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Disciplina: Biologia Molecular Docente: Dr. Rodrigo de Oliveira EXERCÍCIO – PCR e ELETROFORESE QUESTÃO 01: Há inúmeros microrganismos coabitando em diversas partes do corpo humano, denominando-se microbiota. O conhecimento científico sobre as interações humanas relacionadas à essa diversidade de microrganismos se desenvolveu nos últimos anos em diferentes áreas da ciência. Pesquisadores, por exemplo, estudam a mudança da microbiota oral em crianças, de acordo o seu desenvolvimento, através da amplificação de um marcador molecular de diversidade bacteriana denominado como gene 16S. A cada ano de vida, coleta-se amostras da cavidade oral de crianças, extrai-se o DNA total e realiza-se a técnica de PCR para amplificação desse marcador molecular. Um ponto importante é a conservação das amostras coletadas, uma vez que o DNA da amostra pode ser degradado e dificultar a detecção do marcador molecular investigado. Nesse contexto, considere que a figura abaixo represente o resultado de uma eletroforese (gel de agarose) de amostras de DNA extraídas da cavidade oral de quatro crianças (Poço X representa o ladder; Poço 1 a 4 representam amostras de crianças) Baseado no texto e figura acima, qual amostra apresenta melhor integridade para se aplicar a técnica de PCR? (a) Amostra do Poço 1. (b) Amostra do Poço 2. (c) Amostra do Poço 3. (d) Amostra do Poço 4. (e) Ladder do Poço X. QUESTÃO 02: “A gripe H1N1 consiste em uma doença causada por uma mutação do vírus de RNA da gripe. Também conhecida como gripe Influenza tipo A ou gripe suína, ela se tornou conhecida quando afetou grande parte da população mundial entre 2009 e 2010. Os sintomas da gripe H1N1 são bem parecidos com os da gripe comum e a transmissão também ocorre da mesma forma. O problema da gripe H1N1 é que ela pode levar a complicações de saúde muito graves, podendo ser fatal. O vírus vive por duas a oito horas em superfícies e lavar as mãos com frequência ajuda a reduzir as chances de contaminação.” (Adaptado do texto: Gripe H1N1 – Sintomas e Prevenção. Suely Amarante - Site IFF/Fiocruz) Nesse contexto, considere um paciente infectado por H1N1. Para se quantificar a carga viral de H1N1 nesse paciente, sugere-se utilizar (a) PCR em tempo real. (b) PCR com transcriptase reversa. (c) PCR convencional. (d) Nested PCR. (e) PCR combinada com eletroforese. QUESTÃO 03:O Brasil, nos últimos anos, foi assolado por uma epidemia de dengue que ainda não está controlada, a despeito da queda nos índices de infecção verificada em 2003. Tanto é assim que os quatro sorotipos da doença que afetam o homem já foram detectados no País. Procurando atender a essa demanda, os pesquisadores desenvolveram um teste molecular para dengue, empregando a metodologia de PCR, que amplifica o RNA viral de forma seletiva em amostras de plasma (Adaptado de “Diagnóstico de Dengue”, Site Fleury). Considere que a figura (ao lado) represente o resultado de uma eletroforese (gel de agarose) de reações de PCR específicas para a detecção de Dengue virus 1 (Poço X representa o ladder; Poço 1 representa o controle positivo; Poço 2 e 3 representam amostras de pacientes; Poço 4 representa o controle negativo) Baseando-se no texto e na imagem, é correto afirmar: (a) A detecção do vírus da dengue foi realizada através de uma PCR em tempo real. (b) A reação de PCR visualizada na imagem não foi realizada corretamente, uma vez que se apresenta contaminada. (c) O marcador molecular do vírus da dengue é de aproximadamente 150bp. (d) A amostra do poço 2 é positiva para o vírus da dengue. (e) O paciente do poço 3 está coinfectado por dois tipos de vírus. QUESTÃO 05: Câncer é o nome dado a um conjunto de mais de 100 doenças que têm em comum o crescimento desordenado (maligno) de células que invadem os tecidos e órgãos, podendo espalhar-se (metástase) para outras regiões do corpo. Pesquisadores tentam entender qual a base genética e celular para o desenvolvimento dessa doença. Abaixo, encontra-se um gráfico gerado em uma PCR em tempo real para o gene PSMA, para medir o nível de expressão desse segmento gênico em células cancerosas (curva A) e células normais (curva B). O threshold está representado pela linha apontada pela seta. Baseado no gráfico acima, pode-se sugerir: (a) O gene PSMA é menos expresso nas células cancerosas em comparação às células normais. (b) O gene PSMA é mais expresso nas células cancerosas em comparação às células normais. (c) Não há diferença de expressão do gene PSMA entre as células cancerosas e normais. (d) O gene PSMA está presente nas células normais e ausente nas células cancerosas. (e) O gene PSMA é mais expresso nas células normais em comparação às células cancerosas.