A infecção pelo HIV tem uma história natural que pode ser dividida em quatro fases: 1. Fase aguda: ocorre logo após a infecção e pode durar algumas semanas. Nessa fase, o vírus se multiplica rapidamente e a carga viral aumenta muito. Os sintomas podem incluir febre, dor de cabeça, dor muscular, dor de garganta, ínguas, erupções cutâneas e diarreia. 2. Fase assintomática: também conhecida como fase de latência clínica, pode durar vários anos. Nessa fase, o vírus continua se multiplicando, mas em um ritmo mais lento. A carga viral é menor e os sintomas são leves ou inexistentes. No entanto, o sistema imunológico começa a ser comprometido, com a diminuição dos linfócitos T CD4+. 3. Fase sintomática inicial: também conhecida como fase sintomática precoce, pode durar de alguns meses a alguns anos. Nessa fase, os sintomas começam a aparecer, como febre, suores noturnos, perda de peso, diarreia, fadiga e infecções recorrentes. 4. Fase AIDS: é a fase mais avançada da infecção pelo HIV e ocorre quando o sistema imunológico está gravemente comprometido. Nessa fase, o paciente pode apresentar infecções oportunistas, como pneumonia, tuberculose, toxoplasmose, entre outras. Também podem ocorrer doenças relacionadas a tumores, como sarcoma de Kaposi. A AIDS é diagnosticada quando o paciente apresenta uma ou mais doenças oportunistas ou quando a contagem de linfócitos T CD4+ é inferior a 200 células/mm³.
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