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AULA 5- ENZIMAS/AULA -Enzimas.pdf Enzimas Enzimas • Catalisadores das reações nos sistemas biológicos • �aceleram as reações metabólicas • A maioria das enzimas são proteínas • Exceção ribozimas (moléculas de RNA com atividade catalítica) ESQUEMA DE UMA REAÇÃO ENZIMÁTICA E + S ES E + P AB � A+ B AB � [AB-enzima] � A + B A+ B � C AB � [AB-enzima] � C Nomenclatura • Sufixo –ase adicionado ao nome do substrato da reação. Ex.: amilase (degrada amido) • Descrição da ação da enzima. Ex. lactato desidrogenase (retira H (e-) do lactato) Substrato – é a substância que sofre a ação da enzima Classificação Catalisam reações de oxidação - redução Lactato H Piruvato Lactato desidrogenase 1. Oxirredutases 1. Oxirredutases Catalisam reações de transferências de C-, N- ou P- serina glicina Serina hidroxi- metil transferase 2. transferases 2. Transferases Catalisam quebras de ligações pela adição de H2O uréia urease 3. Hidrolase 3. Hidrolases Catalisam reações de quebra de C-C, C-S e C-N Piruvato Acetaldeído Piruvato descarboxilase 4. Liases 4. Liases Catalisam rancemização de isômeros ópticos ou geométricos Metil-malonil CoA Succinil CoA Metilmalonil CoA mutase 5. Isomerases 5. Isomerases Catalisam a formação de ligações entre o Carbono e O, S, N, acoplada a hidrólise de fosfatos de alta energia Piruvato oxalacetato Piruvato carboxilase 6. Ligases 6. Ligases Enzimas Peso molecular 12mil a 1milhão Algumas enzimas requerem uma molécula inorgânica para suas funções (co-fator) e/ou moléculas orgânicas (co-enzimas) Parte proteica Enzima + co-fator ou co- enzima Fração não protéica = coenzima ou co-fator Fração protéica = Apoenzima Holoenzima = Coenzima + Apoenzima Co-fatores Co-enzimas Coenzimas/cofatores Propriedades das enzimas • Sítios ativos – região específica onde o substrato se liga • Eficiência catalítica – aceleram reações em 103 a 108 vezes • Especificidade – interagem com apenas um ou alguns substratos e catalisam apenas um tipo de reação • Regulação – a atividade pode ser ativada ou inibida • Localização celular – compartimentalização em organelas isola substratos e produtos Sítios ativos enzima substrato Visão planar enzima substrato Sítio ativo •Local onde o substrato se liga •Toda a estrutura tridimensional da enzima é importante para a ligação do substrato Modelo Ajuste induzido Chave fechadura Os aminoácidos Aspartato, Glutamato, Histidina, Lisina, Cisteína e Tirosina são os que, freqüentemente, estão presentes no sítio catalítico de enzimas que funcionam através do mecanismo catálise acido-basica Residuo de doador de próton aceptor de proton aminoácido nucleófilos H+ -COO- R2-C=NH+enzima H+ -COO- R2-C=NH+ enzima Especificidade • Absoluta – quando a enzima só aceita um substrato Ex.: a Urease só aceita a Uréia • Relativa – quando a enzima só aceita uma classe de substrato. Ex.: Lipase aceita todos os lipídeos. • Estereoquímica – ocorre quando a enzima distingue dois isômeros especiais. Eficiência catalítica Mitocôndria •Ciclo do ácido cítrico •Oxidação de A.G •Oxidação do piruvato Citosol •Glicólise •Sintese de ácidos graxos (A.G.) Núcleo •Síntese de DNA e RNA Lisossomos •Degradação de moléculas complexas Localização celular – as enzimas se localizam em organelas diferentes que isolam substratos e produtos, permitindo que ocorram reações de catabolismo e anabolismo Mecanismo de ação enzimática • Alterações de energia que ocorrem durante a reação – Energia livre de ativação – Velocidade de reação – Rota alternativa de reação • Química do sítio ativo – Estabilização do estado de transição – Outros mecanismos Não há uma diferença na energia livre global de reações catalisadas ou não catalisadas Energia livre de ativação (catalisada) Energia livre de ativação (não- catalisada) Estado de transição T E n e r g i a l i v r e ( G ) reagentes produtos Energia livre de ativação A T B Transformação de A em B tem um estado de transição de alta energia As enzimas atuam diminuindo a energia de ativação do substrato (transformação de A� T) Facilitando a transformação de T� B Estabilização do estado de transição no sítio ativo Velocidade de reação enzima substrato produto S = substrato E = enzima ES = complexo enzima-substrato P = produto K1, k-1, k2 = constante da velocidade Velocidade de reação A velocidade da reação pode ser calculada pela Equação de Michaelis -Menten Considerações • Concentração relativa E e S – [S] é muito maior que [E] – [ES] é pequena em qualquer momento • Hipótese do Estado de equilíbrio – [ES] não varia com o tempo – Velocidade de E+S � ES é igual a velocidade ES � E+P • Velocidade inicial – Quando adiciona E + S Velocidade de reação Km – constante de Michalis e Menten K m - é a concentração de substrato necessária para se atingir a Metade -velocidade máxima da reação. Significado de K m - dá a idéia da afinidade da enzima com o substrato. K m baixo � alta afinidade da enzima com o substrato K m alto � baixa afinidade da enzima com o substrato Concentração de substrato [S] V e l o c i d a d e d e r e a ç ã o Fatores que afetam a velocidade de reação • Concentração de substrato • Temperatura • pH • Inibidores / reguladores Temperatura Inativação térmica da enzima V e l o c i d a d e d e r e a ç ã o Aumento da velocidade com aumento da temperatura (energia nas moléculas) , até um pico Diminuição da velocidade com temperaturas mais altas � desnaturação da enzima (o calor afeta a estrutura, a enzima perde a atividade) Temp ótima pH pepsina V e l o c i d a d e d e r e a ç ã o tripsina Fosfatase alcalina Efeito do pH sobre a ionização de sítios ativos Efeito do pH sobre a desnaturação da enzima O pH ótimo varia de acordo com a enzima pH ótimo Inibição da atividade enzimática Definição – é qualquer substância que diminua a velocidade da reação enzimática. Tipos de Inibidores a – competitivos b – não competitivos c – alostéricos Inibição competitiva •Inibidor Competitivos – é aquele cuja velocidade máxima não se altera com o aumento da concentração do substrato. 1- E + S ES E + P 2 - E + I EI (inativo) •Tem estrutura química semelhante ao substrato e compete com a enzima pelo mesmo sítio ativo (local onde a enzima deve ligar-se) Gráfico de um inibidor competitivo segundo Michaelis-Mentem competitivo V máx � a velocidade máxima pode ser atingida com aumento [S] Km � inibidor competitivo aumenta o Km aparente, mais [S] é necessário para chegar ao Km Inibição não competitiva •INIBIDOR NÃO COMPETITIVO – é aquele que se liga a enzima por qualquer lugar que não seja o seu sítio ativo. •Esse tipo de inibidor se caracteriza pelo fato de um aumento da [S] não deslocar o inibidor. Gráfico de um inibidor não competitivo segundo Michaelis-Mentem V máx � a velocidade máxima NÃO consegue ser atingida com aumento [S] Km � inibidor não competitivo não interfere na ligação ES, assim o Km não altera com a presença do inibidor não competitivo Inibição mista Regulação da atividade enzimática • Efetores homotrópicos – Substrato no sítio da enzima aumenta as propriedades catalíticas de outros sítios de ligação ao substrato • Efetores heterotrópicos – Efetor é diferente do substrato (ex inibidor alostérico) Regulação da atividade enzimática • Sítios alostéricos de ligação Regulador alostérico Reguladora por ligação covalente reversível Fosforilase fosfatase Fosforilase quinase Reguladora por clivagem proteolítica A enzima apresenta peptídios ligadas que a torna inativa A ligação com estes peptídios precisam ser quebradas para que a enzima torne ativa AULA 5- ENZIMAS/APS5-Enzimas.pdf UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ – CÂMPUS FRANCISCO BELTRÃO Bioquímica 1 (BIO001) Profa Elisabete Hiromi Hashimoto APS5 – Enzimas 1) Explique qual é a função das enzimas nos sistemas biológicos: 2) O que são ribozimas? explique a importância destas: 3) Defina sítio catalítico e explique os modelos chave-fechadura e ajuste induzido 4) Defina grupo prostético, dê 3 exemplos de co-fatores e co-enzimas: 5) Apresente exemplos de reação das 6 classes de enzimas: 6) Quais são as características das enzimas que as destacam como catalisadores enzimáticos? 7) De que forma as enzimas aumentam a velocidade das reações? 8) Defina Km e correlacione com afinidade da enzima com substrato: 9) Quais são as principais classes de inibidores enzimáticos e como estes atuam?
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