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Aminoácidos (c) Queratina produzida por todos os animais vertebrados: cabelo, unhas, chifres, lã, escmas e penas. (a) Luz dos vaga lumes: proteína luciferina e o ATP / luciferase (b) Eritrócitos contem grande quantidade da proteina transportadora de oxigênio, hemoglobina Rinocerante negro está em vias de extinção – chifre propriedades afrodizíacas - MITO Estrutura geral dos amionoácidos de ocorrência biológica Grupamento amino Grupamento carboxilato (ácido carboxílico) Hidrogênio Grupamento “R”, ou cadeia lateral Essa parte é que define as propriedades cada aminoácido de acordo com suas características de estrutura, tamanho, caga elétrica , solubilidade prolina Exceção: Os aminoácidos possuem (pelo menos) um carbono quiral Estéreo isômeros Ópticamente ativos, isto é mudam o plano de polarização da luz polarizada (enantiomeros) glicinaOs aminoácidos utilizados nas proteínas são L-estereoisômeros Exceção: Centro quiral A B C D A B C D Uma classificação dos aminoácidos Outra classificação: Apolares alifáticos Alanina , valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar no interior das proteínas, estabilizando sua esrutura por meio de interações hidrofóbicas. Metionina possui um grupamento tioéter apolar (contendo enxofre) na sua cadeia lateral. Prolina: tem uma cadeia alifática ciclica na sua cadeia lateral. Sua amina secundária (imino) confere rigidez à região do polipeptídeo onde está presente. Glicina: É o que tem a estrutura mais simples. Embora esteja classificada como apolar, sua cadeia lateral é muito pequena para contribuir com as interações hidrofóbicas Polares não carregados São mais hidrofílicos que os aminoácidos apolares porque contém grupamentos funcionais capazes de fazer pontes de hidrogênio com a água. A polaridade as serina e da treonina é devida ao seus grupamentos hidroxila (–OH). A polaridade da cisteína é devida ao seu grupamentoa sulfidrila (-SH). Os grupamentos amida conferem polaridade às cadeias laterais da asparagina e da glutamina Asparagina e glutamina são amidas de outros dois aminoácidos também encontrados em proteínas: aspartato e glutamato Aspartato Glutamato Cisteína e Cistina A cisteína é facilmente oxidada para formar um dímero através de uma ligação covalente do tipo dissulfeto . Esse dímero, que se chama cistína, é extremamente apolar . As ligações dissulfeto tem um papel muito importante na estrutura de muitas proteínas formando ligações covalentes entre diferentes partes de uma molécula de proteína Aminoácidos aromáticos São relativamente apolares (hidrofóbicos). Os três podem participar de interações hidrofóbicas O grupamento hidroxila da tirosina pode formar pontes de hidrogênio, é um importante grupamento funcional no sítio catalítico de algumas enzimas. Tirosina e triptofano são significativamente mais polares do que fenilalanina, devido a hidroxila fenólica da tirosina e ao nitrogênio indólico do triptofano fenol indol Grupamentos R com carga positiva (básicos) Muito hidrofílicos Apresentam carga elétrica positiva em pH fisiológico Lisina contem uma amina primária Arginina contém um grupamento guanidino Histidina contém um grupamento imidazol amina guanidino imidazol Grupamentos R com carga negativa (ácidos) Possuem carga negativa em pH fisiológico. AMINOÁCIDOS Aminoácidos incomuns Colágeno Parede celular de plantas Miosina Protrombina Ptn de coagulação do sangue AMINOÁCIDOS Aminoácidos incomuns Elastina Lys Lys Lys Lys Raro resíduo não modificado AMINOÁCIDOS Aminoácidos incomuns 300 aminoácidos adicionais não constituem proteínas Biossíntese de arginina AMINOÁCIDOS Titulação de aminoácidos Íon dipolar AMINOÁCIDOS Titulação de aminoácidos apolar e polar não-carregado pK1= 50% A e 50% de B pI= (pK1+pK2)/2 100%B) pK2= 50%B e 50% C A B C Zona de tamponamento (faixa entre pK +1 e pK-1) AMINOÁCIDOS Titulação de aminoácidos carregados positivamente pK1= 50% A e 50% de B pKR= 50% B e 50% de C pI= (pKR+pK2)/2 (100% C) pK2= 50%C e 50% D A B C D AMINOÁCIDOS Titulação de aminoácidos carregados negativamente pK1= 50% A e 50% de B pI= (pK1+pKR)/2 (100% B) pKR= 50% B e 50% de C pK2= 50%C e 50% D A B C D Propriedades químicas e convenções relacionadas aos aminoácidos Código de três letras Código uma letra Peso molecular pK do carboxilatopK da amina pK da cadeia lateral É uma escala teórica que procura estimar se das cadeias laterais dos aminoácios vão procurar ambientes aquosos (como o citoplasma) ou lipídicos (como as membranas celulares). Valores negativos indicam hidrofilicidade, enquanto valores positivos indicam hidrofobiciadade. Pode ser usado para estimar como uma proteína de membrana se insere na bicamada lipídica Propriedades químicas e convenções relacionadas aos aminoácidos (cont.)pI – Ponto isoelétrico Ponto isoelétrico é o valor de pH no qual a soma total das cargas de uma molécula (carga líquida) é igual a zero pI > 7 básicos pI < 7 ácidos O que é Ponto isoelétrico? Índice de hidrofobi cidade O que é Índice de hidrofobicidade? Frequencia (%) É simplesmente uma estatística que mostra o percentual com que cada aminoácido aparece num universo de 1500 proteínas seqüenciadas 21 AMINOÁCIDOS Aminoácido 3 letras Símbolo Destino Síntese Ácido aspártico Asp D Glicose Não-essencial Ácido glutâmico Glu E Glicose Não-essencial Alanina Ala A Glicose Não-essencial Arginina Arg R Glicose Não-essencial Asparagina Asn N Glicose Não-essencial Cisteína Cys C Glicose Não-essencial Fenilalanina Phe F Glicose, CC Essencial Glicina Gly G Glicose Não-essencial Glutamina Gln Q Glicose Não-essencial Histidina Hys H Glicose Essencial Isoleucina Ile I Glicose Essencial Leucina Leu L CC Essencial Lisina Lys K CC Essencial Metionina Met M Glicose Essencial Prolina Pro P Glicose Não-essencial Serina Ser S Glicose Não-essencial Tirosina Tyr Y Glicose, CC Não-essencial Treonina Tre T Glicose, CC Essencial Triptofano Trp W Glicose, CC Essencial Valina Val V Glicose Essencial Aminoácidos em Termos Nutricionais Aas Essenciais Aas Não Essenciais Arginina Glicina Histidina Alanina Lisina Cisteina Isoleucina Ácido aspartico Leucina Ácido glutâmico Valina Asparagina Treonina Glutamina Metionina Prolina Fenilalanina Tirosina Triptofano serina
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