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09/08/2018 1 BIOQUÍMICA DOS AMINOÁCIDOS Estácio Disciplina: Fundamentos de Bioquímica DEFINIÇÃO: • São moléculas orgânicas formadas por C, O, H e N, alguns possuem S. • Somente 20 são normalmente encontrados em proteínas. 09/08/2018 2 ESTRUTURA BÁSICA Nota: As abreviaturas de uma letra iniciam com a mesma letra do respectivo aminoácido. Quando os nomes de vários aminoácidos iniciam-se com a mesma letra, utilizam-se os nomes fonéticos (ocasionalmente em outras línguas) de certos aminoácidos. Tabela 3.1 Nomes e Abreviaturas dos Aminoácidos Comuns Aminoácido Abreviatura de três Letras Abreviatura de uma Letra Alanina Ala A Arginina Arg R Asparagina Asn N Ácido aspártico Asp D Cisteína Cys C Ácido Glutâmico Glu E Glutamina Gln Q Glicina Gly G Histidina His H Isoleucina Ile I Leucina Leu L Lisina Lys K Metionina Met M Fenilalanina Phe F Prolina Pro P Serina Ser S Treonina Thr T Triptofano Trp W Tirosina Tyr Y Valina Val V 09/08/2018 3 Classificação (naturais e essenciais / cadeias laterais polares e apolares) OS AMINOÁCIDOS Glicina não tem isomeria óptica Carbono alfa • O carbono α dá origem a duas formas de imagem especular não-superpostas: estereoisômeros. • Os dois estereoisômeros: - L:laevus = esquerda - D:dexter = direita 09/08/2018 4 Quase todos os compostos biológicos com centro quiral ocorrem naturalmente em apenas uma forma estereoisomérica, D ou L Os aminoácidos nas moléculas proteicas são sempre L-estereoisômeros. Os D-aminoácidos foram encontrados apenas em pequenos peptídios que têm função de antibiótico (ex. na gramicidina S, antibiótico produzido pela bactéria Bacillus brevis) 09/08/2018 5 GRUPO R APOLAR • Essa cadeia não apresenta capacidade de doar ou receber e-. • Forma: ligação covalente. • Não forma: ligações iônicas e pontes de hidrogênio. • AA: alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, triptofano e metionina. GRUPOS R POLARES, NÃO CARREGADOS Não apresentam carga em pH neutro. • Podem participar da formação de pontes de hidrogênio e dissulfeto. • AA: serina, treonina, tirosina, cisteína, glutamina e asparagina. 09/08/2018 6 CADEIA LATERAL ÁCIDA Presença de carboxila na cadeia lateral. • Possuem grupo carboxila carregado negativamente: COO- em pH neutro. • AA: ácido glutâmico e ácido aspártico. CADEIA LATERAL BÁSICA • Em pH fisiológico (neutro) as cadeias laterais encontram- se completamente ionizadas, com carga positiva. • AA: histidina, lisina e arginina. 09/08/2018 7 • Thr, Phe, Lys, Trp, Val, Met, Leu, Ile, His ESSENCIAIS O organismo humano não é capaz de produzi-los, e por isso é necessária a sua ingestão através dos alimentos para evitar a sua deficiência no organismo. 09/08/2018 8 São os que o organismo consegue sintetizar na quantidade ideal em condições normais, mas, em algumas condições metabólicas, como trauma, ou na fase de desenvolvimento, há a necessidade de se aquisição desses aminoácidos pela dieta por aumento da demanda • Tyr e Cys CONDICIONALMENTE ESSENCIAIS ou SEMIESSENCIAIS • Gly, Ala, Pro, Ser, Asn, Gln, Arg, Asp, Glu NÃO ESSENCIAIS São aqueles que o próprio organismo produz em quantidades suficientes, independentemente de sua condição fisiológica. 09/08/2018 9 AMINOÁCIDOS ESPECIALIZADOS E AMINOÁCIDOS PRECURSORES IMPORTANTES • A histamina é derivada da histidina (importante para o crescimento e regeneração de diversos tecidos) • A tirosina é precursor dos hormônios tiroxina (importante hormônio tireoidal), epinefrina (efeito antiasmático, vasopressor e estimulante cardíaco) e da melanina (pigmento com função de nos proteger dos raios UVA e UVB) • A glutationa, cuja função é proteger os globos vermelhos de danos oxidativos, é derivado de um aminoácido muito especial, o glutamato. • Já o óxido nítrico (molécula sinalizadora) é iniciada a partir da arginina. (L-arginina) • Os aminoácidos BCAA (cadeia ramificada) compõem-se de Isoleucina, Leucina e Valina (construção e aumento de energia dos músculos). • PROTEÍNAS PODEM SER SEPARADAS E PURIFICADAS POR CROMATOGRAFIA Sabendo que a célula possui milhares de proteínas, como purificar uma única delas? Basta selecionar por propriedade Tamanho, carga e propriedades de ligação Obter o extrato bruto “correr” em cromatografia de coluna Fase estável (matriz) Fase móvel (solução com tampão) Coluna maior permite maior resolução na separação 09/08/2018 10 ELETROFORESE Movimento de partículas dispersas num fluído sob influência de um campo elétrico uniforme DNA, carga negativa Tem tendência a se dirigir ao polo positivo quando sujeito a um campo elétrico Serve para separar moléculas por tamanho/carga elétrica Proteína deve ser desnaturada com detergente (SDS) Técnica utilizada à exaustão em trabalhos de biologia molecular ELETROFORESE, ETAPAS 1. Preparação do gel 2. Aplicação das amostras 3. Eletroforese 4. Coloração 5. Análise dos resultados 09/08/2018 11 APLICAÇÃO DAS AMOSTRAS Definição do mapa das amostras por canaleta CORRIDA DO GEL Aplicação do campo elétrico Fonte elétrica gera fluxo de íons através da solução tampão Terminais positivo e negativo Tempo adequado, senão o DNA sai do gel 09/08/2018 12 ELETROFORESE DE UM RESULTADO DE CROMATOGRAFIA ESTUDO DIRIGIDO 1. Descreva a estrutura geral dos aminoácidos. 2. Qual a principal função dos aminoácidos? 3. Qual a diferença entre D e L aminoácidos? 4. Como são classificados os aminoácidos de acordo com a natureza química dos grupos R? 5. O que são aminoácidos essenciais, não essenciais e semiessenciais ? 6. Cite quais são os aminoácidos essenciais e não essenciais. 7. Qual a técnica utilizada para purificar proteína? 8. Qual a técnica utilizada para analisar a purificação proteica?
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