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GD – Estrutura e Função de Proteínas 1- A maioria das proteínas globulares sofre desnaturação (desenrolamento da estrutura espacial) com perda da atividade biológica quando rapidamente aquecida a 65ºC. entretanto, as proteínas globulares que contêm muitos resíduos de cistina precisam ser aquecidas por tempo mais longo e a temperaturas mais altas para serem desnaturadas. Uma tal proteína é o inibidor de tripsina do pâncreas bovino (ITPB), o qual tem 58 resíduos de aminoácidos em uma única cadeia e três interligações dissulfeto dadas por resíduos de cistina. Resfriando-se uma solução de ITPB a atividade biológica desta proteína é restaurada. Você pode sugerir uma base molecular para esta propriedade? 2- A bactéria anaeróbica altamente patogênica, Clostridium perfringens, é responsável pela gangrena gasosa, uma doença na qual a estrutura dos tecidos é destruída e secreta uma enzima que catalisa eficientemente a hidrólise da ligação peptídica indicada na seqüência: onde X e Y são quaisquer dos 20 aminoácidos naturais. Como a secreção desta enzima contribui para o potencial de invasão desta bactéria nos tecidos humanos? Por que esta enzima não afeta a própria bactéria? 3 - Uma amostra (660mg) de uma proteína oligométrica com peso molecular de Mr 132.000 foi tratada com 2,4-dinitrofluoro-benzeno, em condição levemente alcalina, até que a reação química fosse completada. As ligações peptídicas da proteína foram hidrolisadas completamente por aquecimento em HCl concentrado. O hidrolisado, quando analisado, continha 5,5mg do seguinte composto: Entretanto, não foi possível identificar nenhum outro derivado 2,4-dinitrofenil de grupos α-amino de outros aminoácidos. a) Explique porque esta informação pode ser usada para determinar o número de cadeias polipeptídicas em uma proteína oligomérica. b) Calcule o número de cadeias polipeptídicas nesta proteína. 4 - Estudos do transporte de oxigênio em fêmeas grávidas de mamíferos mostraram que as curvas de saturação pelo oxigênio do sangue materno e fetal são marcadamente diferentes quando medidas nas mesmas condições. Os eritrócitos do feto contêm uma variante estrutural da hemoglobina, hemoglobina F consistindo de duas subunidades α e duas γ (α2γ2) enquanto os eritrócitos maternos contêm a hemoglobina usual A (α2β2). a) Qual hemoglobina tem maior afinidade pelo oxigênio, em condições fisiológicas, a hemoglobina A ou a hemoglobina F? Explique. b) Qual o significado fisiológico para estas afinidades diferentes? Explique. 5 – Sob condições apropriadas, a molécula de hemoglobina se dissocia em quatro unidades. As subunidades α isoladas ligam-se ao Oxigênio, mas exibem uma curva hiperbólica, ao invés da curva sigmóide apresentada pela hemoglobina. Esta ligação não é afetada pela presença de H, CO2 ou BPG. O que estas observações indicam a respeito da cooperatividade entre as cadeias da hemoglobina? 6 – Como você explica o fato de que a substituição de um simples aminoácido (uma Valina no lugar de um ácido glutâmico) na estrutura da hemoglobina, dando origem à hemoglobina S ( anemia falciforme) afeta a organização estrutural e a função da hemoglobina? 7 – Anticorpos são proteínas capazes de reconhecer e se ligar a outra moléculas ( antígenos) de uma maneira bastante especifica. A mudança de um aminoácido na estrutura de um determinado antígeno viral (gripe aviária) implicou na ausência de reconhecimento deste antígeno por pacientes resistentes a outra variante da gripe, que não apresentava esta mutação. Por que a mudança de um aminoácido afetou a capacidade de reconhecimento do vírus da gripe aviária? Qual a provável localização deste aminoácido na proteína imunogênica? 8 – O que é uma proteína no seu estado nativo? Uma proteína, após alcançar esta conformação, se mantém sempre com a mesma estrutura? Explique. Explique a relação entre pH e a estrutura das proteínas. 9 – Descreva os quatro níveis de organização da estrutura das proteínas. Quais são as interações moleculares que estabilizam a estrutura das proteínas?