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proteínas lorrayne de Miranda | bioquímica PÁGINA 1 Proteínas: estrutura e função: São as macromoléculas mais importantes nas células vivas e são as únicas que além de carbono, hidrogênio e oxigênio possuem também nitrogênio - As proteínas podem ser classificadas de acordo com a origem, estrutura, forma e composição. Quantidade de aminoácidos e a ordem ESTRUTURA DAS PROTEÍNAS: se dobram e empacotam Estrutura primaria: • Número e sequência de Aminoácidos • Diversos métodos podem ser utilizados para determinar a sequência (estrutura primária) de uma proteína. • O primeiro método desenvolvido foi o chamado método de Edman que remove um aminoácido por vez da porção amino-‐terminal da proteína. • Hoje, outras metodologias mais sofisticadas (espectrometria de massa) podem ser utilizadas. INSULINA COMO EXEMPLO: • A insulina e uma proteína importante no metabolismo e sinaliza para que o organismo controle a concentração de açúcar no sangue. • Ela e composta de duas cadeias polipeptídicas unidas por pontes de dissulfeto (pontes S-‐S). • As proteínas tem os terminais que ficam na ponta e as demais estão ligadas por ligações peptideas, a insulina humana e quase igual a de porco. PÁGINA 2 Estrutura Secundária: a hélice e conformação b Propriedades das a-hélice: • Ligações de Hidrogênio: entre o oxigênio da carbonila e os H da amida. Individualmente ligações são fracas, mas coletivamente estabilizam a -hélice • 2) AA que rompem -hélice: prolina rompe -hélice, pois seu grupo imino não é geometricamente compatível com a espiral voltada para a direita da -hélice • 3) AA carregados: (glutamato -, aspartato -, histidina +, lisina +, arginina +) rompe a a-hélice pela formação de lig. Iônicas (se tiver muito + de uma carga acaba desestabilizando, precisa de um equilíbrio) • 4) AA com cadeias laterais volumosas: triptofano, valina, isoleucina, se presentes em grandes números podem interferir a formação de -hélice. Podem começar do lado direito ou esquerdo, usar o polegar para saber Propriedades das folha-b: • Compostas de 2 ou mais cadeias • 2) As ligações de H são perpendiculares ao esqueleto polipeptídico • 1) Lâminas paralelas e antiparalelas: 2 ou mais cadeias polipeptídicas distintas ou segmentos de cadeias polipep. As quais são arranjadas em paralelo (com todos os N-terminais das folhas juntos, ou antiparalelo. • Ligações de Hidrogênio: entre as cadeias polipeptídicas. Antiparalela – mais estável e estilizadora da molécula, paralela – e inclinada e fácil de romper PÁGINA 3 Estrutura Terciária das Proteínas: • 1) A estrutura primária de uma cadeia polipeptidíca determina sua estrutura terciária • 2) Arranjo global tridimensional global de todos os átomos de uma proteína Interações estabilizadoras das estruturas terciárias: • 1) Pontes dissulfeto • 2) Interações hidrofóbicas • 3) Pontes de Hidrogênio • 4) Interações Iônicas • E um conjunto de fontes onde estabiliza a proteína por que elas se dobram. Estrutura Quaternária das Proteínas: Número de Cadeias polipeptídicas: monôméricas, dimérica, trimérica, multimérica - Cadeias idênticas ou totalmente diferentes) PÁGINA 4 Relação Estrutura – Função de Proteínas: • Tamanho, número de resíduos e subunidades • Número de aminoácidos. Massa molecular média de um aa Informações importantes obtidas a partir da sequência de aminoácidos das proteínas? A partir dessas informações dá para agrupar elas em família de proteínas • Família de proteína – banco de dados • sequência de aminoácidos - características estruturais e características funcionais • Relações evolutivas • Função • Previsão da Estrutura Tridimensional • Localização celular, modificação química, meia-vida (tempo que vai ser ativa) Relação Função X Sequência de aminoácidos: • Comparação entre diferentes peptídeos: Hormônio tireoidiano, Glucagon (associado ao baixo nível glicêmico 1 cadeia) e insulina (alta de glicose 2 cadeias) • São unidos por ligações de sulfeto e resíduos de sisteina CONSIDERANDO ESSES NÍVEIS DE ESTRUTURA A PROTEÍNAS PODEM SER CLASSIFICADAS EM FIBROSAS E GLOBULARES: Fibrosas: bagunçados • 1- Cadeias longas e folhas • 2. Tipo simples de estrutura secundária • 3. Função – estrutural, suporte e proteção • 4. Caracterizadas por proporcionar resistência e flexibilidades às estruturas onde ocorrem, são insolúveis em água. Ex: colágeno, queratina, fibroína Globulares: arrumados • Cadeias esféricas ou globulares • 2. Diversos tipos de estrutura secundária • 3. Função – enzimas, reguladoras e de defesa • 4. Cadeia polipeptídica se dobra formando uma estrutura compacta - diversas estruturas e funções • 5. Grupos hidrofóbicos interior e hidrofílicos exterior – pontes H com a água - solúveis • 6. Ex: Hemoglobina, albumina e as globulinas PÁGINA 5 AS PROTEÍNAS PODEM SE ENOVELAR EM DIFERENTES FORMATOS: • As proteínas globulares, são parecidas com o novelo, onde os fios estão enrolados e organizados. • Já as proteínas fibrosas são iguais ao fio desenovelado. PROTEÍNAS FIBROSAS: estirada e dura • Função Estrutural: Suporte, forma e proteção externa (força, flexibilidade) • Grande parte da cadeia polipeptídica apresenta a mesma estrutura secundária (alfa-hélice ou folha beta) • São sempre insolúveis devido ao seu alto conteúdo de aminoácidos hidrofóbicos • São encontrados no cabelo, pena, chifre e casco PROTEÍNAS FIBROSAS: α- -QUERATINAS: • As proteínas fibrosas são formadas por cadeias longas e estendidas, com formato regular. Por exemplo, as α-queratinas são formadas pela associação lateral de duas ou três cadeias em α‐hélice, formando longos cabos laterais. • Por isso, as α‐queratinas são ricas em aminoácidos hidrofóbicos (Ala, Val, Ile, Met e Phe). • As α-queratinas são produzidas pelas células epiteliais de vertebrados e são os principais constituintes de pele e estruturas relacionadas, tais como cabelo, unha, chifres, cascos, bicos e penas. • A formação de pontes de dissulfeto entre as cadeias confere grande resistência as fibras de α-queratina. • Proliferamente: são várias cadeias que vão se dobrando uma na outra, ate forma uma estrutura mais complexa • α-QUERATINAS: São α-hélices ricas em aminoácidos hidrofóbicos (Ala, Val, Ile, Met e Phe). Quanto maior a quantidade de ligações de sulfato mais resistente vai ser. PROTEÍNAS FIBROSAS: Β-QUERATINAS Outra proteína fibrosa importante é a fibroína, constituinte da seda e do fio das teias produzidas por aranhas. A fibroína e uma β-queratina, formada por cadeias polipeptidicas com estrutura de folha β pregueadas, ricas em aminoácidos de cadeia lateral pequena (Gly, Ala, Ser). Por que seda não sofre estiramento: por que ele e formada basicamente, essas fibras por estrutura b blequiada, são mis estiradas então ela não tem essa expansão, aumentando de tamanho. Por conta da estrutura secundaria dela. PÁGINA 6 PROTEÍNAS FIBROSAS: COLÁGENO Colágeno é formado por três cadeias polipeptídicas em hélice enroladas umas às outras, formando longas fibras. Pontes de dissulfeto e outras ligações especiais conectam as diferentes fibras de colágeno, dando-lhes uma resistência maior que a do aço. Colágeno é constituinte do tecido conectivo: cartilagens, tendões, ossos e a córnea do olho. O que é a Hydroxiprolina?? • 1- Aminoácido não-padrão formado a partir da Prolina • 2- Hidroxilação (inserção de OH) no carbono 4 • 3- Enzima Responsável= Hidroxilase (dependente de Vitamina C) • 4- Carência de Vitamina C = incapacidade de síntese de colágeno • 5- Escorbuto = Descoberta nas grandes navegações. Indivíduos apresentaram sangramento na gengiva, pois não a dieta era carente em vitaminas (C) e, portanto, a síntese de colágeno era prejudicada. OS DIFERENTES TIPOS DE COLÁGENO: • Pelo menos 29 tipos diferentes de colágenojá foram identificados • Colágenos do tipo I, II e III são os principais componentes dos tendões e cartilagens, dando sustentação para o tecido. • O colágeno-IV, que contem menos pro e, portanto, e mais flexível, e importante componente da lâmina basal que dá sustentação para as células dos vasos sanguíneos. Proteínas Globulares: • Polipeptídeos dobrados em forma de “bola” • Razão comprimento/largura menor que 10 • Solúveis em água, ou dispersões coloidais • Podem assumir uma grande variedade de formatos. • Ex: Hemoglobina, albumina e as globulinas • Diversidade estrutural -> funcional Proteínas Globulares podem ter os 2 tipos de Estrutura Secundária: e uma mistura entre a-hélice e folha-b em forma bem compacta Padrão estrutural: • compactas • interior hidrofóbico • superfície polar • pares iônicos / ligações H • exemplo: caseína PÁGINA 7 função das proteínas: Proteínas Simples (formada apenas por resíduos de aminoácidos) e conjugadas (e uma proteína que está associado um grupo prostético): grupo prostético – são grupadas em diferentes classes ex: lipoproteína – lipídios Proteínas Transportadoras de Gases Hemeproteínas: Mioglobinas – musculo\ 1 única cadeia de aminoácidos e globulares Hemoglobinas – 4 cadeias são tecidas, são duas cadeias alfa e duas beta Cada proteína tem sua característica, que está associado à sua função. Complexidade da estrutura globular proteica: • Mioblobina: estocagem de O2 e facilita a difusão de do O2 nos tecidos musculares em contração • -1 única cadeia polipeptídica de 153 resíduos e um grupo heme (ferro- protoporfirina) ele leva o oxigênio para os músculos • -8 segmentos hélice relativamente retas, interrompidas por dobras, • -Cadeias laterais dos aa refletem a estabilidade é resultante das interações hidrofóbicas • -A maioria dos aa hidrofóbicos estão no interior da molécula (núcleo hidrofóbico) Por que são chamadas de Hemeproteínas Globulares? Por que dentro do grupo fe, estabilizado por 4 ligações hidrogênio e outra ligação ele faz de histidina distal e outro no oxigênio onde leva para o musculo. • Heme= grupo prostético fortemente ligado (está dentro de Mioglobina/Hemoglobina) • Hemoglobina e Mioglobina= ligação do O2 • Mioglobina= estocagem de O2 no músculo • Hemoglobina= transporte de O2 para os tecidos (dentro dos eritrócitos) faz síntese endógena – nosso corpo produz São anéis tatabericos – composto por carbono e hidrogênio Interação reversíveis de uma proteína com um ligante: Proteínas de ligação ao O2 • Molécula que interage de modo reversível com uma proteína: LIGANTE • SÍTIO DE LIGAÇÃO: complementar no tamanho, carga, caráter hidrofílico ou hidrofóbico. Afinidade por cor • Mudanças conformacionais = ENCAIXE INDUZIDO • Diferenças das enzimas – por que a proteína leva já a enzima e capaz de transforma PÁGINA 8 Obs; por que o oxigênio não consegue se difundir facilmente pelas células, por que ele e um gás e não consegue de difundir, aí vem as proteínas e leva ele para os musculo e ai ele se desliga da proteína – só transportes o oxigênio. Mioglobina: • Função – estocagem O2 – músculo • Localização: Muscular • Animais mergulhadores: grande quantidade de mioglobina • Ex: animais mergulhadores – grande quantidade de mioglobina para poder suporta a quantidade de tempo que vai ficar sem respirar estoque • Conforme vai precisando da mioglobina ela vai soltando o oxigênio • Sem a heme essa proteína não consegue fazer o transporte de proteína Hemoglobina Estrutura Quaternária (Tetramérica) Função: transporte de O2 (pulmonar) para os tecidos • 2 a - 141 aa • 2 b - 146 aa Cada um apresenta o grupo heme sendo superior a mioglobina O O2 do sangue é transportado pela Hemoglobina: MAS ONDE ESTÁ LOCALIZADA A HEMOGLOBINA? A hemoglobina está dentro dos eritrócitos dão pigmento vermelhado do sangue – células vermelhas ferro O2 transportado pela hemoglobina dos eritrócitos • Pequenos discos bicôncavos (6 a 9 um diâmetro) • Não possuem núcleo e mitocôndrias. • Citoplasma rico em Hemoglobina • Produzidos da Medula óssea e tem tempo de vida de 120 dias para a maioria dos mamíferos, por isso sempre produz, pois essas células morrem Estrutura Hemoglobina: • Proteína tetramérica= 4 grupos heme • - 2 tipos de Globina: duas cadeias a - (141 resíduos cada) e duas Cadeias b (146 resíduos cada) • - Cadeias ligadas: pontes de H, interações hidrofóbicas • Mudança estrutural: estado R e T (relaxado - oxigênio e tenso – sem oxigênio) • Faz o transporte de o2 dos pulmões para os tecidos • Quando não tem oxigênio e quando tem sofre essa mudança r e t PÁGINA 9 A Hemoglobina liga-se ao O2 de modo cooperativo: Modelo para a ligação cooperativa - S= Oxigênio – vai se ligando aos poucos deforma cooperativa Conforme vai se ligando o S muda sua conformidade Hemoglobina: Mudança estrutural: estado R e T - O QUE SIGNIFICA O ESTADO TENSO (T) E RALAXADO (R) DA HEMOGLOBINA?? • O2: maior afinidade pela Hemoglobina no Estado R (PULMÕES = Oxi- hemiglobina) • Estado T: mais estável (forma predominante= TECIDOS= Desoxiemoglobina) • O2 ligado a hemoglobina no estado T desencadeia mudança conformacional • Para o estado R • Tenso e relaxado: estabilizado por pares de íons A Hemoglobina liga-se ao O2 de modo cooperativo: Hemoglobina liga o O2 nos pulmões e libera nos tecidos Hemoglobina 4 grupos Heme – Grau de saturação: 0 -100% - capacidade de ligação como 02 mais perto de 100 oxigênio tem mais. Baixa afinidade O2 (T= tecidos) e alta afinidade de 02 (R = Pulmões) , a medida que aumenta o número de O2 ligadas Curva Sigmóide: liga-se a O2 onde pO2 é alto, e libera nos tecidos (pO2 é baixo) tipo s, alta afinidade nos pulmões, e uma baixa afinidade nos tecidos onde e po2 – pressão de 02 e menor. Quais são os fatores que ajudam na liberação de O2: 2,3-Bifosfoglicerato: regula a ligação de O2 com a Hemoglobina – muda sua conformação • BPG (carga -5) é atraído pelas cargas + • Se liga mais fortemente na conformação T, na conformação R o bolsão fica menor. Mais forte nos tecidos e fraco no pulmão • Passa do tenso para o relaxado – libera o oxigênio • A mudança do estado r para o t ele e estabilizado por pares de íons Hemoglobina também transporta H+ e CO2: no transporte de o2 as proteínas estão trabalhando e produz co2 PÁGINA 10 MAS COMO ISSO ACONTECE?? Vamos recordar com se forma o Tampão Bicarbonato Através de uma reação espontânea de co2 vira h+ e co3 H2o +co2-> h2co3 – h2co3 ->h +hco3 O que fazer com o H+?? ela se liga na hemoglobina e levada até o pulmão e vai ser convertida em co2 Como levar até o Pulmão para que a reação inversa aconteça e o CO2 seja eliminado? A hemoglobina co2 volta para o pulmão, onde a gente elimina através da respiração. Transporta produtos finais da respiração celular H+ e CO2 (pulmões e rins) CO2 + H2O -> H2CO3 -> H+ + HCO3 Anidrase Carbônica • H+= diminuição do pH dos tecidos • Ligação da Hemoglobina com O2 influenciado pelo pH e concentração de CO2 • Interconversão CO2 e bicarbonato = regulação da ligação do O2 e liberação no sangue Efeito Bohr: Hb + O2 HbO2 HHb + O2 HbO2 + H+ 1- O2 e H+ não se ligam ao mesmo sítio da hemoglobina 2- O2 se liga aos átomos de Fe do Heme, enquanto o H+ se liga a qualquer resíduo de aa da proteína Proteínas do Músculo: actina e miosina • São fibrosas, alongadas e resistentes, são proteínas com uma característica bem diferente • Força contrátil do músculo: interação de actina e miosina • Proteínas em Filamentos: deslizamento causando contração • 80% da massa proteica do músculo Miosina: 6 subunidades (extremidade carboxila: alfa hélice enrolada; e na amino Sítio para hidrólise ATP) forma filamentos grossos da mais estrutura Céls. Musculares: agregados de miosina formam FILAMENTOS GROSSOS (eixo central da unidade contrátil)PÁGINA 11 Actina: Monômeros de actina (actina G) associa-se a polímero longo (actina F) Filamento fino: actina F + troponina e tropomiosina – regula o processo de contração e 3 subunidades, como se fosse um cordão que envolve a actina Contração muscular: deslizamento dos filamentos grosso e finos Como isso acontece – actina se aproxima do domínio motor e acontece a contração São formados por eixos – eixos largos relaxados e eixos juntos tenso Sistema Imunológico e Imunoglobulinas: Os anticorpos têm 2 sítios de ligação aos antígenos idênticos, proteínas de defesa do corpo Imunoglobulina G (IgG): principal classe de anticorpo e proteína mais abundante no soro do sangue São formadas por 4 cadeias sendo 2 cadeias pesadas e 2 cadeias leves, essas cadeias são interligadas através de ligações de sulfeto e a gente tem o sitio de ligação complementar onde liga o antígeno. PÁGINA 12 PÁGINA 13 TÍTULO 2 Talvez você goste da foto na página de rosto tanto quanto nós, mas se ela não é ideal para o seu relatório, é fácil substituí-la por uma foto sua. Apenas exclua a imagem do espaço reservado. Depois, na guia Inserir, clique em Imagem para selecionar uma de seus arquivos.
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