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Profa. Maria Amélia Menck Soares Genética Molecular Mutação e reparo do DNA Casos clínicos – Xeroderma pigmentoso 3 anos de idade 14 anos de idade Xeroderma pigmentoso • Distúrbio hereditário, autossômico recessivo; • Incidência estimada mundial: 1/250.000; • Luz ultravioleta mudanças químicas no DNA (sardas intensas e câncer de pele); • A consanguinidade dos pais está presente em uma porcentagem dos casos. Mutação de ponto Alterações na molécula de DNA Substituições Deleções Inserções Mutação: substituição de base Pirimidina T A G C Purina Transição Transversão Transições e transversões Inserções e deleções • Mudança na matriz de leitura eleviuevanuacomana... (normal) elenviuevanuacomana... (inserção) elevievanuacomana... (deleção) Todas estas alterações (substituições, inserções e deleções) podem ter causas “naturais” Mutação • A duplicação precisa da molécula de DNA depende, em parte, da função de revisão da DNA polimerase (em média, um erro a cada 7 milhões de bases); • Mudanças herdáveis no material genético são chamadas de mutação; • O organismo que exibe fenótipo novo, resultante da mutação, é chamado mutante. Mutação • Mutações de ponto: mudanças em sítios específicos – substituição de um par de bases, inserção ou deleção de um ou alguns pares de nucleotídeos em um sítio específico de um gene; • A mutação é a principal fonte de variação genética. Mutação somática x germinativa • Mutação em células somáticas: apenas em células descendentes destas células – não será transmitida para a prole. • Mutações em células germinativas: seus efeitos podem ser expressos na prole. Podem ocorrer em qualquer estágio do ciclo reprodutivo (da célula germinativa primordial aos gametas). Mutação espontânea e induzida • Mutações espontâneas – sem causas conhecidas ou serem causadas por agentes desconhecidos, presentes no ambiente. • Mutações induzidas - resultam da exposição do organismo a agentes físicos ou químicos (mutágenos), como radiação ionizante, luz ultravioleta e uma ampla variedade de substâncias químicas. Mutações espontâneas • Fatores importantes: 1. Precisão da maquinaria de replicação do DNA; 2. Eficiência do reparo do DNA; 3. Grau de exposição a agentes mutagênicos presentes no ambiente; Mutação – um processo reversível • A distinção entre selvagem e mutante é arbitrária (dois fenótipos diferentes, mas normais). • Selvagem mutante (mutação direta) Restaura a seqüência de nucleotídeos selvagens: • Mutante selvagem (mutação reversa) 1. Retromutação – mutação no mesmo sítio 2. mutação supressora – uma segunda mutação que compensa os efeitos da primeira. Efeito fenotípico da mutação • Mudança fenotípica detectável – sutis até letais. • Mutações dominantes e recessivas Monoplóides (vírus e bactérias) – seu efeito pode ser reconhecido no próprio organismo. Diplóides – alterarão o fenótipo apenas em homozigose (a maioria não é reconhecida na época de sua ocorrência. Efeito fenotípico da mutação • Maioria das mutações - deletéria e recessiva Precursor intermediário 1 intermediário 2 produto enzima A enzima B enzima C (gene A) (gene B) (gene C) Mutação Mutação Mutação Alelo mutante a alelo mutante b alelo mutante c homozigose homozigose homozigose aa bb cc Precursor intermediário 1 intermediário 2 produto HbA = Hemoglobina de adulto (normal) •Quatro cadeias polipeptídicas (duas α e duas β) Hemoglobina Anemia Falciforme NormalAlterada Distúrbio hemolítico intenso resultante da substituição de 1 dos 146 aminoácidos da cadeia β-globina ALTERAÇÃO DE UM NUCLEOTÍDEO (A T) Substituição de ácido glutâmico por valina HbS Anemia Falciforme Herdada como caráter monogênico DNA da cadeia β da HbA: GTG-CAC-CTG-ACT-CCT-GAG-GAG-AAG... Proteína: Val-his-leu-ter-pro-glu-glu-lis... DNA da cadeia β da HbS: GTG-CAC-CTG-ACT-CCT-GTG-GAG-AAG... Proteína: Val-his-leu-ter-pro-val-glu-lis... Bases moleculares da mutação espontânea • Os átomos de hidrogênio podem se mover mudanças tautoméricas. Comum Rara Bases moleculares da mutação espontânea • mudanças tautoméricas. Comum Rara Mudanças tautoméricas • Alteram o potencial de pareamento das bases. • No momento da duplicação uma tautomerização poderia resultar em uma incorporação incorreta: Adenina = Citosina Guanina ≡ Timina Mutação causada por tautomeria ACGTC TGCAG Replicação ACGTC TGCAG ACGTC T GTAG ACATC T GTAG ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG Replicação Mutante Mutações induzidas • Agentes químicos • Agentes físicos • Agentes biológicos Agentes químicos Gás mostarda: primeira substância química demonstrada como mutagênica (usado na primeira guerra como agente químico incapacitante – sintoma imediato, até 12 horas depois, vesículas e queimaduras. Seu efeito mutagênico só foi divulgado depois da segunda guerra. Soldado vitimado 1918 Transferem grupos alcil (CH3-, CH3-CH2-, etc), para o DNA Alteram o pareamento de bases Mutágenos químicos • 1. Apenas para o DNA replicante: análogos de base (ex: 5-bromouracila). • 2. Mutagênico para o DNA replicante e não replicante: (ex: ácido nitroso). Análogos de bases Timina 5-bromouracila Forma ceto 5-bromouracila Forma enol 5-BU (ceto) Adenina 5-BU (enol) Guanina Pode ser incorporado ao filamento nascente: Ceto : adenina Enol : guanina Efeito mutagênico da 5-bromouracila Ácido nitroso • Atua no DNA replicante ou não; • Converte os grupos amino em grupos ceto (desaminação). H H N Desaminação H2O NH3 O Ácido nitroso • Atua no DNA replicante ou não; • Converte os grupos amino em grupos ceto Mutações induzidas • Agentes químicos • Agentes físicos • Agentes biológicos Espectro eletromagnético Radiação ionizante Radiação não ionizante Mutações induzidas por radiação Radiação ionizante (de alta energia): • Diagnóstico médico (penetram nos tecidos); • Colidem com átomos e causam a liberação de elétrons; • Os íons formados colidem com outras moléculas e causam a liberação de elétrons adicionais; Mutações induzidas por radiação Radiação ionizante: • Forma um cone de íons ao longo do caminho. • Também induz a grandes mudanças nos cromossomos, como deleções. Mutações induzidas por radiação Radiação não ionizante (menor energia): • Nos organismos multicelulares, apenas as células epidérmicas são expostas ao seu efeito; • Dissipam sua energia para átomos que encontram e elevam os elétrons para órbitas mais externas (excitação); quimicamente mais reativas Radiação ultravioleta (UV): É absorvida pelas bases nitrogenadas; • Potente mutágeno para organismos unicelulares. • Formam dímeros de pirimidina Nem toda mutação é percebida Mutação silenciosa: alteração no códon não altera o aminoácido (diferentes códons para o mesmo aminoácido) Mutação de sentido trocado: mudança de aminoácido Mutação sem sentido: formação de códon de parada (TAA, TAG, ou TGA) Reparo do DNA Mecanismo de reparo do DNA E. coli 1.Reparo dependente da luz (fotorreativação); 2.Reparo por excisão; 3.Reparo de mau pareamento; 4.Reparo pós-replicação; 5.Sistema de reparo propenso a erro. Reparo dependente de luz (Fotorreativação) Clivagem de ligações cruzadas de dímero de timina (dímeros de citosina e também dímeros de citosina-timina) Reparo por excisão 1.Reparo por excisão de base: Remove bases anormais ou quimicamente modificadas 2. Reparo por excisão de nucleotídeo: Remove defeitos maiores, como dímeros de timina Reparo porexcisão de nucleotídeo Uvr – significa reparo de UV Uma proteína trimérica reconhece o defeito no DNA Causa dobras no DNA defeituoso com a energia do ATP O dímero UvA é liberado A proteína UvC liga-se ao complexo UvB-DNA A proteína UvB cliva a 5ª ligação fosfodiester 3’ A proteína UvC cliva a 8ª ligação fosfodiester 5’ A UvD helicase libera o dodecâmero excisado *Em humano esta via de reparo envolve cerca 17 polipeptídeos *A enzima XPA (xeroderma pigmentoso) reconhece os nucleotídeos danificados e recruta outras proteínas *Em humano o oligômero tem 29 nucleotídeos Reparo por mau pareamento (proteínas Mut) Corrige nucleotídeos mau incorporados após replicação Como as proteínas de reparo sabem qual foi o nucleotídeo adicionado incorretamente? Adeninas são metiladas após a síntese em sítios GATC Ocorre um intervalo durante o qual o filamento molde é metilado e o recém-sintetizado não é metilado Reparo pós-replicação A DNA polimerase III não adiciona nucleotídeo no local de erro Neste ponto a seqüência original é perdida em ambos os filamentos O reparo é feito por um mecanismo de recombinação (pela proteína RecA) Sistema de reparo propenso a erro *DNA fortemente danificado. *Reparo SOS : bateria de reparos, recombinação e proteínas de replicação. Aumenta a freqüência de erros Parece ser tentativa desesperada de escapar dos efeitos letais do DNA muito danificado
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