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* Aula 5 Nucleotídios e ácidos nucléicos * Nucleotídios * ✔ São compostos ricos em energia que dirigem os processos metabólicos; ✔ Servem como sinais químicos, tendo papel chave na resposta a hormônios e outros estímulos extracelulares; ✔ Componentes estruturais de inúmeros co-fatores e intermediários metabólicos; ✔ Depósito molecular de informação genética. ✔ Unidades básicas do DNA e RNA – polímeros de nucleotídeos Nucleotídios * Estrutura dos nucleotídios Composição dos nucleotídeos: I-Base nitrogenada (hidrofóbica) RNA: A, C, G e U DNA: A, C, G e T II-Pentose (hidrofílica) RNA: D-ribose DNA: 2´-desoxi D-ribose III-Fosfato (hidrofílico) * Bases Nitrogenadas Pouco solúveis em água * Ligação fosfodiester no DNA e RNA NOTE!!!!! EXTREMIDADES 5’ 3’ CARGA NEGATIVA É feita entre dois nucleotídeos Ocorre entre o fosfato ligado ao carbono 5´ de um nucleotídeo com o OH ligado ao carbono 3´ do outro nucleotídeo * Estrutura dos ácidos nucléicos DNA * O DNA: Está presente no núcleo das células eucarióticas, nas mitocôndrias e nos cloroplastos, e no citosol das células procarióticas. Nas células germinativas e no ovo fertilizado, dirige todo o desenvolvimento do organismo, a partir da informação contida em sua estrutura. É duplicado cada vez que a célula somática se divide. É um polidesoxirribonucleotídeo formado por milhares de nucleotídeos ligados entre si através de ligações 3’, 5’- fosfodiéster. Sua molécula é formada por uma fita dupla antiparalela, enrolada sobre si mesma formando uma dupla hélice. * Célula Procariótica Célula Eucariótica Animal * Histórico do DNA * 1928 Frederick Griffith Molécula hereditária que é transmissivel entre bactérias. “principio da transformação” Histórico da descoberta do DNA como material genético Streptococcus pneumoniae * 1944 Avery – MacLeod - McCarty O DNA é o fator responsável pelo “Transforming Principle” Histórico da descoberta do DNA como material genético * Experimento de Avery, MacLeod e McCarthy * Ciclo do fago T2 * Cresce população de bactérias infectadas com fago T2: uma em 35S e outra em 32P Infecta novas células Agita vigorosamente Separa células infectadas por centrifugação Experimento de Hershey e Chase Histórico da descoberta do DNA como material genético * 1951 Erwin Chargaff—Moléculas de DNA tem diferentes composições de bases * Using X-ray Crystallography to Solve the Structure of DNA Structure A of DNA Taken by Maurice Wilkins Structure B of DNA Taken by Rosalind Franklin Two distinct forms of DNA exist: Natural DNA * 1953—Watson and Crick Modelo estrutural do DNA * Estrutura do DNA — Modelo de Watson e Crick Dupla hélice antiparalela Pareamento de bases explica leis de Chargaff (A = T e C = G) Interações fracas estabilizam a hélice (pontes de H e empilhamento de bases) Modelo sugere mecanismo de transmisão da informação genética (semi-conservativo) DNA celular é quase exclusivamente B-DNA B-DNA tem ~10.5 bp/volta de hélice * Estrutura do DNA ✔ 2 cadeias de nucleotídeos torcidas em torno de um eixo; ✔ Forma uma dupla hélice; ✔ O esqueleto hidrofílico de desoxiribose e grupos fosfatos ficam do lado externo da hélice, em contato com a água; ✔ As bases nitrogenadas estão empilhadas com seus anéis planares e hidrofóbicos bem próximos e perpendiculares ao eixo central; ✔ As fitas são antiparalelas (uma está no sentido 5’ 3’ e a outra 3’ 5’) e possuem seqüências complementares O esqueleto é hidrofílico, com os resíduos de fosfato formando pontes de H com a água. O fosfato fornece uma carga negativa ao DNA. O esqueleto dos ácidos nucléicos consiste de resíduos de fosfato e pentose alternados. Por convenção, a seqüência de nucleotídeos é sempre representada na direção 5’3’: ATGCA * Note!! A-T 2 pontes de H G-C 3 pontes de H Pontes de hidrogênio e empilhamento de bases mantém a dupla fita * Estrutura: A, B e Z-DNA * Estrutura do DNA * * Estrutura: A-DNA d(AGCTTGCCTTGAG)•d(CTCAAGGCAAGCT) * d(CGCGAATTCGCG)•d(CGCGAATTCGCG) Estrutura: B-DNA * d(CGCGCGCGCGCG)•d(CGCGCGCGCGCG) Estrutura: Z-DNA * Estrutura: A, B e Z-DNA * Desnaturação de DNA Quanto maior conteúdo C+G maior estabilidade contra desnaturação * O DNA apresenta estruturas 1a, 2a e 3a 1a. Seqüência de bases ex) ATCTGTCA.... 2a. Estrutura em hélice (NÃO CONFUNDA COM -HÈLICE DE PROTEÍNAS ! 3a. Conformação tridimensional da molécula Estrutura 2a Estrutura 3a procariotos Estrutura 3a eucariotos * Estrutura terciária do DNA * O que é superenovelamento? DNA relaxado: 10.5 bp/volta Além da hélice formada pela fita dupla, o DNA forma hélices sobre ele mesmo. Superenovelamento ocorre em praticamente todos os cromossomos (circular ou linear) DNA in vivo tem sempre superenovelamento negativo (favorece abertura das fitas) * O que é superenovelamento? * Topoisomerases tipo I Topo I de E. coli 1) Relaxa apenas superenovelamento negativo Topo I de eucariotos 1) relaxa positivo ou negativo Relaxam o DNA cortando e religando uma das fitas apenas. Cortam uma fita, passam a outra fita pela abertura e fecham. * Topoisomerases tipo II Relaxam o superenovelamento cortando ambas as fitas. Topo II de E. coli (DNA Girase) Introduz enovelamento negativo ou relaxa positivo Topo II de Eucariotos Relaxa enovelamento positivo e negativo * Procariotos: relaxamento relaxamento superenovelamento Ação das topoisomerases * Nó: emaranhado de uma molécula única de DNA Catenação: ligação de duas moléculas de DNA, onde pelo menos uma é circular Uma molécula é linearizada. Tipo I ou Tipo II topo Tipo II topo Ação das topoisomerases * Níveis de organização cromossômica A dupla fita de DNA pode dobrar-se sobre si mesma formando estruturas terciárias. A maior parte do DNA celular em procariotos se encontra em formas compactadas devido ao super-enovelamento da dupla fita de DNA. O DNA genômico de eucariotos está localizado no núcleo e está dividido em cromossomos, geralmente encontra-se altamente compactado através de interações com proteínas básicas contendo resíduos com carga positivas denominadas histonas e também proteínas não histonas. * Níveis de organização cromossômica As histonas são responsáveis pelo primeiro nível básico de organização cromossômica denominado nucleossomo. O nucleossomo é formado pela associação de uma região do DNA contendo aproximadamente 200pb e de um octamêro de proteínas histonas formado por dímeros de histonas H2A, H2B, H3 e H4. Os nucleossomos podem se organizar em estruturas ainda mais compactadas. Devido ao alto grau de empacotamento da cromatina muitas vezes é necessário seu remodelamento para que o DNA seja transcrito ou replicado. * * * Estrutura dos ácidos nucléicos RNA * O RNA “Cópia de trabalho", criada a partir do molde de DNA e utilizada na expressão da informação genética. Na transcrição o RNA é convertido de forma eficiente e eficaz de uma cópia fiel de DNA para uma cópia funcional de RNA. Características do RNA: Em relação ao DNA, 4 diferenças são importantes: * O RNA possui uracila (U) no lugar da timina (T) na seqüência de bases; * A pentose do RNA é a ribose; * O RNA é formado por uma fita única, com eventual pareamento de bases intracadeia. * A molécula do RNA é muito menor que a do DNA. * * Tipos de RNAs: Existem três tipos principais de RNAs: I) RNA mensageiro (mRNA): Contêm/codifica a informação para a síntese de proteínas. Os mRNA representam cerca de 4%do RNA celular total. Atua transportando a informação genética do núcleo da célula eucariótica ao citosol, onde ocorrerá a biossíntese protéica. É utilizado como molde nesta biossíntese. * II) RNA transportador (tRNA): Transporta aminoácidos para que ocorra a síntese de proteínas. Os tRNA correspondem a 10% do RNA total da célula. É a menor molécula dos 3 tipos de RNA. Está ligado de forma específica a cada um dos 20 aminoácidos encontrados nas proteínas. Atua como adaptador, envolvido no posicionamento dos aminoácidos na seqüência prevista pelo código genético, no momento da síntese protéica. * III) RNA Ribossômico (RNAr): Corresponde até 80% do RNA total da célula. É encontrado em associação com várias proteínas diferentes, na estrutura dos ribossomos (organelas responsáveis pela síntese protéica). IV) RNA pequeno nuclear (snRNA): Envolvido com o processamento do RNA. Fazem parte das classes de RNAs não codificadores (ncRNA). * * * * * * * * Produto da transcrição – RNA Apesar de se parecerem bastante a 1ª vista, o RNA pode assumir estruturas extremamente complexas e exercer inúmeras funções além daquelas como intermediário no fluxo da informação gênica. Ex função catalítica, reguladora. * CHAVE *
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