Isso ocorre pois o oxigênio é um átomo bem negativo portanto ele possuiu um grande poder oxidativo, no caso ele consegue tirar eletrons de outros atomos, então se eles não se mantem ligado e estabilizado ele tende a oxidar outras moléculas. Como os seres anaeróbicos não possuem maquinario enzimatico para lidar com essa capacidade oxidativa do oxigenio, elas acabam sofrendo os danos, e assim perdendo estabilidade em suas proteínas e assim tendo suas funções metabólicas comprometidas.
Para a maioria dos organismos, um suprimento adequado de oxigênio aumenta o metabolismo e o crescimento. O oxigênio atua como aceptor de hidrogênios nos passos finais de produção de energia catalisada pelas flavoproteínas e pelos citocromos. Devido ao fato do oxigênio gerar duas moléculas tóxicas, o peróxido de hidrogênio (H2O2) e o radical livre superóxido (O2 ), as bactérias necessitam de pelo menos duas enzimas para utilizar o oxigênio. A primeira é o superóxido dismutase que cataliza a reação: 2 O2- + 2 H + " H2O2 + O2 e a segunda é a catalase: 2 H2O2 " 2 H2O + O2 As bactérias anaeróbias obrigatórias como Clostridium tetani não posssuem superóxido dismutase ou catalase ou ambos. Algumas conseguem sobreviver, enquanto outras são rapidamente mortas.
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