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Enzimas Prof. MSc. Nina Rocha Dutra • Catalisadores biológicos: substâncias de origem biológica que otimizam as reações químicas. • O metabolismo funciona principalmente através de vias metabólicas (sequências ordenadas de reações). • As enzimas controlam cada etapa das vias metabólicas, permitindo que o metabolismo se adapte a mudanças. • A maioria das enzimas são proteínas, mas existem também moléculas de ácido ribonucleico (RNA) cataliticamente ativas chamadas ribozimas. Cada traço representa uma enzima Enzimas Mapa metabólico (substrato) A (produto) B enzima A B Enzima inativada Reação catalisada por Enzima • Enzimas são capazes de reunir os reagentes (substratos) dentro de seu centro ativo. • No centro ativo, os substratos ficam numa orientação ótima para a formação do intermediário de transição. • A ligação dos substratos ao centro ativo remove boa parte de suas camadas de hidratação. • A interação com os aminoácidos que formam o sítio ativo favorece a formação do intermediário de transição. • Reunidos, esses fatores favorecem a formação do intermediário de transição e a reação em si. Atividade enzimática • Atividade enzimática= Quantidade de produto sintetizado na presença da enzima, por uma determinada unidade de tempo e em condições químicas definidas (temperatura, pH, concentração de sais, etc...). mmol / segundo . (milimol de produto por segundo) Ou, mais freqüentemente: mmol /minuto (micromol de produto por minuto) A B A B A B A B A B A B A B A B B B A A E n z im a 1 A B A B A B A B A B A B A B A B B B A A E n z im a 2 Regulação da atividade enzimática 1. Regulação pelo produto (feedback negativo) Enzima S Quando o produto se liga ao sítio regulador, a enzima é inativada. Enzima 1 Enz. 2 Enz. 4 S A B C P Quando produto da via se liga à enzima regulatória da via, sua atividade é inibida... Sítio regulador P Via metabólica ...e, por conseqüência, toda a via é inibida. 1.1 – Inibição pelo produto imediato (direto) da enzima 1.2 – Inibição pelo produto final da via Especificidade de reação • Cada enzima catalisa um tipo específico de reação. • Cada enzima aceita somente uma ou poucas moléculas como substratos. • Quanto menos substratos forem aceitos, mais específica é a enzima. Grupamento químico Ligação química Grupamento químico ( muito raras) Substratos I II III IV V VI VII VIII Classes de enzimas • Existem mais de 2000 enzimas identificadas até hoje. • Um sistema de classificação foi desenvolvido com base nas especificidades de reação e de substrato. As seis grandes classes de enzimas Classe Tipo de reação Sub-classes Cinética Enzimática (de Michaelis-Menten) • Taxa de reação em função das concentrações dos substratos. Cinética de Michaelis–Menten • Velocidade x concentração de substrato. • Vmax: velocidade máxima da enzima. • Km: concentração de substrato em que a reação acontece na metade da velocidade máxima. • Na Vmax praticamente todas as moléculas de enzima estão com seus sítios ativos ocupados. • No Km (constante de Michaelis) metade das moléculas de enzima presentes no meio de reação estão com seus sítios ocupados. • Km: medida da afinidade da enzima pelo substrato, quanto menor o Km maior a afinidade. Cinética enzimática (continuação) • A atividade de uma enzima é influenciada por vários fatores, que devem ser otimizados e controlados para que sua medição seja feita de uma forma reprodutível e confiável. • Esses fatores incluem: – Temperatura. – pH. – Força iônica (concentração de sais). – Concentrações de substratos, cofatores, inibidores. Efeito da temperatura na atividade enzimática • O aumento de temperatura, a princípio, produz um aumento na atividade enzimática. • Até que se atinge um determinado valor de temperatura em que começa a acontecer a desnaturação da enzima e a perda de sua atividade. Influência do pH na atividade enzimática • pH ótimo (pH onde a atividade da enzima é máxima). • Protonação/desprotonação do sítio ativo. • Em pHs muito extremos, a proteína é inativada por desnaturação. Inibidores • Muitas substâncias podem afetar processos metabólicos, inibindo a atividade das enzimas. • Os inibidores de enzimas são particularmente importantes. • Uma grande quantidade de medicamentos atuam como inibidores enzimáticos (ex: sinvastatina na síntese de colesterol, aspirina na síntese de prostaglandinas...). • Metabólitos naturais também estão envolvidos em processos regulatórios, atuando como inibidores enzimáticos (o mecanismo de controle por “feedback negativo” é muito comum, que é quando uma enzima ou via metabólica ser inibida por seu produto final). Tipos de Inibidores • Reversíveis (ou “competitivos”): não causam alteração definitiva na enzima; não se ligam permanentemente à enzima. • Irreversíveis (ou “não competitivos”): se ligam permanentemente à enzima. • Muitos inibidores são análogos do substrato natural da enzima (possuem formato semelhante). • Outros são análogos do intermediário de transição. Inibição alostérica • Inibidores alostéricos se ligam a um local afastado do sítio ativo. • Provocam uma mudança conformacional na enzima que indiretamente reduz sua atividade (mas não a inativa completamente). • Não pode ser descrito pelo modelo de Michaelis–Menten (resulta em uma sigmóide em vez de uma hipérbole).
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