Prévia do material em texto
1 Elementos Genéticos Móveis Cap. 9 – Biologia Molecular Básica, Zaha 5a edição Cap. 11 – Genética, um enfoque conceitual, Peirce 3ª edição Transposição • É a mudança de um segmento de DNA de um sítio para outro sendo que não existe similaridade de sequência envolvida no processo • Ocorrem tanto em procariotos como eucariotos • A transposição pode ser para o mesmo cromossomo, para outro cromossomo, para um plasmídio ou para um fago • O segmento de DNA neste processo é chamado de transposon ou elemento genético móvel Tipos de Transposons DNA RNA Transposons de DNA • Também chamado de Transposon de classe II • Existem tanto em procariotos como eucariotos • O transposon codifica proteínas que permitem que ele se transponha através de dois mecanismos diferentes: – O segmento DNA se move diretamente para uma nova região (mecanismo corta e cola ou transposição conservativa) – O segmento DNA se replica e se integra em outra região (mecanismo copia e cola ou transposição replicativa) Transposição Conservativa Corta E Cola Transposição Replicativa Copia E Cola 2 Transposons de DNA em Procariotos • Sequências de Inserção (IS – Insertion Sequence) • Transposons (Tn) – Compostos – Não-composto Sequências de Inserção (IS – Insertion Sequence) • São os transposons mais simples encontrados nos cromossomos e plasmídeos de bactérias • Codifica somente enzima transposase para mobilização e inserção • Tamanho: 768 bp to 5 kb • As extremidades dos IS possuem repetições terminais invertidas (IRs) Mecanismo De Inserção Do Elemento IS Sequências de Inserção Mecanismo De Inserção Do Elemento IS • O modelo de transposição é do tipo “cortar e colar” ou conservativo pois o número original de cópias se mantem constante • A transposição requer a transposase, codificada pelo elemento IS • A tranposição inicia quando a transposase reconhece os IRs • O sítio alvo de inserção é cortado • O elemento IS é inserido da região do DNA clivada • A DNA polimerase preenche a lacuna e a ligase sela 3 Transposons (Tn) • São semelhantes aos elementos IS mas são mais estruturalmente complexo e carregam genes adicionais • Existem 2 tipos de transposons: – Compostos – Não-composto Transposons Compostos • Transporta diferentes genes que são flanqueados por elementos IS • Tn10 tem 9.3 kb e possui 6.5 kb central que inclui gene para resistência a tetraciclina e 1.4 kb nas extremidades de elementos IS. • Elemento IS fornece a transposase e os sítios IRs Transposons Não-Compostos • Transporta diferentes genes mas não são flanqueados por elementos IS • Tn3 tem 5 kb com 38-bp ITRs e possui 3 genes: – bla (β-lactamase), tnpA (transposase), e tnpB (resolvase, cuja função é de recombinação). Mecanismo de Inserção do Tn3 Transposons de DNA em Procariotos • Seqüências de Inserção - IS • Transposons Compostos - Tn • Elementos Tn3 4 Transposons Autônomos e Não Autônomos • Transposons autônomos possuem os genes que codificam os produtos requeridos para transposição (transcriptases reversas ou transposases, por exemplo) e promover sua própria mobilização. • Transposons não autônomos não codificam proteínas para transposição, mas são capazes de se transpor, pois retêm as sequências necessárias para a transposição. Transposons de DNA em Eucariotos • Descobertos inicialmente no milho, por Barbara McClintock, em 1948 quando estudava a “variegação” (presença de zonas de coloração diferente) na semente do milho • Ela percebeu que inserções, deleções e translocações causadas pelos elementos móveis de DNA eram responsáveis pela variegação no milho (1902-1992) Prêmio Nobel de Medicina e Fisiologia 1983 “Pelas sua descoberta dos elementos genéticos móveis” “ Sistema Ac/Ds do Milho • O transposon Ac tem 4.563 bp com 11 bp ITRs e codifica transposase com 807 aa • O transposon Ds é derivado de Ac em decorrência de mutações internas no Ac • O transposon Dc não é autônomo pois o gene da transposase está deletando • O transposon Dc pode se movientar no genoma do milho se houver transposase sendo produzida pelo transposon Ac ITR ITR ITR ITR Excisão Somática de Ds do gene C Mutante Pigmentado (alelo C) Tipo Selvagem Colorido (alelo C) Mutante Descolorido (alelo c) Transposons em Eucariotos Classe I – Transposons de RNA Retrotransposons com LTR (ex: Ty, gypsy) Retroposons sem LTR (ex: LINEs, SINEs) Classe II – Transposons de DNA Tranposons (ex: elementos Ac e Ds em milho, elemento P em Drosophila) Classe III Elementos cujo mecanismo de transposição não é conhecido (ex: MITEs = miniature inverted repeat transposable elements) 5 Transposons de RNA em Eucariotos (LTR, de long terminal repeats) - longas repetições terminais Retrovírus X Retrotrasposons Transposons de RNA em Eucariotos • Existe somente em eucariotos • São semelhantes aos retrovírus • Eles se movem através de um intermediário de RNA • Codificam uma enzima com atividade transcriptase reversa • As novas cópias do DNA se integram em diferentes regiões do genoma Modelo de Retrotransposição Modelo de Retrotransposição Transposons em Eucariotos Classe I – Transposons de RNA Retrotransposons com LTR (ex: Ty, gypsy) Retroposons sem LTR (ex: LINEs, SINEs) Classe II – Transposons de DNA Tranposons (ex: elementos Ac e Ds em milho, elemento P em Drosophila) Classe III Elementos cujo mecanismo de transposição não é conhecido (ex: MITEs = miniature inverted repeat transposable elements) 6 Transposons de DNA em Eucariotos • A maioria dos transposons estão inativos • A frequência de mutações espontâneas devidos a retrotransposons em humanos é menos que 0,2% • Já em camundongos é 10% • Em Drosophila, 50 a 80% das mutações espontâneas são decorrentes de inserções de elementos transponíveis Significado Biológico dos Transposons • Os transposons causam mudanças genéticas e fazem importantes contribuições para a evolução dos genomas: – Inserção em genes – Inserção em sequências regulações e alteração da expressão gênica – Mutações cromossômicas – Geração de pseudogenes – Criação de novos genes Mutações causadas por Transposons Alteração da Expressão Gênica Mutações causadas por Transposons Alteração da Expressão Gênica Crossing Over Desigual 7 Mutações causadas por Transposons Crossing Over Desigual Entre Transposons em Cromossomos Homólogos Mutações causadas por Transposons Recombinação Cromossômica entre Cromossomos Não Homólogos Mutações causadas por Transposons Deleção Cromossômica Mutações causadas por Transposons Inversão Cromossômica Mutações causadas por Transposons Duplicação Gênica Integração do Plamídeo no Cromossomo Bacteriano por Recombinação Homóloga 8 Recombinação entre Elemento IS Entre Plasmídeos Distintos O Papel Dos Transposons Na Evolução Dos Genomas • A existência de sequências repetitivas aumenta a diversidade entre indivíduos e espécies. • Famílias Gênicas surgem a partir da duplicação ou divergênica de genes • Pseudogenes surgem a partir da enzima Transcriptase Reversa agindo no mRNA • Novos genes também pode surgir através do embaralhamento dos exons Embaralhamento de Exons • Embaralhamento exon é um mecanismo molecular para a formação de novos genes. • É um processo através do qual dois ou mais exons de diferentes genes podem ser reunidos ectopicamente, ou o mesmo exon pode ser duplicado, para criar uma nova estrutura exon-intron• Mecanismos: – Crossing over desigual entre regiões repetitivas Fator de crescimento Epidérmico com múltiplos exons EGF EGF EGF EGF EGF F F F F Fibronectina com múltiplos exons F K K K EGF F Plasminogênio com exon “kringle” Embaralhamento de Exon Duplicação de Exon Gene do Ativador do tecido plasminogenico Embaralhamento de Exon Significado Biológico dos Transposons Hipótese do DNA egoísta • Eles não têm nenhuma finalidade para a célula; eles existem simplesmente porque são capazes de se replicar e se espalhar Hipótese da variação genética • Eles fornecem meios para a mudança e variação genômica especialmente em resposta ao estresse (hipótese de McClintock) Hipótese da função celular • Eles servem para várias funções valiosas dentro da célula, tal como o controle da expressão gênica ou a regulação do desenvolvimento. 9 Regulação da Transposição • Em células que tem pouco transpososns a transposiç̧ão é frequente. À medida que o número de cópias do elemento de transposição aumenta, a frequência de transposição diminui • A regulação pode ser feita limitando a produção da enzima transposase • Outra hipótese: para minimizar efeitos deletérios da transposição, os organismos desenvolveram, no decorrer da evolução, vários mecanismos para a regulação ou silenciamento dos elementos de transposição. – a metilação do DNA, – a modificação de histonas – a interferência por RNA.