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Enzimas: Jheinifer Cristina de Oliveira Paulino · Biocatalisadores (substâncias orgânicas que catalisam reações, ou seja, diminuem a energia de ativação e aceleram as reações metabólicas) em seres vivos; · Maioria de natureza proteica, mas algumas moléculas de RNA sob certas condições atuam como riboenzimas, então nem toda enzima é uma proteína; · Produzidas no interior das células; · Podem exercer suas funções dentro da célula (endoenzima) ou fora dela (exoenzima); · Podem agir no interior dos seres vivos (in vitro), como quando comemos carne e as proteínas começam a ser digeridas no estômago, por razão da enzima pepsina, presente no suco gástrico; · Isoenzima: diferentes formas de uma enzima com variação nos aminoácidos, tem grande importância nas interpretações clínicas, catalisam a mesma reação mas são produzidas em diferentes tecidos, exemplo: glucoquinase, hexoquinase, lactato desidrogenase; · Apoenzima: parte proteica que determina especificidade + Cofator/coenzima (orgânica): parte não proteica = Holoenzima. Propriedades: · Especificidade, cada enzima se encaixa em um substrato específico; · Não se desgastam nem são consumidas durante a reação, chegando inalteradas ao final, podendo atuar várias vezes. Funções: · Catálise de reações de degradação; · Conservação e transformação de energia química; · Síntese de macromoléculas; · Coordenação de vias metabólicas (enzimas reguladoras). Modelos de encaixe de enzima com substrato: · Em 1946, Linus Pauling demonstrou que o modelo chave-fechadura era inadequado, pois a enzima completar perfeitamente ao substrato é energeticamente ineficiente, sendo necessária essa perfeição apenas no estado de transição; · Em 1958, Daniel Koshland propôs o modelo de encaixe induzido, onde o sítio ativo pode flexibilizar-se temporariamente e depois retorna ao normal. · Algumas são reversíveis, obedecendo a Equação de Michaelis (km). Equação geral de Michaelis/equação geral das enzimas (km): · KM; · Quanto maior o KM, menor a velocidade da reação; · Especificidade: menor KM; · E + S ↔ ES ↔ E + P. Nomenclatura: · Sufixo –ase ao radical do substrato (exemplo: maltose > maltase); · Sufixo –ase ao radical do nome do tipo da reação (oxirredução > oxirredutase); · Nomes consagrados pelo uso: amilase salivar (ptialina), protease estomacal (pepsina), protease pancreática (tripsina); Classificação: · Oxirredutases; · Transferases; · Hidrolases; · Liases; · Isomerases; · Ligases. Influências sobre as enzimas: · Temperatura: cada enzima funciona dentro de uma temperatura ótima (TO) onde a atividade catalisadora é máxima (TMÁX), varia entre espécies. · Ph: semelhante a temperatura. · Concentração: quanto mais substrato, maior a velocidade, até atingir o ponto de saturação e chegar a TMÁX, independente da quantidade de substrato adicionada depois. Regulação do metabolismo/modulação alostérica: · Ligação não covalente; · Reversível (↔); · Moduladores alostéricos determinam enzimas alostéricas, quando o modulador se liga, altera a conformação da proteína para inibir ou estimular a ligação do substrato; · Quando o modulador e o substrato são o mesmo composto, enzima homotrópica, quando são diferentes, enzima heterotrópica. · Desestruturação 3D → regeneração · Centro/sítio alostérico, com feedback positivo (muda a conformação e o substrato se liga [maior afinidade de E por S], aumenta a especificidade e a velocidade) ou feedback negativo (muda a conformação mas não deixa ocorrer a ligação [menor afinidade de E por S], diminui ou para a via metabólica); Regulação enzimática: Enzimas reguladoras por ligações covalentes reversíveis: · Adição de grupos PI, AMP, UMP, ADP ribose, CH3; · Grupamentos P: via metabólica própria ou paralela; · Kinase: insere fosfato; · Fosfatase: retira fosfato; · Fosforilase: relacionada a carboidratos; Enzimas reguladas por clivagem protelítica: · Importante na digestão; · Enzima inativa/zimogênios: enzimas precursoras inativas, ligações covalentes. Exemplo: pepsinogênio, fibrinogênio. OBS: Pepsinogênio é maior que a Pepsina, que é quebradinha. · Retirada de peptídeos e aminoácidos do zimogênio. · Variações do Ph e da temperatura modificam a estrutura 3D e interfere no mecanismo regulador. Inibição enzimática: Inibição Reversível Competitiva (IRC): · Relacionada ao encaixe (quem tiver mais substrato se liga); · Complexo E-I; · Similaridade 3D entre E e I; · Mexe com o KM, que aumenta. · Exemplos: · Precursor do colesterol (HNG-CoA) com ação da redutase → colesterol. Inibidores dessa via: estatinas (sinvastatina, lovastatina); · Metanol com ação de álcool → formaldeído (tóxico) MAS Etanol com ação da desidrogenase → aceta...? (menos tóxico). Inibição Reversível Não Competitiva (IRNC): · Regulação alostérica; · Fora do sítio catalítico; · Complexo E-S-I; · KM inalterado; · Modulador negativo; · Diminui ou inibe VMÁX; · Para reverter é só tirar o inibidor; · Exemplo: · Substâncias/agentes quelantes (ligam metais); · ADP + Pi com ação da ATP sintase → ATP; · EDTA (age como a Heparina) → Irreversível (II): · Destroi o sítio catalítico; · Covalente, difícil de quebrar; · Inibidor suicida/kamikaze, pois a alteração é permanente, química; · Grupo funcional essencial; · Não mexe com KM nem VMÁX, exceção a regra de Michaelis; · Exemplos: · Muito usado em medicamentos para neoplasias, como quimioterápicos e retrovirais, mas os efeitos colaterais são de destruir tudo que cresce, tudo que é semelhante a um tumor, como cabelos, unhas. O coquetel para AIDS também age assim mas os efeitos colaterais dele são controlados. · Organofosforados (pesticidas); · Ação em acetilcolinesterase (ação motora). QUESTÕES PERTINENTES PARA PROVA: · Construir um gráfico, demonstrar positivo e/ou negativo); · Diferença entre catalisador e enzima: catalisador aumenta a velocidade de diminui energia de ativação e enzima é um biocatalisador, atua em seres vivos; · O que é uma isoenzima: diferentes formas de uma enzima com variação nos aminoácidos, mas que catalisam a mesma reação, como a glucoquinase, hexoquinase; · O que é um zimogênio: precursor inativo de uma enzima, como o pepsinogênio → pepsina; · Comparar energia de ativação de uma reação catalisada e outra não: a energia de ativação de uma catalisada tem que ser mais baixa; · Reação de formação com E, S e P: ? · Definir os tipos de inibição e dar exemplos ou dar um exemplo e pedir qual tipo de inibição é; · Quais variações ocorrem no Km e no Vmáx de tal enzima, tal reação; · Definir cofatores e coenzimas: cofator é a parte não proteica, como o ferro, se for uma molécula orgânica, derivada de vitaminas, é uma coenzima, como o NAD e o FAD; · Explique como é composto o sistema catalítico: sistema catalítico da enzima é formado pelo Substrato, que se liga ao Sítio de Posicionamento, onde ocorre o encaixe Enzima-Substrato, que se liga ao Sítio Ativo. · Listar os principais mecanismos de regulação enzimática: regulação alostérica/por feedback, por ligações covalentes e por clivagem protelítica; · Caracterizar uma enzima alostérica, definindo centro alostérico e efetores positivo e negativo: ? · Definir regulação enzimática por modificação covalente: reversível, com zimogênios, adiciona grupamentos, como Pi, AMP, UMP; · Definir a regra de MM e mostrar a relação dela (ou de Km) e a afinidade da enzima pelo substrato: quanto menos Km, mais especificidade da enzima; · PQ a diferença entre as curvas? (gráfico no material impresso) · Cite e explique as diferenças e ações das enzimas hexoquinase 1 e hexoquinase 4: hexoquinase 1 age na boca (e no músculo? baixa Km) e a 4 no fígado e pâncreas (aumenta Km), ambas inserem um grupo fosfato para armazenar energia. · Quais são os fatores que interferem na cinética enzimática: temperatura, o Ph e a concentração de substrato.
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