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Bioquímica de Proteínas Eletroforese Estrutura e Função de Proteínas – → Estrutura primária: sequência de aminoácidos que compõe a proteína que fazem ligações peptídicas entre si. o O que difere os aminoácidos são os seus radicais. → Estrutura secundária: dobramento da proteína; ocorre uma ligação de hidrogênio entre o oxigênio da carboxila de um aminoácido com o hidrogênio do grupo amina do outro. o Folha β-preguiada. o α-hélice. → Estrutura terciária: dobramento resultante da interação dos grupos radicais dos aminoácidos. o Ligação dissulfelto entre as cadeias laterais de cisteína: covalente. → Estrutura quaternária: está relacionada à interação de diferentes proteínas, formando uma estrutura funcional. DESNATURAÇÃO → Processo de desenovelação das proteínas. → Pode ocorrer por alterações no pH, variações de temperatura e presença de detergentes na cadeia polipeptídica. → Quando ocorre a desnaturação de uma proteína, a mesma acaba perdendo sua função. Anemia Falciforme ------------- → É caracterizada pela alteração nos glóbulos vermelhos, onde as hemácias passam a apresentar formato de foice. o Isso ocasiona a oclusão dos vasos sanguíneos e a propensão à hemólise (destruição prematura das hemácias por rompimento da membrana plasmática). → A diferença entre um indivíduo saudável e um que possui a doença ocorre em apenas um aminoácido: onde deveria-se apresentar uma glicina, tem-se uma valina. Eletroforese ------------------- → Técnica empregada para separar moléculas de diferentes cargas e/ou pesos moleculares durante a aplicação de uma diferença de potencial elétrico. → Na eletroforese é possível separar macromoléculas de DNA, RNA e proteínas. → Na separação por carga, quando há uma mistura de proteínas com cargas negativas e positivas, aplica-se uma diferença de potencial elétrico, assim, atraindo as proteínas para a região dos polos. → Na separação por peso (massa) molecular, todas as proteínas são carregadas negativamente e a única coisa que as difere é a massa molecular. Logo, quando o potêncial elétrico é adicionado, as proteínas maiores ficam mais próximas ao polo negativo, enquanto as menores ficam mais próximas ao polo positivo. SDS-PAGE -------------------- → Eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) em presença do detergente dodecilsulfato de sódio (SDS). PRINCIPAIS COMPONENTES → Gel de poliacrilamida. o Representa o polímero. o O gel é preparado verticalmente entre dois suportes plásticos ou de vidro que possuem depressões para realizar a aplicação da amostra. o Quando pronto, o gel apresenta um pollímero de acrilamida. ▪ Forma-se uma malha porosa por todo o gel; os poros alteram de tamanho de acordo com a quantidade de acrilamida. • É inversamente proporcional. o Dois tipos de gel: empilhamento e corrida. ▪ O gel de empilhamento empilha todas as proteínas até que as mesmas entrem no gel de corrida ao mesmo tempo, seguindo uma sequência. → Preparo de amostra. o Para linealizar as amostras, deve-se desnaturá-las. Para isso, deve-se fervê-las por cinco minutos a 95º em uma solução tampão. Ademais, deve-se, atráves do 2- mercaptoetanol, reduzir as pontes dissulfeto. o Para que todas as proteínas passem a apresentar cargas negativas, no tampão há presença do SDS. ▪ Uma molécula de SDS se liga em dois aminoácidos de cada proteína, criando uma relação entre a massa e a carga das proteínas. • Proporcional ao número de SDS. o O tampão é constituido por SDS, 2- mercaptoetanol, azul de bromofenol e glicerol. → Solução tampão ionizada. o Faz a condução das amostras e, também, do potêncial elétrico que é aplicado.. o Em pH 8,3, a glicina se encontra acima da curva do ponto isoelétrico; SDS (-). → Cada banda apresenta um peso molecular diferente. → Quando em gel, pode-se observar um padrão no peso molecular. *** ESSE PROCESSO PERMITE AVALIAR SE OCORREU EXPRESSÃO DA PROTEÍNA DE INTERESSE E SUA PURIFICAÇÃO. Eletroforese Bidimensional ------- → Uma nova dimensão de separação de proteínas é adicionada. → Além de realizar a separação por peso molecular, pode-se realizar, simultaneamente, a separação por ponto isoelétrico. o A separação por ponto isoelétrico é feita por focalização. → PRIMEIRA DIMENSÃO: o Separação por ponto isoelétrico. o Focalização isoelétrica: a amostra é aplicada em um gel com gradiente de pH (9 → 3) e migra até o ponto isoelétrico neutro. ▪ Quando o potêncial elétrico é aplicado, a proteína tende a migrar em direção ao polo positivo até atingir o pH neutro. → SEGUNDA DIMENSÃO: o SDS-PAGE.
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