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Material de Estudo - Modelagem Molecular - 36 1. Qual campo da química computacional utiliza princípios da mecânica clássica para simular o comportamento de átomos e moléculas, permitindo o cálculo de propriedades como energia e estrutura? a) Química quântica. b) Mecânica molecular. c) Dinâmica molecular. d) Docking molecular. e) Modelagem homóloga. Resposta: b) A mecânica molecular usa campos de força clássicos. 2. Qual método computacional da química quântica resolve a equação de Schrödinger para sistemas moleculares, fornecendo informações detalhadas sobre a estrutura eletrônica e propriedades? a) Mecânica molecular. b) Dinâmica molecular. c) Docking molecular. d) Métodos ab initio. e) Métodos semiempíricos. Resposta: d) Métodos ab initio resolvem a equação de Schrödinger sem parâmetros empíricos. 3. Qual técnica de simulação computacional acompanha a evolução temporal de um sistema molecular, calculando as trajetórias dos átomos com base nas forças interatômicas? a) Otimização geométrica. b) Varredura conformacional. c) Dinâmica molecular. d) Docking molecular. e) Modelagem homóloga. Resposta: c) A dinâmica molecular simula o movimento dos átomos ao longo do tempo. 4. Qual método computacional é utilizado para prever a orientação preferencial e a afinidade de ligação de uma molécula pequena (ligante) a uma macromolécula biológica (receptor), como uma proteína? a) Modelagem homóloga. b) Dinâmica molecular. c) Docking molecular. d) Farmacóforo. e) QSAR (Relação Quantitativa Estrutura-Atividade). Resposta: c) O docking molecular simula a interação ligante-receptor. 5. Qual abordagem de modelagem molecular utiliza informações estruturais de proteínas homólogas com sequências de aminoácidos semelhantes para prever a estrutura tridimensional de uma proteína de interesse? a) Modelagem de novo. b) Modelagem por encaixe (threading). c) Modelagem homóloga. d) Dinâmica molecular. e) Refinamento de estrutura. Resposta: c) A modelagem homóloga se baseia em estruturas de proteínas relacionadas. 6. Qual representação simplificada de uma molécula é utilizada em modelagem molecular, focando nas características essenciais para a interação com um alvo biológico, como grupos funcionais e propriedades físico-químicas? a) Fórmula estrutural completa. b) Modelo de esferas (CPK). c) Modelo de bastões (stick). d) Farmacóforo. e) Superfície molecular. Resposta: d) Um farmacóforo descreve as características moleculares essenciais para a atividade biológica.