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Introdução a Microbiologia Eliana Barreto Bergter Farmácia- Microbiologia Geral- 2015 O que é Microbiologia? E o que é um microrganismo? - É um organismo unicelular microscópico. - Os m-os distinguem-se das células de organismos macroscópicos, como vegetais e animais pois são capazes de viver de forma independente na natureza. - Os m-os realizam seus processos vitais de crescimento, geração de energia e reprodução, independentemente de outras células. O que é uma célula? É a unidade básica dos seres vivos. Quais as características dos seres vivos? 1. Metabolismo Incorporação de nutrientes do meio ambiente, transformação destes nutrientes dentro da célula eliminação de compostos não utilizados para o ambiente. A célula é um sistema aberto. 2. Reprodução (crescimento) Os nutrientes absorvidos do ambiente são utilizados na síntese de novas células , a partir das pré-existentes 3. Diferenciação Formação de uma nova estrutura celular, como um esporo, como parte do ciclo de vida celular. 4. Comunicação As células se comunicam ou interagem através de substancias químicas liberadas ou incorporadas por elas 5. Movimento Os organismos vivos são capazes de se movimentar ( propulsão) 6. Evolução As células contem gens que podem evoluir, conferindo novas propriedades biológicas as células. As árvores filogenéticas mostram as relações evolucionárias entre as células Principais componentes celulares e estruturas "chave" de uma célula Macromoléculas Proteínas Acidos nucleicos Lipídios Polissacarídios Estruturas "chave“ Membrana citoplasmática Ribosomas Citoplasma Núcleo Hieraquia estrutural na organização molecular de uma célula . Todos os organismos vivos são constituídos de células. . As células podem ser procarióticas ou eucarióticas. . As células são as unidades estruturais e funcionais de todos os organismos vivos. . As células compartilham certas caracteristicas estruturais como membrana celular, citoplasma, ribosomas e núcleo. . As estruturas celulares são formadas por biomoléculas. Hierarquia estrutural na organização celular A Microbiologia abrange 2 temas principais: 1.O entendimento dos processos básicos da vida. 2. A aplicação do nosso conhecimento sobre a microbiologia para o benefício da humanidade. Como nasceu a Microbiologia ? Antonie van Leeuwenhoek em 1684, observou os microrganismos pela primeira vez. Como os microorganismos foram observados pela primeira vez.... ... e quantas formas diferentes... Diversidade microbiana na natureza Microrganismos e seus ambientes naturais • População microbiana: associação de m-os. • Habitat: local no ambiente onde uma população microbiana vive • Comunidades microbianas: local onde a população vive e interage entre si. • Ecologia microbiana: estudo dos m-os nos seus habitats naturais Comunidades microbianas Onde se encontram os microrganismos entre os seres vivos? Através da análise do rRNA 16-18S, os seres vivos foram distribuídos em 3 domínios principais Árvore filogenética dos seres vivos, mostrando os 3 domínios da vida Dois padrões estruturais de células são reconhecidos: Células procarióticas e Células eucarióticas Qual a diferença fundamental entre elas? Célula procariótica Célula eucariótica Estrutura interna de células (procariótica e eucariótica) E os microrganismos? São procariotos ou eucariotos? Aspergillus flavus- fungo Trypanosoma cruzi - protozoário Microrganismos eucarióticos Microrganismos procarióticos Escherichia coli - bactéria Staphylococcus aureus - bactéria Qual a importȃncia dos microrganismos? "O papel dos infinitamente pequenos na natureza é infinitamente grande“ Louis Pasteur Os microrganismos estão em todo lugar na biosfera e sua presença afeta o ambiente onde eles crescem. Os efeitos dos microrganismos no ambiente podem ser benéficos ou maléficos, como agentes de várias doenças. Microrganismos e as doenças 1900 2006 Principais causas de morte (EUA) e taxas de mortalidade As atividades benéficas dos m-os são derivadas de suas atividades metabólicas no ambiente, suas associações com plantas e animais e seu uso na produção de alimentos e nos processos biotecnológicos. O efeito mais significativo dos microrganismos na terra é a sua capacidade de reciclar os elementos carbono, oxigênio e nitrogênio, que compõem todos os seres vivos através dos ciclos biogeoquímicos. Microrganismos e os ciclos geoquímicos Ciclo do carbono e do oxigênio na natureza Microrganismos e a agricultura Algumas bactérias fixam o nitrogênio em associação simbiótica com plantas. Outras bactérias que fixam o nitrogênio se encontram livres no solo e em “habitats” aquáticos. Ciclo do nitrogênio Fixação simbiótica de nitrogênio Bactéria associada às raízes das plantas leguminosas ( - ) bactéria ( +) bactéria nódulos Resultado da fixação : aumento da fertilidade do solo Fixação de nitrogênio Proteína Acido nucleico Bactérias Fungos Por que os ruminantes ( boi, vaca, ovelha) conseguem se alimentar de capim ao contrário dos seres humanos? Microrganismos e a produção de energia: Biocombustíveis Biodiesel: produção a partir de óleos vegetais. Onde participam os microrganismos ??? Esquema geral da produção de biodiesel Reação de transesterificação entre triacilglicerol e álcool, gerando biodiesel e glicerol Quem produz mais etanol ??? Produção de biodiesel usando lipases extraídas de microrganismos Biologia da bioconversão da energia solar em biocombustíveis Métodos usados na produção de biocombustíveis A. Via clássica de produção de biocombustíveis, como etanol B. Fotossíntese bacteriana, produção de açúcares e uso destes açúcares por m-os para produção de biocombustíveis. C. Fotossíntese e produção de açúcares por um único microrganismo. D. Obtenção de E por fontes renováveis e uso desta E para a produção de biocombustíveis. Microbe, 8: 59, 2013 Microrganismos e o meio ambiente : bioremediação Bioremediação : o uso de bactérias , fungos e plantas na degradação de compostos químicos tóxicos que se acumulam no ambiente - Poluentes naturalmente encontrados no ambiente , mas presentes em alta concentração. - Óleo bruto - Óleo refinado - Fosfatos - Metais pesados Quais são os contaminantes do ambiente? - Xenobióticos – compostos sintéticos que nunca existiram no ambiente. - Pesticidas - Herbicidas - Plásticos Degradação aeróbica do composto Degradação anaeróbica do composto Biotecnologia e a recuperação de obras de arte Resultado do processo de biolimpeza e biorestauração de um afresco do século XIV ( Camposanto, Pisa) através do uso de P.stutzeri + protease Antes Protease 10-15h Conclusões: Uma técnica nova e bem sucedida para recuperação de afrescos usando bactérias vivas e enzimas (P.stutzeri, proteases, colagenases). Vantagem: baixo custo quando comparado com as técnicas convencionais. Impacto do estudo: Novas biotecnologias utilizando técnicas suaves (‘softs”) para a “biolimpeza” e “biorestauração” de heranças culturais estão em constante demanda e os resultados mostraram que os objetivos foram alcançados. A técnica pode ser utilizada para outros fins. Microrganismos e a biotecnologia Produção de biosurfactantes São moléculas anfifílicas ( porção hidrofílicae porção hidrofóbica) que interagem na interface de sistemas aquosos e não aquosos. O efeito dos surfactantes nestes sistemas são: redução da tensão superficial, emulsificação, formação de espuma e depende da estrutura exata das moléculas individuais. O que são surfactantes? São moléculas produzidas por microrganismos epodem ser classificadas em moléculas de baixo peso molecular ( glicolipídios, lipopeptídios e flavolipídios) e de alto peso molecular ( polissacarídios, proteínas, lipopolissacarídios e lipoproteínas). E biosurfactantes? Current Opinion in Biotechnology, Volume 30, 2014, 66 - 72 Biosurfactantes Estruturas de biosurfactantes SoforolipídioRamnolipídio Substratos utilizados para a produção de biosurfactantes Biosurfactante Microrganismo Importância econômica Trealose lipidios Rhodotorula erythropolis, Mycobacterium sp, Nocardia erythropolis, Arthrobacter sp Dissolução de hidrocarbonetos Ramnolipídios Pseudomonas aeruginosa, P.chlororaphis, Serratia rubidea Bioremediação, propriedades anti- microbianas e biocontrole Diglicosil diglicerídios Lactobacillus fermentum Bioremediação Liposan Candida tropícalis Bio emulsificante Microrganismos produtores de biosurfactantes Limpeza de materiais contaminados por óleos – Bioremediação Ex: Uso do Geobacillus, um bacilo termofílico que não produz biosurfactante. Vantagem do Geobacillus: presente praticamente em todo os solos em estado dormente. Com o aumento da temperatura se torna ativo e compete efetivamente com os outros microrganismos do solo. Para aumentar a taxa de degradação dos hidrocarbonetos biosurfactantes são adicionados ao sistema. Aplicações ambientais dos biosurfactantes Aplicação dos biosurfactantes na indústria do petróleo Técnica de recuperação de óleo (MEOR) Uso de uma preparação bruta de biosurfactantes ou uma cultura morta de microrganismos para liberar o óleo bruto de um determinado local. Etapas na recuperação de óleo dos poços 1. Recuperação primária: produção sob pressão natural e caraterísticas fluidas do óleo cru até 15% do óleo presente. 2. Substâncias incluindo injeção de CO2, polímeros surfactantes alcalinos, solventes para uma retirada de15-20% do óleo. 3. Recuperação terciária ou aumento da recuperação do óleo (EOR): o óleo remanescente é extraido após as 2 etapas acima, porém o processo não é econômico. Recuperação de mais de 10% do óleo no poço, através da utilização de microrganismos e/ou seus produtos finais do metabolismo para a recuperação do óleo residual que fica retido no poço devido a baixa permeabilidade de alguns reservatórios ou a alta viscosidade resultante da baixa mobilidade. O MEOR leva a uma redução da viscosidade do óleo pela quebra parcial das moléculas presentes no óleo. Quais as vantagens do MEOR ? Esquema do processo MEOR, usando biosurfactantes Vantagens dos biosurfactantes: Potencial produção a partir de fontes renováveis de baixo custo. Os biosurfactantes mais promissores atualmente são os glicolipídios, como os soforolipídios produzidos pelo gênero Candida, os manoeritritol lipídios (MELs) produzidos pelo gênero Pseudozyma e os ramnolipídios produzidos por Pseudomonas. Desvantagens: Atualmente, alto custo de produção, devido ao uso de meios de cultura sintéticos. Como resolver este problema: usar substratos baratos como óleos vegetais, melaço, gordura animal, resíduos das destilarias e indústrias de laticínios, etc. Microrganismos e a biotecnologia Organismos geneticamente modificados Produção de insulina Microrganismos e os alimentos Desde a idade antiga os microrganismos já eram utilizados pelos egípcios para a produção de pão, cerveja e vinho. Microrganismos e a produção da cerveja e do vinho Microrganismos e a produção de queijos e yogurtes Bactérias Funções Produto Propionibacterium shermanii Aroma e formação de furos Queijos suiços Lactobacillus bugaricus Lactobacillus lactis Acidez e aroma Yogurt, kefir, koumiss, Swiss, Emmental, and Italian cheeses Lactobacillus helveticus Acidez e aroma Yogurt, kefir, koumiss, Swiss, Emmental, and Italian cheeses Streptococcus thermophilus Acidez Emmental, Cheddar, and Italian cheeses, and yogurt Streptococcus diacetilactis Acidez Sour cream, ripe cream, butter, cheese, buttermilk and starter cultures. Streptococcus lactis Streptococcus cremoris Acidez Sour cream, cottage cheese, all types of foreign and domestic cheeses, and starter cultures. Streptococcus durans Streptococcus faecalis Acidez e aroma Soft Italian, cheddar, and some Swiss cheeses. Fermentação lática Probióticos São microrganismos incorporados em alimentos, bebidas ou como suplementos nutricionais com a finalidade de melhorar a saúde humana. Os microrganismos mais comumente usados são do gênero Lactobacillus e Bifidobacterium. O que são probióticos? Determinantes da eficácia dos probióticos Papel dos probióticos Microrganismos e o controle biológico O que é controle biológico? É o uso de antagonistas naturais para combater pragas ou doenças e plantas , como uma alternativa ao uso de pesticida químicos. Microbioma do solo Quais os microrganismos candidatos para o uso como agentes de controle biológico? Bactérias que formam esporos, possuem grande vantagem. Por que? 1. Produzem diferentes compostos com atividade inseticida e antimicrobiana. 2. Induzem crescimento e respostas de defesa em plantas. 3. Pela presença de esporos, resistem às condições adversas do meio e permitem a formulação e armazenamento de produtos comerciais. Bacillus thuringiensis – o primeiro biopesticida A endotoxina ou proteína Cry, sintetizada durante a esporulação, apresenta propriedades inseticidas. Esta molécula tem como mecanismo de ação a formação de poros transmembrana ou canais iônicos levando a lise osmótica. Formulações comerciais baseadas nos biofungicidas produzidos por Bacillus Utilização de pesticidas, fungicidas e compostos estimuladores do crescimento de plantas produzidos por espécies do gênero Bacillus Compostos das famílias de lipopeptídeos produzidos por espécies de Bacillus Lipopeptídeos produzidos pelo Bacillus e o controle biológico de doenças de plantas Como espécies de Bacillus promovem o crescimento e protegem as plantas das infecções por bactérias patogênicas e fungos e nematóides? Através da secreção de compostos antimicrobianos pelas espécies de Bacillus + a resistência sistêmica induzida pela planta ( em resposta ao Bacillus), aumentando a capacidade da planta de resistir a vários patógenos. Nature Rev.Microbiol., 11:158, 2013 Cronologia das principais descobertas da Microbiologia Microbiologia como uma ciência biológica básica, fornece: -Um conhecimento sobre as bases química e física da vida, através de estudos com os m-os. Estes compartilham várias características com as células de organismos multicelulares. e utiliza, - O crescimento de células microbianas em meios de cultura artificiais, atingindo altas densidades e fornecendo material para os estudos bioquímicos e genéticos. Estes estudos tornam os m-os excelentes modelos para o entendimento dos processos celulares que ocorrem nos organismos multicelulares, incluindo os seres humanos. Próxima aula: Olhando as estruturas celulares - Quais as estruturas presentes em uma célula bacteriana? - Quais as funções destas estruturas ? -Como as células bacterianas diferem das células de plantas e de animais?
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