como peptídeos bioativos; • São obtidos através de digestão das proteínas; • Podem apresentar diversas atividades biológicas: Regulação do processo fisiológico, Valor nutricional, Vasorreguladores, Fatores de crescimento, Indutores hormonais e Neurotransmissores. ORIGEM: Fonte de proteína alimentar, como a do leite humano e bovino (muito estudada) Principais peptídeos bioativos obtidos da hidrólise de proteínas do leite bovino e humano • Estrutura Primária • Dada pela sequência de aminoácidos e ligações peptídicas; • Nível estrutural mais simples e mais importante, pois dele deriva todo o arranjo espacial da molécula. • A estrutura primária resulta em uma longa cadeia de aminoácidos. com uma extremidade “amino terminal” e uma extremidade “carboxi terminal”. • Estrutura Secundária • É dada pelo arranjo espacial de aminoácidos próximo entre si na seqüência primária da proteína. • Ocorre graças à possibilidade de rotação das ligações entre os carbonos a dos aminoácidos e seus grupamentos amina e carboxila. • Estabilizado por pontes de H Assim, apresenta dois tipos estruturais α- hélice- em forma de espiral β- folha- em forma de zig- zag α-Hélice β-Folha Estrutura Terciária • Dada pelo arranjo espacial de aminoácidos distantes entre si na seqüência polipeptídica. • É a forma tridimensional como a proteína se “enrola”. • Ocorre nas proteínas globulares, mais complexas estrutural e funcionalmente. • Cadeias polipeptídicas muito longas podem se organiza em domínios, regiões com estruturas terciárias semi- independentes ligadas entre si por segmentos lineares da cadeia polipeptídica. São estabilizadas por: Pontes dissulfeto- Uma ponte dissulfeto é uma ligação covalente formada pelos grupos sulfidrila (-SH) de dois resíduos de cisteína lnterações hidrofóbicas Pontes de H Interações iônica- interações entre grupos + e -. Estrutura quaternária • Surge apenas nas proteínas oligoméricas. • Dada pela distribuição espacial de mais de uma cadeia polipeptídica no espaço, as subunidades da molécula, estas mantém-se unidas por força covalente, como pontes dissulfeto e ligações não covalentes (como pontes de hidrogênio, interações hidrofóbicas). • As subunidades podem atuar de forma independente ou cooperativamente no desempenho da função bioquímica da proteína • Resulta no desdobramento e desorganização das estruturas secundárias e terciárias, DETALHE: Sem que ocorra hidrólise das ligações peptídicas. • Agentes desnaturantes: Calor, solventes orgânicos, agitação mecânica, detergentes, íons ou matais pesados (chumbo ou mercúrio), ácidos ou bases fortes. • As proteínas podem recuperar sua estrutura, ou seja, a desnaturação pode ser reversível? • Sob condições ideais, sim. Quando o agente desnaturante for removido... • Entre tanto, em sua maioria, as proteínas, uma vez desnaturadas ficam alteradas. Sendo insolúveis e precipitam em solução. • O dobramento é um processo complexo de ensaio e erro; • Algumas vezes pode resultar em moléculas dobradas de forma imprópria; • As quais são marcadas e degradadas dentro da célula... • Entre tanto, o sistema de controle de qualidade não é 100% perfeito; • Desta forma agregados de proteínas com erro no dobramento podem ficar acumuladas...principalmente durante o envelhecimento... • Podendo essas proteínas com erro no dobramento, estar associadas algumas doenças • Por algum motivo, pode ocorrer o dobramento errado de uma proteína • E tal proteína assumir uma conformação única, levando a formação de feixes de proteínas fibrilares, constituídos de folha β • O acumulo desses agregados proteicos, de forma espontânea, denominados amiloides, tem sido associado a doenças degenerativas: Doença de Alzheimer • Doença de Alzheimer • O componente predominante que se acumula, é um peptídeo de 40 a 43 resíduos de aa, denominado de Aβ • O peptídeo quando agregado na forma folha β, torna- se neurotóxico, • Derivado da clivagem proteolítica da proteína precursora amiloide (proteína com único domínio transmembrana, expressa na superfície de células neurais) • Os agregados contendo o peptídeo Aβ forma uma placa amiloide no parênquima cerebral e ao redor dos vasos sanguíneos • Doença de príon • A proteína de príon (PrP) tem sido implicada como agente causador da encefalopatia espongiformes transmissíveis, ou DENÇA DA VACA LOUCA A proteína de PrP na forma infecciosa forma agregados fibrilares insolúveis Essa proteína se torna infecciosa por alteração na sua conformação tridimensional Essa alteração é fatal e até o momento não possui reversibilidade Atividade 1-Calcule o ponto isoelétrico (pI) da histidina. 2-Definição de aminoácidos essenciais e não essenciais. Quais são eles? 3-O que são e quais são aminoácidos incomuns nas células? Definir seus precursores. 4- Faça o peptídeo: Ala-Glu-Gly-Lys e indique onde é a extremidade aminoterminal e carboxterminal. 2-Definição de aminoácidos essenciais e não essenciais. Quais são eles? Um aminoácido essencial é aquele que o organismo considerado (normalmente, o humano) não é capaz de sintetizar mas é necessário para o seu funcionamento. Por tanto o não essencial é sintetizado pelo organismo. Essenciais Glutamina Glicina Prolina Tirosina Cisteína Serina Aspártico Não Essenciais Lisina Metionina Fenilalanina Treonina Triptofano Valina Histidina 3-O que são e quais são aminoácidos incomuns nas células? Definir seus precursores. São formados pela modificação de resíduos de aa existentes na cadeia polipeptídica após sua síntese. A hidroxiprolina e a hidroxilisina são produtos da hidroxilação da prolina e da lisina
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