9Genomica

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Genômica
É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz
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Genômica
Genômica estrutural: caracteriza a natureza física dos genomas. É o sequenciamento de DNA.
Genômica funcional: caracteriza o transcriptoma, ou seja toda a gama de transcritos produzidos por um determinado organismo (compara cDNA com o DNA).
Proteoma: caracteriza toda a gama de proteínas codificadas 
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Projetos genômicos: aplicações práticas
Compreensão dos princípios do design dos organismos
Descoberta de novos genes
Descoberta do controle gênico de doenças
Elucidação dos processos evolutivos
Elaboração de técnicas de diagnósticos de doenças 
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Visão geral da genômica estrutural
Mapa cromossômico em níveis crescentes de resolução
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Marcadores genéticos e como são obtidos
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Fazendo uma biblioteca de DNA
Animação do CD
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Avaliando polimorfismos
A coleta do DNA
A coleta e a extração do DNA
	http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/extraction/
Fazendo gel de eletroforese
	http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/
	http://br.youtube.com/watch?v=qMxQ-65qYDk&feature=related
DNA figerprint 	http://br.youtube.com/watch?v=PSwlCk_Z02c&NR=1
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Fazendo cópias de uma sequencia de DNA
	Clonagem em plasmídeo
http://br.youtube.com/watch?v=acKWdNj936o&NR=1
PCR - síntese enzimática in vitro de milhões de cópias de um segmento específico de DNA, através de amplificação em ciclos, na presença da enzima DNA polimerase
http://br.youtube.com/watch?v=_YgXcJ4n-kQ&feature=related
E para se divertir aprendendo...
http://www.youtube.com/watch?v=gNNI19l1LW8
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Avaliação de polimorfismos
DNA figerprint 	http://br.youtube.com/watch?v=PSwlCk_Z02c&NR=1
RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA = DNA polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma variação do protocolo da PCR com duas características distintas: utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória
SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism = polimorfismos de comprimento de sequencias curtas)
Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)
Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)
RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) - Envolve a clivagem do DNA por enzimas de restrição, a separação por eletroforese, em gel de agarose ou poliacrilamida, dos fragmentos gerados na clivagem e sua visualização em forma de bandas. PCR e RFLP são muito utilizados nas pesquisas de variabilidade genética de populações
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SSLP - Minisatélites
(repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)
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Aplicação forense de polimorfismo como minisatélites 
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SSLP – Microsatélites
(repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)
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RAPD
(utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória)
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Sequenciamento do DNA
O método Dideoxi
http://br.youtube.com/watch?v=f1ifyEJ2Gjs&NR=1
Sequenciamento automático com corantes fluorescentes
http://br.youtube.com/watch?v=oYpllbI0qF8&feature=related
http://br.youtube.com/watch?v=ezAefHhvecM
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