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Proteínas UNIVERSIDADE CEUMA CURSO DE FARMÁCIA Elyjany Morais Lima Sena Me. Ciências da Saúde elysinha29@hotmail.com Proteínas • Definição – Macromoléculas constituídas por unidades (monômeros) chamadas de aminoácidos. Aminoácidos • Ligação pepitídica – Grupo amino + grupo carboxila – Reação síntese por desidratação (liberação de molécula de água) Aminoácidos • As proteínas são formadas por 20 aminoácidos. • Tipos básicos – Naturais – o organismo é capaz de sintetizar – Essenciais – o organismo não é capaz de sintetizar. Proteínas • As proteínas diferem uma das outras pela: – Ordem dos aminoácidos – Tipo dos aminoácidos – Número do aminoácidos CLASSIFICAÇÃO • Proteínas simples – Somente aminoácidos • Proteínas conjugadas (proteínas ligadas a outras substâncias) – Nucleoproteínas – Glicoproteínas – Metaloproteínas – Lipoproteínas Atividade Biológica • Anticorpos • Estrutural • Hormonal • Enzimática Quimiotripsina, um enzima proteolítica (proteína globular) Glicina (o menor aminoácido) Tamanho e Forma Cada proteína tem um tamanho e uma forma bem característico O tamanho e a forma de duma proteína estão intimamente ligados à sua função 0,5 nm 75Da 3,5nm 21.600Da 241 aminoácidos As dimensôes de uma molécula são medidas em: TamanhoNanômetros (nm):1nm=10-9metro Massa Kilodaltons (KDa) 1KDa=103Da Características estruturais da ligação peptídica Formas de ressonância da ligação peptídica A ligação peptídica tem um caráter de ligação dupla Não há rotação no eixo da ligação peptídica Os átomos de O,C,N e H ocupam o mesmo plano O e H assumem conformação trans A ligação peptídica forma um dipolo Plano da ligação peptídica Hélice a Modelo de bola e bastão visto de lado Modelo de bola e bastão visto de cima Modelo de preenchimento espacial visto de lado Representação somente dos carbonos a Pontes de H entre os O e os H das ligações peptídicas Grupos R posiciona- dos na parte externa Cada resíduo de aminoácido interage com o 4º de sua cadeia A Helice a é um dipolo O dipolo da ligação peptídica é transmitido ao longo da hélice A hélice inteira passa a se comportar como um dipolo A extremidade amino terminal adquire polaridade d+ A extremidade amino terminal adquire polaridade d+ Folhas b Antiparalela Paralela As pontes de H entre os O e os H das ligações péptidicas estabilizam a estrutura A os grupos R se localizam fora do plano da folha para cima e para baixo alternadamente A folha apresenta um pregueamento de ~7A (0,7nm) Voltas b Tipo I Tipo II Apresenta resíduo de prolina (cis) na posição 2 Apresenta resíduo de glicina na posição 3 Pontes de H entre a carboxila do resíduo na posição 1 e o H da amina do resíduo na posição 4 estabilizam as estruturas Estrutura do cabelo O cabelo é formado pela proteína queratina 100% hélice a Aproximadamente 32 moléculas de queratina Hierarquia estrutural 1. Hélice 2. Duas hélices enroladas 3. Protofilamento 4. Protofibrila 5. Filamento intermediário 6. Células (queratinócitos) 7. Fio de cabelo Estrutura do Colágeno Hélice de colágeno Modelo de bola e bastão Modelo de preenchimento Os resíduos de glicina (vermelho) ocupam o centro da superhélice de colágeno O colágeno tem estrutura primária repetitiva Gly—X—Pro ou Gly—X—HO-Pro Possui estrutura secundária helicoidal Anti-horária 3 resíduos por volta Forma estrutura quaternária com três hélices associadas chamada superhélice. Superhélice de colágeno Estrutura da fibrilas de colágeno 300nm 1,5nm fibrilas de colágeno fibrilas de colágeno Moléculas de colágeno alinhadas Forma escalonada Ligações cruzadas Padrão de escalonamento e ligações cruzadas varia de tecido para tecido Padrão estriado ao ME (depende das ligações cruzadas e do escalonamento) Molécula de colágeno Estrutura da fibroína Teia sendo formada nas glândulas fiandeiras de uma aranha Folhas b antiparalelas Várias camadas “empilhadas” Cadeias laterais de Ala Cadeias laterais de Gly Proteína da seda e das teias de aranha Formada por folhas b empilhadas Resíduos de Ala e Gly se intercalam de modo a fazer um encaixe entre as folhas Um fio de seda é mais resistente do que um fio de aço da mesma espessura Formas de representar a estrutura de uma proteína Grupo heme (vermelho) Representação em fita Representação de superfície Representação em fita incluindo cadeias laterais Modelo de preenchimento espacial (esferas de van der Walls) Aminoácidos hidrofóbicos (em azul) mioglobina Como a estrutura secundária influência nas dimensões da proteína Quais são as dimensões de uma proteína de 585 aminoácidos e 64,5KDa? Caso ela adquira a conformação b totalmente estendida Caso ela adquira a conformação de hélice a totalmente estendida Caso ela adquira conformação enovelada Soroalbumina Grupamentos Prostéticos: o heme Presente na: •Hemoglobina •mioglobina •Citocromos •Dioxigenases Composto por: •Protoporfirina IX •Ferro (Fe2+) propionatos metilas vinilas Na hemoglobina e na mioglobina Resíduo do aminoácido histidina Molécula de oxigênio Heme Estrutura da molécula de heme (ferroprotoporfirina IX) Troponina Domínios estruturais Uma proteína pode ser formada por várias regiões estruturais (domínios) Cada região pode ter uma atividade catalítica ou função diferente No exemplo ao lado vemos a troponina C, uma proteína formada por uma única cadeia polipeptídica mas que se enovela na forma de dois domínios globulares (A e B) unidos por uma estreita região (dobradiça) Domínio A Domínio B dobradiça Motivos estruturais Alça b-a-b Barril a/b Como motivos estruturais podem se associar para formar estruturas maiores O barril a/b é formado por várias repetições em seqüência de alças b-a-b O barril a/b é um domínio da enzima glicolítica piruvato cinase Padrões de dobramento estáveis em proteínas Folha b Folha b cruzada (não observada) Padrões em zigue-zague Padrões circulares Sentido horário Sentido anti-horário (muito raras) Folha b torcida As proteínas podem assumir determinados padrões de dobramento Alguns padrões são mais freqüentes, outros mais raros outros, embora sejam possíveis nunca foram observados Capsídeos virais Capsídeos virais são estruturas protéicas que envolvem o material genético em todos os vírus São compostos por muitas cópias de uma ou poucas proteínas Costumam apresentar formas geométricas simples e simetria Formato de bastão Simetria helicoidal Dimensões: 300x18nm 300nm 18nm proteína RNA Vírus do mosaico do tabaco Formato esférico Simetria icosaédrica 30nm de diâmetro 30nm Poliovírus proteína icosaedro Pode ser causada por Agentes físicos Calor Agentes químicos pH Agentes redutores: (2-mercaptoetanol) Desnaturação é a perda da conformação Ocorre de forma abrupta Desnaturação de proteínas 4 pontes dissulfeto Cataliticam ente ativa Pontes dissulfeto desfeitas Cataliticamente inativa Ribonuclease A d es en o ve la d a n at iv a ChaperonasFormação de agregados amilóides Placas amilóides estão presentes no cérebro de portadores de doenças como o mal Alzheimer e o “mal da vaca louca” As placas amilóides são estruturas ricas em folha beta u Uma proteína se desenovela parcialmente expondo regiões de folha b v As regiões de várias proteínas semi- desnaturadas se associam formando um agregado w O agregado amilóide aumenta indefinidamente de tamanho, incorporando cada vez mais proteínas semi-desnaturadas
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