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Genética Princípios da Replicação do DNA: • Chama-se replicação ou duplicação o processo pelo qual o DNA é capaz de autorreplicar, ou seja, sintetizar novas fitas, utilizando as existentes como molde. • Unidade funcional são os nucleotídeos - eles se juntam através da ligação fosfodiester um carbono 5’ se liga a outro carbono 3’ - “o sentido da vida é 5’ - 3’” - são paralelas e complementares - A timina e a adenina fazem um dupla ponte de hidrogênio entre si - E a guanina e citosina fazem tripla ligação (mais forte) - Por isso a replicação muitas vezes se inicia na ligação T-A ou A-T por ser mais fácil de quebrar • Se enrolam também através de histonas: contribuem para esse enrolamento do DNA e seu compactamento • A replicação do DNA é um processo semiconservativo: pois as moléculas-filhas apresentam 1 fita oriunda da célula de origem e outra resultante da replicação - Cada fita parental serve como molde para a síntese de uma nova fita-filha. - Ocorre a separação das fitas da dupla hélice de DNA com a quebra das ligações de hidrogênio • Cada nova molécula de DNA é uma cópia perfeita de uma molécula preexistente. • Ocorre durante a fase S da interfase (período em que a célula está se preparando para a divisão • A enzima central envolvida é a DNA polimerase • O processo de replicação/duplicação gera moléculas de DNA como produtos do processo de biossíntese. - Estes ambientes de replicação com seus produtos são chamados de replicons. Origem de Replicação: • A sequencia iniciadora é uma sequencia rica em adenina e timina (devido à sua ligação mais frágil) • Nessa região tem a formação da Forquilha de replicação e do Replissomo: que é um conjunto de proteínas e enzimas que garante a replicação do DNA • Para ser ativada, a origem de replicação é reconhecida por um complexo proteico chamado complexo de reconhecimento de origem (ORC) - Ele liga-se às origens de replicação e sinaliza para que outras proteínas reguladoras venham a se ligar também. - Entre essas proteínas, está o complexo pré- replicativo ou pré RC. - Quando o complexo pré-RC se liga a uma origem de replicação, o complexo ORC é fosforilado e o processo de replicação é iniciado. - Depois de ocorrida a replicação, o complexo pré-RC se desliga daquela origem de replicação, impedindo outra leitura da mesma origem. Forquilhas de Replicação: • Garantida pela separação das duas fitas • A região do DNA na qual todas estas proteínas se reúnem para realizar a síntese de fitas-filhas é chamada de forquilha de replicação, em forma de Y. - Causa a abertura das duas fitas da dupla-hélice e usando cada um das fitas como um molde para produzir uma nova fita-filha. • Para separar as duas fitas necessita de duas coisas: - Topoisomerase: responsável por tirar a forma de hélice de uma parte da fita de DNA, ela interrompe as ligações e junta novamente, para diminuir a tensão - Helicase: desfaz as pontes de hidrogênio, separando as fitas Gabrielle Peixoto Replicação do DNA Genética • A enzima DNA-polimerase, sintetiza o DNA novo utilizando uma das fitas existentes como molde. - Essa enzima catalisa a adição de nucleotídeos à extremidade 3’ de uma cadeia crescente de DNA pela formação da ligação fosfodiéster entre a extremidade 3’ e o grupo 5’-fosfato do nucleotídeo a ser incorporado. • Fragmentos de Okazaki: - Devido a fita só crescer no sentido 5’ - 3’ significa que só uma fita consegue crescer no sentido continuo = fita continua - A fita sintetizada de forma contínua é chamada de fita líder - A outra fita no entanto é mais lenta para ser replicada, devido ao seu sentido oposto - é produzida em fragmentos = fragmentos de okazaki - além de ser mais lenta vai precisar de muito mais reparo, por conter mais nucleotídeos de RNA - por isso esse lado da fita tem mais chance de acontecer mutação - no final do filamento o primer não consegue complementar a sequencia, deixando uma região monofilamentar - por isso a polimerase (telomerase) adiciona vários nucleotídeos no final da sequencia para tentar corrigir esse erro - OBS.: células somáticas tem menos polimerase, o que aumenta as chances de perder uma parte de DNA codificante durante uma replicação - Deixa o telômero curto - São unidos pela ação da DNA ligase, formando uma nova fita intacta DNA-Polimerase: • A DNA-polimerase catalisa a reação de adição apenas quando o pareamento está correto. • Quando a DNA-polimerase produz um erro raro e adiciona um nucleotídeo incorreto, ela pode verificar o erro por uma atividade chamada de correção de erros. - A correção de erros ocorre ao mesmo tempo que a síntese de DNA. - Antes de adicionar um próximo nucleotídeo à cadeia crescente de DNA, a enzima verifica se o nucleotídeo inserido anteriormente está pareado de forma correta à fita-molde. - Se estiver, a polimerase adiciona o próximo nucleotídeo; - Se não, a polimerase remove o nucleotídeo mal pareado e tenta novamente. • Portanto, a DNA-polimerase possui uma atividade de polimerização 5’-3’ altamente precisa e também uma atividade de correção de erros 3’-5’. • Primase: enzima que sintetiza pequenos segmentos de RNA usando a fita de DNA - Esses pequenos segmentos são os Primers - A Primase: é uma proteína RNA-polimerase, traz os nucleotídeos complementares para essa fita de DNA, formando o primer, e por ser RNA- polimerase ela terá alguns nucleotídeos de RNA. - Só a partir daqui a DNA-polimerase 1 e a DNA- polimerase 3 vão conseguir dar prosseguimento a esse processo • Uma DNA-polimerase chamada de polimerase de reparo substitui o RNA por DNA (usando as extremidades dos fragmentos de Okazaki adjacentes como iniciadores), e a enzima DNA- ligase une a extremidade 5’- fosfato de um fragmento novo de DNA à extremidade 3’–OH do próximo. Proteínas acessórias da replicação: • Para que a síntese de DNA possa ocorrer, a dupla-hélice deve estar aberta à frente da forquilha de replicação, de modo que os trifosfatos de desoxirribonucleosídeo possam ser pareados com a fita-molde. •Dois tipos de proteínas de replicação – DNA- helicases e proteína ligadora de fitas simples (Proteína SSB) – se associam para essa tarefa. - A DNA-helicase utiliza a energia da hidrólise do ATP para separar a dupla-hélice, à medida que se desloca sobre o DNA, - Enquanto a proteína ligadora de fita simples se liga à fita de DNA exposta pela helicase, evitando temporariamente o repareamento de bases e mantendo a fita alongada de modo que possa atuar como molde para a DNA polimerase. Gabrielle Peixoto Genética • Grampo deslizante: atua mantendo a DNA- polimerase firmemente ligada ao DNA-molde enquanto sintetiza novas fitas de DNA - Forma um anel ao redor da hélice de DNA - Na fita retardada, porém, o grampo é removido e recolocado cada vez que um novo fragmento de Okazaki é produzido. • DNA-topoisomerase: alivia a supertorção da hélice - É uma nuclease reversível - Dois tipos: - As topoisomerases I quebram somente uma das fitas do DNA - As topoisomerases II introduzem quebras simultâneas em ambas as fitas. - As topoisomerases atuam quebrando ligações fosfodiéster entre nucleotídeos para desenrolar as fitas em duplas hélices e depois reconstituem as ligações. - Dessa maneira, a tensão criada na molécula com a ampliação das forquilhas é reduzida, evitando um possível rompimento da molécula. • Telomerase: enzima que estende os telômeros dos cromossomos. - A telomerase é uma DNA polimerase RNA dependente (uma enzima que pode produzir DNA usando o RNA como molde.) - Quando a extensão está longa o suficiente, pode-se fazer uma fita complementar através do mecanismo comum de replicação de DNA (isto é, usando um RNA primer e DNA polimerase), produzindo uma fita dupla de DNA. - OBS.: O encurtamento de telômeros foi relacionado ao envelhecimentode células e a perda progressiva dos telômeros pode explicar a razão pela qual as células somente podem se dividir um determina- do número de vezes. - A telomerase não é geralmente ativa na maioria das células somáticas (células do corpo), - É ativa nas células germinativas (as células que constituem o esperma e o óvulo) e em algumas células-tronco adultas. Resumo: • O processo de replicação do DNA acontece utilizando as duas fitas parentais como molde. • DNA-polimerase só polimeriza fragmentos de DNA no sentido 5’- 3’ (posição dos carbonos terminais na molécula do DNA). • A dupla fita de DNA apresenta uma molécula no sentido 3’-5’ (chamada de molde da fita líder) e outra no sentido 5’- 3’ (chamada de molde da fita tardia). • O sentido da dupla fita sempre será antiparalelo, ou seja, uma está num sentido e outro no outro, obrigatoriamente. • Durante o processo de duplicação, cada uma das novas fitas obedece o princípio do antiparalelismo, portando no molde da fita líder, a biossíntese da fita complementar será contínua. • A fita tardia será sintetizada em fragmentos, denominados fragmentos de Okazaki. • Os fragmentos de Okazaki, são gerados através do reconhecimento da DNA-polimerase à vários primers sintetizados na fita molde. • A DNA-polimerase promove a síntese no sentido inverso, gerando fragmentos que serão unidos enzimaticamente. Gabrielle Peixoto
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