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Avaliação On-Line 3 (AOL 3) - Questionário xxxxxxxxxxx Nota final Enviado: /xx/xx xx:xx (BRT) 10/10 Conteúdo do exercício 1. Pergunta 1 /1 A aplicação da técnica por homologia em estudos e predição de compostos bioativos se desenvolve a partir do uso de ferramentas computacionais para determinação de estruturas 3D de proteínas. Em que ponto esse método é baseado para justificar essa denominação? Ocultar opções de resposta 1. Em confluência de dados parametrizados 2. Em propriedades físico-químicas da micromolécula 3. Na função de cada proteína 4. Na similaridade entre moléculas proteicas Resposta correta 5. Em função da densidade eletrônica 2. Pergunta 2 /1 A complexidade da estrutura proteica depende do tipo e da quantidade de aminoácidos constituintes. Existem proteínas constituídas por uma única cadeia polipeptídica, já outras podem ser constituídas por duas ou mais cadeias polipeptídicas. Quando essas cadeias são idênticas, a proteína é dita oligomérica, e as subunidades são chamadas de protômeros. Dois fatores limitam o tamanho da proteína, assinale a alternativa que apresente um fator que embora ocorra em baixa quantidade pode representar um problema complicado na síntese de proteínas grandes. Ocultar opções de resposta 1. A capacidade genética da célula 2. A frequência de erros durante a síntese Resposta correta 3. A precisão da síntese proteica 4. A fonte de informações biológicas para a síntese 5. O percentual de aminoácidos aromáticos 3. Pergunta 3 /1 Em modelagem Molecular de Proteínas existe a opção de se empregar um método muito eficiente para a análise da complementariedade e efetividade no processo de interação entre o fármaco e a proteína receptora, trata-se da ‘docagem molecular’. Aponte, entre as alternativas abaixo, aquela que revela a principal vantagem desse método, em relação ao tempo de acoplamento. Ocultar opções de resposta 1. A vantagem consiste na rapidez dos cálculos paramétricos 2. O tempo computacional não interfere nesse caso 3. A vantagem consiste na obtenção da estrutura 3D do receptor 4. Apresenta menor tempo computacional que as demais técnicas Resposta correta 5. Apresenta igual tempo computacional às demais técnicas 4. Pergunta 4 /1 Avançando-se para o processo de otimização e visualização da molécula proposta, ainda que tenham sido utilizados programas que atenderam à qualidade pretendida, frequentemente se faz necessário usar recursos de minimização de energia e análise conformacional interativamente para otimizar essa molécula. Assinale, entre as alternativas abaixo, aquela que justifica esse procedimento. Ocultar opções de resposta 1. O desconhecimento da estrutura tridimensional 2. Ambiguidade de geometrias para as moléculas geradas 3. A incapacidade do programa em gerar figuras 4. Distorções frequentes na estrutura da molécula gerada Resposta correta 5. Instabilidade do banco de dados 5. Pergunta 5 /1 O enovelamento da proteína será definido pelos ângulos de torção anteriores e posteriores ao carbono central (o alfa) na cadeia peptídica, sendo de fundamental importância o programa identificar esses ângulos. Qual das alternativas aponta a contribuição do Diagrama de Ramachandran para a identificação dos ângulos de torção. Ocultar opções de resposta 1. A facilidade de decodificação do diagrama 2. A esquematização em gráficos para cada resíduo de aminoácido Resposta correta 3. A disponibilidade de informações de ângulos diedros 4. O sistema facilitado de diagramação 5. O cálculo angular 6. Pergunta 6 /1 A complementariedade, na interação fármaco-receptor, foi explicada por vários modelos, hoje sendo compreendida por meio das propriedades interativas características da estrutura molecular da micromolécula que definem o grau de afinidade pela molécula receptora e o percentual de resposta que determinará as condições para que a resposta terapêutica esperada aconteça. Assinale abaixo a alternativa que indica o fenômeno responsável para que os grupamentos funcionais e as propriedades estruturais do fármaco exerçam a complementariedade no sítio receptor da macromolécula. Ocultar opções de resposta 1. A estereoespecificidade da molécula bioativa Resposta correta 2. Os ângulos de torção do fármaco 3. O pH do meio reacional 4. A natureza química da molécula receptora 5. A natureza química do fármaco 7. Pergunta 7 /1 Dentre as inúmeras contribuições que a interdisciplinaridade constituída pela Química e a Informática, certamente a mais significativa tem sido o suporte tecnológico para a compreensão dos problemas da química experimental. Em ‘quimioinformática destaca-se a importância do uso de descritores moleculares para a representação de uma estrutura química. Qual seria a maior vantagem, em relação a outros métodos, com o uso desses descritores? Ocultar opções de resposta 1. A possibilidade de representação tridimensional 2. A demonstração da disposição dos átomos envolvidos 3. A aplicação de similaridade química 4. O suporte de informações relevantes 5. Aumento da capacidade de incorporar informações Resposta correta 8. Pergunta 8 /1 O formato PDB permite armazenamento de informações sobre a técnica experimental usada para determinação da estrutura, detalhes sobre a macromolécula, origem, fonte, forma de obtenção, referências dos artigos relacionados à estrutura depositada e as coordenadas atômicas, devido a qual característica das listadas abaixo? Ocultar opções de resposta 1. Por ser o mais utilizado 2. Domínio público 3. Capacidade de restringir informações 4. Por ser rígido Resposta correta 5. Pela flexibilidade do formato 9. Pergunta 9 /1 Para que se possa descobrir e estudar a forma como atua um fármaco no organismo, é necessário conhecer também a estrutura da macromolécula receptora que se constitui no alvo farmacológico. Qual é a estratégia ‘in silico’ mais utilizada para esse estudo atualmente? Ocultar opções de resposta 1. PDB 2. ISIS 3. SBDD Resposta correta 4. LBDD 5. CADD 10. Pergunta 10 /1 Em uma situação real na qual o pesquisador precisa escolher a melhor estratégia, em termos da química computacional, para iniciar o processo de modelagem, qual seria o um dos pontos fundamentais a serem considerados, em relação à infraestrutura? Ocultar opções de resposta 1. Quantidade de máquinas Resposta correta 2. Criação da base de dados 3. Custo computacional 4. Especificação de métodos para a extração de características 5. Tamanho do sistema a ser estudado