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P r o f a . M e . C I N T H I A AP. D E AN D R AD E S I LVA a p a r e c i d a s u c r o @ u e m s . b r ÁGUA UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MATO GROSSO DO SUL UNIDADE UNIVERSITÁRIA DE DOURADOS CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS 1 • Não é uma biomolécula verdadeira; • É o composto químico mais abundante (60- 85% massa total celular); • Alta polaridade - dissolve a maioria das macromoléculas (exceto lipídios); • Distribui-se em dois ambientes: líquido intracelular (LIC) e líquido extracelular (LEC), ex: plasma sanguíneo. ÁGUA 2 P r o f a . M e . C I N T H I A AP. D E AN D R AD E S I LVA a p a r e c i d a s u c r o @ u e m s . b r PROTEÍNAS UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MATO GROSSO DO SUL UNIDADE UNIVERSITÁRIA DE DOURADOS CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS 3 P r o f a . M e . C I N T H I A AP. D E AN D R AD E S I LVA a p a r e c i d a s u c r o @ u e m s . b r Aminoácidos UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MATO GROSSO DO SUL UNIDADE UNIVERSITÁRIA DE DOURADOS CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS 4 INTRODUÇÃO PROTEÍNAS 1. Macromoléculas abundantes 2. Presente em todas as células 3. Diferentes tipos em uma única célula 4. Instrumentos através dos quais informações genéticas são expressas 5. Construídas a partir do conjunto de 20 aa 6. São encontradas em pequenos peptídeos a enorme polímeros 7. Combinações diferentes de aa, podem gerar enzimas, hormônios, anticorpos, antibióticos 5 São compostos orgânicos simples que constituem as subunidades monoméricas das biomoléculas proteínas. Apresentam em sua molécula um grupo amino (-NH2) e um grupo carboxila (-COOH). AMINOÁCIDOS Fig 1. Estrutura geral de um aminoácido. 6 CARACTERÍSTICAS GERAIS • São as unidades fundamentais das proteínas. • Todas as proteínas são formadas a partir da ligação em sequência de apenas 20 aminoácidos. • Alguns aminoácidos especiais só aparecem em alguns tipos de proteínas. • Possuem características estruturais em comum, como a presença de um carbono central, quase sempre assimétrico ligado a um grupamento carboxila, um grupamento amino e um átomo de hidrogênio. 7 O QUE É UM CARBONO ASSIMÉTRICO? Arranjo te t raédr ico dos orb i ta is l igantes ao redor do átomo de carbono α , com quat ros grupos d i ferentes. 8 ESTRUTURA GERAL O quarto ligante é um radical "R”; Responsável pela diferenciação entre os 20 aa; É a cadeia lateral dos aminoácidos. É o radical "R" que define as características dos aa, tais como polaridade e grau de ionização em solução aquosa. 9 ESTEREOISÔMEROS 10 Os quatros grupos diferentes podem ocupar dois arranjos espaciais únicos e, os aa possuem 2 arranjos espaciais únicos e 2 possíveis estereoisômeros. NOMENCLATURA E ISOMERIA 11 • Aminoácidos com grupamento R apolar ou hidrofóbico - são os menos solúveis, devido à ausência de grupamentos hidrofílicos no grupamento R. Cadeia alifática hidrocarbonada: alanina, leucina, isoleucina, valina e prolina; Enxofre: metionina; Hidrogênio: glicina. Classificação quanto a sua composição e polaridade do grupamento R 12 Alanina, Valina, Leucina e isoleucina: tendem a se aglomerar entre si nas proteínas, estabilizando a estrutura proteica através de interações hidrofóbicas. Glicina: Estrutura simples, agrupa-se com aa apolares, mas não contribui de maneira significativa com as ligações hidrofóbicas. Metionina: Possui átomo de enxofre. Prolina: Estrutura cíclica. Classificação quanto a sua composição e polaridade do grupamento R 13 • Aminoácidos com grupamento R aromáticos – são relativamente apolares (hidrofóbicos). Todos podem participar de interações hidrfóbicas. Grupo hidroxil: Tirosina; Anel benzeno: Fenilalina; Átomo de nitrogênio: Triptofano. Tirosina: Devido ao grupo hidroxil podem formar ligações de hidrogênios. Grupo importante na formação de enzimas. Tirosina e Triptofano: Mais polares que a fenilanina. Devido ao grupo hidroxil da tirosina e ao atomo de nitrogênio do anel indólico do triptofano. Classificação quanto a sua composição e polaridade do grupamento R 14 • Aminoácidos com grupamento R polar não-carregado - possuem grupamentos hidrofílicos (solúveis em água) na cadeia carbonada que não se ionizam, porém conferem maior solubilidade ao aminoácido. Hidroxila: serina, treonina; Grupo amida: asparagina e glutamina; Sulfidrila: cisteína. • Aminoácidos com grupamento R polar carregado positivamente (básicos) - todos possuem grupamento R de 6 carbonos e a carga positiva localiza-se em um átomo de nitrogênio do R. • Lisina, arginina e histidina Classificação quanto a sua composição e polaridade do grupamento R 15 Classificação quanto a sua composição e polaridade do grupamento R 16 • Aminoácidos com grupamento R polar carregado negativamente (ácidos) - se ionizam em pH fisiológico adquirindo carga negativa no grupamento carboxila (-COO-) Aspartato e glutamato Metade dos aminoácidos é sintetizada pelo organismo enquanto a outra metade precisa estar presente na dieta: • Aminoácidos essenciais - aqueles que não são sintetizados, precisando estar presentes na dieta. Ex. arginina, fenilalanina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, triptofano, valina. • Aminoácidos não-essenciais - aqueles que são sintetizados no organismo. Ex. alanina, aspartato, asparagina, cisteína, glicina, glutamato, glutamina, prolina, serina, tirosina. CLASSIFICAÇÃO QUANTO AS SUAS FUNÇÕES 17 A função energética dos aminoácidos não é sua principal função. Entretanto, são importantes fontes de energia durante o exercício físico intenso e de longa duração: • Aminoácidos glicogênicos - fornecem substrato para a neoglicogênese. • Aminoácidos cetogênicos - fornecem substratos para a síntese de acetil-CoA (ciclo de Krebs), mas não podem ser convertidos em glicose. • Aminoácidos ceto-glicogênicos - fornecem substratos para ambas as vias. 18 19 • 4-hidroxiprolina*: Derivado da prolina • 5-hidroxilisina*: Derivado da lisina. Encontrado em proteínas de Parede Celular de plantas. • *Ambos em colágeno: proteína fibrosa dos tecido conectivos. • 6-N-metil-lisina: Constituinte da miosina. • γ-carboxiglutamato: Presente na proteína de coagulação do sangue. • Desmosina: Derivado de quatro resíduos de Lys, presente na proteína elastina. • Selenocisteína: Raro; Introduzido durante a síntese proteica. Contém selênio. • Ornitina e Citrulina: Intermediários-chaves (metabólitos) na biossíntese de arginina e no ciclo da uréia. OUTROS AMINOÁCIDOS - Incomuns 20 21 • Atividade óptica - com exceção da glicina, todos os aminoácidos naturais apresentam atividade óptica desviando a luz polarizada para a direita ou para a esquerda. • Solubilidade - é relativamente elevada em água e reduzida em solventes orgânicos. • Ponto de fusão - é bastante elevado, sendo normalmente acompanhado de decomposição da estrutura química original PROPRIEDADES FÍSICAS DOS AMINOÁCIDOS 22 Os grupamentos amino e ácido, encontram-se na forma ionizada quando em solução e funcionam como bases e ácidos fracos. Dependendo do pH, o grupamento amino com carga positiva (forma catiônica) ou o grupamento ácido com carga negativa (forma aniônica), podem predominar. Porém, em determinado pH (pH isoelétrico),haverá somente uma forma dipolar (ou seja, positiva e negativa ao mesmo tempo, zwitterions), onde será observada uma neutralidade elétrica na molécula. Substâncias com esta natureza dual são anfóteras ou anfólitos. 23 PROPRIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS DOS AMINOÁCIDOS PROPRIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS DOS AMINOÁCIDOS pH isoelétrico (pHi ou pI) Ponto isoelétrico - é o valor de pH em que as cargas positivas e negativas são iguais constante de dissociação das reações químicas de igualdade de concentração entre a formas catiônica com a forma dipolar (pK1) constante de dissociação das reações químicas de igualdade de concentração entre a forma aniônica com a forma dipolar (pK2) 24 PONTO ISOELÉTRICO PI: É o ponto isoelétrico, onde a carga líquida total da molécula de aminoácido ou proteína é nula. PK1 e PK2: São os pontos constantes de equilíbrio da dissociação dos grupos ácidos e básicos de um aminoácido. Pk1 referente ao grupo COOH Pk2 referente ao grupo NH3+ PkR referente ao grupo R Forma catiônica: pH < pI Forma aniônica: pH > pI, pH ↓ ou ↑ do pI: deficiência ou excesso de H+ na solução, respectivamente solução tampão - solução em equilíbrio entre um ácido fraco e sua base conjugada 26 PROPRIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS DOS AMINOÁCIDOS Durante a titulação de um aminoácido é possivel notar a desprotonação; afinal todos os aminoácidos possuem pelo menos dois grupos ácido-base (-COOH e –NH3). Exemplo: Glutamato Sofre 3 perdas de prótons: Primeira: em PH =2,19 Segunda: em PH =4,25 Terceira: em PH =9,67 Primeira perda de próton Segunda perda de próton Terceira perda de próton PH PROPRIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS DOS AMINOÁCIDOS PONTO ISOELÉTRICO Valor de PH onde a molécula está neutra, ou seja, quantidade de cargas positivas e negativas passam a ser iguais. Aminoácidos neutros pI= (pK1 + pK2)/2 Aminoácidos com cadeia ácida (-) pI= (pK1+pKR)/2 Aminoácidos com cadeia básica (+) pI= (pK2 + pKR)/2 Exemplo: Glutamato PI= (pKi +pKR)/2 PI = (2,19 + 4,25)/2 PI = 3,22 Ou seja, em PH = 3,22 CARGA LÍQUIDA * Carga Líquida = C.L C.L = C.L = C.L = +1 + 0 = +1 +1 -1 = 0 0 – 1 = -1 30 PROPRIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS DOS AMINOÁCIDOS P r o f a . M e . C I N T H I A AP. D E AN D R AD E S I LVA a p a r e c i d a s u c r o @ u e m s . b r Peptídeos UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MATO GROSSO DO SUL UNIDADE UNIVERSITÁRIA DE DOURADOS CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS 31 PEPTÍDIOS São polímeros de aminoácidos obtidos através de ligações carbono-nitrogênio, chamadas ligações peptídicas. Ligações peptídicas - envolvem o radical amino (-NH2) de um aminoácido e o radical ácido (-COOH) de um outro, havendo a liberação de uma molécula de água durante a reação LIGAÇÕES PEPTÍDICAS 33 Reações de condensação; Grupo carboxil ( )modificado ou ativado – grupo hidroxil ( )eliminado. Polipeptídeo ≤ 10.000 (massas moleculares) Proteínas ˃ 10.000 (massas moleculares) CLASSIFICAÇÃO QUANTO AO NÚMERO DE AMINOÁCIDOS • Dipeptídeo: união entre 2 aminoácidos • Tripeptídeo: união entre 3 aminoácidos • Tretapeptídeo: união entre 4 aminoácidos • Pentapeptídeo: união entre 5 aminoácidos • Oligopeptídeo: até 30 aminoácidos • Polipeptídeo: > 30 aminoácidos Ligações peptídicas 36 PROPRIEDADES DAS LIGAÇÕES PEPTÍDICAS COMPORTAMENTO DE IONIZAÇÃO DOS PEPTÍDEOS 38 Grupos α-aminos e α-carboxil de todos os aminoácidos não terminais estão covalentemente unidos na ligação peptídica - não ionizam – não contribuindo para o caráter ácido-básico dos peptídeos. Os grupos –R podem ionizar. Esses grupos contribuem para o caráter ácido-básico de uma molécula. 39 COMPOSIÇÃO DE AA EM PROTEÍNAS 40 Para ser calculado o número aproximado de resíduos de aa em proteína simples, sem outros constituintes químicos: Divide-se a massa molecular/110* *Massa média de todos os aa 138; Média de aa é 128 Massa da água 18 Por isso, 110. CADEIAS POLIPEPTÍDICAS EM PROTEÍNAS GRUPOS QUÍMICOS 42 Proteínas conjugadas: contem componente químicos associados permanentemente aos aminoácidos. Grupo prostético: a parte não aminoacídica de uma proteína conjugada. Ex: lipoproteínas, glicoproteínas e metaloproteínas. EXERCÍCIOS 1. Faça o peptideo: Ala-Glu-Gly-Lys (Alanilglutamilglicilisina)e indique onde é a extremidade aminoterminal e carboxiterminal. 2. Calcule o PI da Histidina sabendo que: 3. Escreva as estruturas dominantes da Glicina em Ph 2, 7 e 11. Dica: Complete os quadrados com “?” lembrando que ocorre desprotonação. EXERCÍCIOS 1 EXERCÍCIOS 2 EXERCÍCIOS 3
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