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1 Introdução ao Metabolismo e Bioenergética Prof. Dr. Edson dos Anjos Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: O estudo da formação e da degradação das biomoléculas é essencial para entender seu funcionamento. Formação DegradaçãoProteínas Consumo Energia Produção Energia 2 Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: Metabolismo: Conjunto altamente organizado e complexo de reações catalisadas e reguladas por enzimas. Estas reações se organizam em sequências enzimáticas VIAS METABÓLICAS Introdução ao Metabolismo • Mapa de Vias Metabólicas 3 Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: A primeira vista é muito complexo! Temas unificadoras e/ou recorrentes: - metabólitos e reações comuns - transportadores ou intermediários ativados - tipos de reações químicas - modos de regulação MAS.... existem alguns princípios básicos, uma certa lógica no seu desenho e temas unificadores e recorrentes (refletindo uma certa organização modular) que ajudam a tornar seu entendimento mais fácil Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: Anabolismo: Síntese de todos os compostos necessários à manutenção do equilíbrio dinâmico (proteínas, carboidratos, lipídeos, ácidos nucleicos) Catabolismo: quebra de moléculas combustíveis para obtenção de energia e monômeros para síntese de suas próprias moléculas Dividido em duas categorias: 4 Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: As vias catabólicas liberam energia, uma parte é conservada na forma de ATP e de transportadores de elétrons (NADH, NADPH e FADH2); As vias anabólicas necessitam de energia, geralmente na forma de potencial de transferência de grupo fosforil do ATP e do poder redutor dos transportadores de elétrons. Metabólitos Complexos Produtos Simples Degradação Biossíntese ATP Anabolismo ADP+Pi Catabolismo •Biossíntese •Contração muscular •Transporte de íons •Termogênese O2 H2O CO2 Biomoléculas Uréia Introdução ao Metabolismo 5 Introdução ao Metabolismo A energia liberada durante o Catabolismo é usada para a formação do ATP Sítio reativo Similarmente, o metabolismo resulta na produção de carreadores de elétrons reduzidos, NADH e NADPH (participam de etapas redutoras biossintéticas) NAD NADPH As Fases do Catabolismo 6 Introdução ao Metabolismo • Visão Geral do Metabolismo: Três tipos de vias metabólicas não- lineares: a) Convergente, catabólica; b) divergente, anabólica; c) cíclica. Bioenergética • As transformações biológicas de energia obedecem às Leis da Termodinâmica 1ª Lei (Conservação da Energia): para qualquer mudança física ou química, a quantidade total de energia no universo permanece constante; a energia pode mudar de forma ou pode ser transportada de uma região para outra, mas não pode ser criada ou destruída. VIZINHANÇA (resto do universo) Sistema (região definida) Princípio Zero: Equilíbrio termodinâmico B AE E E Q W EA: Energia do sistema no início do processo EB: Energia do sistema no final do processo Q : Calor absorvido pelo sistema de sua circunvizinhança W: Trabalho realizado pelo sistema 7 Bioenergética • As transformações biológicas de energia obedecem às Leis da Termodinâmica 2ª Lei (Aumento da desordem): em todos os processos naturais, a entropia do universo aumenta. (ΔS Sistema+ ΔS Vizinhança) > 0 Energia Livre de Gibbs ΔG= ΔH - TΔS ΔG = 0 (sistema em equilíbrio) ΔG > 0 (não espontânea) ΔG < 0 (espontânea) Bioenergética • ΔG e Equilíbrio [ ][ ]ln [ ][ ] o C DG G RT A B A + B C + D Em uma reação em equilíbrio Go = variação da energia livre padrão T = 298 K = 25 °C R = 8,315 J/mol.K ou 1,987 cal/mol.K - constante dos gases Concentração de todos os reagentes é 1,0 M 8 Bioenergética Esta equação refere-se a natureza dos reagentes e as suas concentrações. ΔGº’ é a variação de energia livre padrão de reações bioquímicas (ou de padrão aparente). H2O: pH= 7, [H+] = 1,0 M A concentração de todos os reagentes = 1,0 M Bioenergética Constante de equilíbrio reacional [ ][ ]ln [ ][ ] o C DG G RT A B [ ][ ] [ ][ ]eq C DK A B ' ' lno eqG G RT K 9 Glicose-1-fosfato Glicose-6-fosfato Bioenergética Calcule a variação de energia livre padrão da reação catalisada pela enzima fosfoglicomutase (glicogenólise): Onde a reação se inicia com 20 mM de glicose-1-fosfato e ausência de glicose-6-fosfato e o equilíbrio final da mistura a 25 °C e pH 7,0 contém 1,0 mM de glicose-1-fosfato e 19 mM de glicose-6-fosfato. A reação no sentido da formação de glicose-6-fosfato ocorre com perda ou ganho de energia livre? Determinação do ΔG°’ Bioenergética ' ' ln ' ln ' ln o eq o eq o G G RT K G RT K G K 10 Variação da energia padrão para algumas reações químicas que ocorre nos organismos vivos. Bioenergética O ΔG e ΔG’° para uma determinada reação: aA + bB cC + dD Estão relacionados pela equação: Esse termo é a razão da ação das massas (Q), a que realmente prevalece E pode ser expresso dessa maneira: 11 A B Bioenergética No caso de duas reações químicas sequenciais: B C Cada reação possui sua própria Keq e seu ΔG’° (ΔG1’° e ΔG2’°), como as duas reações são sequenciais, B é cancelado, resultando: Assim o ΔG’°total= ΔG1’° + ΔG2’°, esse princípio da Bioenergética explica como uma reação termodinamicamente desfavorável (endergônica) pode ocorrer no sentido direto, por meio de um intermediário comum. Bioenergética Por exemplo, a síntese da glicose-6-fosfato é o primeiro passo na utilização de glicose em muitos organismos: O valor positivo do ΔG’° indica que, em condições padrão, a reação não tenderá a ocorrer espontaneamente. Mas a reação sequencial é muito exergônica: Essas reações compartilham dois intermediários em comum, Pi e H2O, e são expressas como reações sequenciais: Glicose + Pi → glicose-6-fosfato + H2O ΔG’°= 13,8 kJ/mol ATP + H2O → ADP + Pi ΔG’°= -30,5 kJ/mol Glicose + Pi → glicose-6-fosfato + H2O ΔG’°= 13,8 kJ/mol ATP + H2O → ADP + Pi ΔG’°= -30,5 kJ/mol _________________________________________________________ Soma: ATP + glicose → ADP + glicose-6-fosfato ΔG’°total= -16,7 kJ/mol 12 Reações Bioquímicas Comuns A maior parte das reações nas células vivas pertence a uma das cinco categorias gerais: 1) Reações que criam ou quebram ligações C-C; 2) Rearranjos internos, isomerizações e eliminações; 3) Reações com radicais livres; 4) Transferência de grupos; 5) Oxidação-redução. Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos 1) Reações que criam ou quebram ligações C-C; Algumas reações comuns de formação quebra de ligações C-C em sistemas biológicos. Dois mecanismos para a clivagem de uma ligação C-C ou C-H. 13 Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos Nucleófilos e eletrófilos comuns em reações bioquímicas Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos 2) Rearranjos internos, isomerizações e eliminações; 14 Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos 3) Reações com radicais livres: Uma reação de descarboxilação iniciada por radicais livres. A biossíntrese do grupo heme em Escherichia coli inclui esta etapa. Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos 4) Transferências de grupos: As transferências de grupos acil, glicosil e fosforil de um nucleófilo para outro é comum em células vivas Reação SN2 15 Reações Bioquímicas Comuns Princípios químicos básicos 5) Reações de oxidação e redução: O estado de oxidação do carbonoem biomoléculas Reação importante no Ciclo do Ácido Cítrico Na presença de O2 e luciferase, ocorre a descarboxilação do adenilato de luceferina Indicadores Incandescentes de ATP Vaga-lume, um besouro da família Lampyridae O ATP é usado em um grupo de reações que convertem energia química energia luminosa.
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