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REVISÃO DAS AUL AS 1 E 2 P R O F E S S O R A T H A I S NOMENCLATURA DE MICRO- ORGANISMOS Nomenclatura • Nomes científicos são em latim • 2 nomes – o gênero é o primeiro, iniciado com letra maiúscula; o segundo nome é o epíteto específico (nome das espécies), • em letra minúscula • O gênero e o epíteto são escritos em itálico ou sublinhados. • Após um nome científico ter sido mencionado uma vez, ele pode ser abreviado • Ex.: Staphylococcus aureus BACTÉRIAS • Bacilos • Cocos • Espirilos • Podem formar pares, cadeias, grupos • Geralmente se reproduzem por fissão binária • Nutrição: compostos orgânicos encontrados na natureza ou fotossíntese ou compostos inorgânicos ARCHEA • Arqueobactérias • Divididas em três grupos principais – Metanogênicas produzem metano como resultado da respiração – Halofílicas extremas (halo = sal; filo = amigo) vivem em ambientes muito salinos – Termofílicas extremas (termo = quente) vivem em águas sulfurosas e quentes • As arquibactérias não são conhecidas como causadoras de doenças em humanos. FUNGOS • Eucariotos • Unicelulares (leveduras) ou multicelulares • Não realizam fotossíntese • Parede celular composta principalmente por quitina. • Fungos típicos: bolores (fungos filamentosos) formam micélios, compostos de longos filamentos (hifas) • Reprodução sexuada e assexuada • Nutrição: absorção de soluções de matéria orgânica PROTOZOÁRIOS • Os protozoários (do latim, protozoa, singular: protozoan) são micróbios unicelulares eucarióticos • Se movimentam por meio de pseudópodes, flagelos ou cílios • Apresentam uma variedade de formas • Vida livre ou parasitas • Ex.: amebas ALGAS • As algas (do latim, algae, singular: alga) são eucariotos fotossintéticos • Ampla variedade de formas • Reprodução sexuada e assexuada • Parede celular composta de um carboidrato chamado de celulose. • Abundantes em água doce e salgada, no solo e em associação com plantas • Fotossintetizadoras (necessitam de luz, água e dióxido de carbono) • As algas produzem oxigênio e carboidratos VÍRUS • Menores micro-organismos • Acelulares • Partícula viral simples • DNA ou RNA • Parasitas intracelulares obrigatórios BIORREMEDIAÇÃO – BACTÉRIAS LIMPANDO A POLUIÇÃO • Necessidade nutricional das bactérias é semelhante à dos humanos • Provocam deterioração de alimentos • Algumas bactérias metabolizam substâncias tóxicas (metais pesados, enxofre, nitrogênio gasoso, petróleo e mercúrio) • Essas bactérias que degradam poluentes estão presentes naturalmente no solo e na água, mas em números baixos O QUE SÃO OS COMPOSTOS ORGÂNICOS E INORGÂNICOS? • São a base da alimentação dos micro-organismos • Compostos inorgânicos : moléculas, geralmente pequenas e de estrutura simples, que tipicamente não contêm carbono. – Ex: água, O2, CO2, sais, ácidos e bases • Os compostos orgânicos: sempre contêm carbono e hidrogênio e sua estrutura típica é complexa. – Ex.: açúcares, aminoácidos e vitaminas TECNOLOGIA DO DNA RECOMBINANTE • Os micro-organismos podem ser modificados geneticamente para a fabricação de uma grande quantidade de hormônios e outras substâncias • Paul Berg mostrou que fragmentos do DNA (genes) humano ou animal podem ser ligados ao DNA bacteriano • O híbrido resultante foi o primeiro exemplo de DNA recombinante. • Quando o DNA recombinante é inserido dentro das bactérias (e outros micro-organismos),pode ser utilizado para produzir uma grande • quantidade de proteínas desejadas. • A tecnologia do DNA recombinante une duas áreas relacionadas: a genética microbiana e a biologia molecular • Genética microbiana estuda os mecanismos pelos quais os micro-organismos herdam suas características • Biologia molecular estuda como a informação genética é transmitida nas moléculas de DNA e como o DNA direciona a síntese de proteínas. UTILIZAÇÃO DE MICRO-ORGANISMOS • Reciclar os elementos vitais do solo e da atmosfera – Os micro-organismos são os principais responsáveis pela conversão de alguns elementos químicos (carbono, nitrogênio, oxigênio, enxofre e fósforo) em formas que podem ser utilizadas por plantas e animais • Tratamento de esgotos • alimentos comuns e compostos químicos MICROBIOTA NORMAL • Variedade de micro-organismos dentro do corpo. • Não faz mal • Pode ser em alguns casos ser benéfica • Papel da microbiota – Proteger contra as doenças por prevenir o crescimento de micro-organismos nocivos – Produzir substâncias úteis como vitamina K e algumas vitaminas do complexo B • Quando certa microbiota normal sai do seu nicho, ela pode causar doença. BIOFILMES • Micro-organismos atados uns aos outros e/ou a uma superfície em geral sólida. • Benéficos capazes de proteger as membranas mucosas de agentes nocivos • Nocivos capacidade de causar infecções • Biofilmes oferecem uma barreira protetora contra a ação antibiótica. Figura 1.8 Biofilme sobre um cateter. A bactéria Staphylococcus liga-se nas superfícies sólidas, formando uma camada limosa. As bactérias liberadas deste biofilme podem causar infecções. BIOFILMES – Placa bacteriana – ATB eliminam a primeira camada de biofilme, porém as bactérias continuam a se multiplicar – Bactérias se grudam por açúcares e fazem troca de informações entre bactérias de diferentes células – Podem produzir toxinas ou transferir genes de resistência por plasmídeos REVISÃO DAS ESTRUTURAS BACTERIANAS DANO À PAREDE CELULAR • Lisozima – Enzima que catalisa a hidrolise das pontes entre os açúcares nos dissacarideos da parede celular das gram- positivas – O conteúdo celular que permanece circundado pela membrana plasmática pode ficar intacto DANO A GRAM NEGATIVAS • As paredes celulares das bactérias gram-negativas são mais suscetíveis ao rompimento mecânico. • A membrana externa da célula gram-negativa consiste em lipopolissacarídeos (LPS), lipoproteínas e fosfolipídeos – Evasão da fagocitose – Barreira para certos antibióticos (p. ex., penicilina) – Barreira para enzimas digestivas (lisozima, detergentes, metais pesados, sais biliares e certos corantes) • Quando bacterias gram-negativas morrem, elas liberam lipideo A, que funciona como uma endotoxina – Febre, dilatação de vasos venosos, choque e formação de coágulos sanguíneos MEMBRANA PLASMÁTICA (CITOPLASMÁTICA) • Bicamada lipídica • Glicoproteínas • Glicolipídeos • Digestão de nutrientes • Produção de energia • Permeabilidade seletiva METABOLISMO E FISIOLOGIA MICROBIANA P R O F E S S O R A T H A I S NECESSIDADES NUTRICIONAIS • Autotróficos • Heterotróficos • Cultivo in vivo e in vitro – Carbono, nitrogênio, sais minerais, fatores de crescimento e água – Temperatura, pH, potencial osmótico, aeração etc. O QUE OS MICRO- -ORGANISMOS COMEM? • Assimilação dos nutrientes ocorre através de reações enzimáticas • Reações catabólicas (decompositoras) • Reações anabólicas (biossíntese) • Ingestão ou fagocitose (poucos micro-organismos) • As principais vias metabólicas são: a) Glicolítica b) Fermentativa c) Respiração aeróbia d) Respiração anaeróbia a) Fotolitotróficos ou fotoautotróficos luz (fonte de energia) e CO2 (fonte de carbono) Ex. bactérias fotossintetizantes (cianobactérias) c) Quimiolitotróficos compostos inorgânicos (gás sulfídrico, enxofre, amônia, gás hidrogênio, ferro) (energia) e CO2 (carbono) b) Fotorganotróficos Luz (energia) e compostos orgânicos (álcool, carboidratos, etc.) (carbono.) Ex. bactérias verdes não sulfurosas (Chloroflexus) e bactérias púrpurasnão sulfurosas (Rhodopseudomos)na d) Quimiorganotróficos campostos orgânicos como fontes de energia e de carbono. Ex. a maioria das bactérias, fungos e protozoários. O QUE OS MICRO-ORGANISMOS COMEM? PH a) Acidófilos b) Mesófilos c) Alcalófilos a) Aeróbios b) Anaeróbios c) Microaeróbios d) Anaeróbios facultativos AERAÇÃO As bactérias apresentam melhor crescimento a pH 7, com tolerância entre 4 a 8. VIAS METABÓLICAS • Respiração: glicólise, ciclo de Krebs e cadeia de transporte de elétrons Os organismos liberam e armazenam energia Via metabólica é a sequência de reações químicas catalisadas por enzimas ocorrendo em uma célula A principal fonte de energia são os carboidratos (principalmente glicose) Produção de energia a partir de carboidratos: respiração celular e a fermentação glicose Ácido pirúvico Acetil-CoA CO2 ATP NADH Glicólise ATP NADH FADH2 Ciclo de Krebs ATP Reações de oxidação- redução Cadeia de transporte de elétrons REAÇÕES CATABÓLICAS E ANABÓLICAS metabolismo soma de todas as reações químicas dentro de um organismo vivo Anabolismo Catabolismo liberam energiaconsomem energia formações de proteínas a partir de aminoácidos, de ácidos nucleicos a partir de nucleotídeos, e de polissacarídeos a partir de açúcares simples. quando as células quebram açúcares em dióxido de carbono e água. ATP armazena a energia derivada de reações catabólicas e a libera posteriormente para dirigir as reações anabólicas • Catabolismo parte da energia é perdida como calor e parte está disponível para as funções celulares • A célula precisa de energia • Necessidade de novas fontes externas • As vias metabólicas da célula (sequências de reações químicas) produzem energia – Determinadas por suas enzimas – Enzimas são determinadas pela constituição genética da célula. ENZIMAS • Catalisadores biológicos. • Cada uma atua em um substrato • A função: acelerar as reações bioquímicas a uma temperatura que seja compatível com o funcionamento normal da célula. • Enzimas são proteínas, podento ter uma porção proteica chamada de apoenzima e um componente não proteico chamado de cofator (ex.: íons de ferro, zinco, magnésio ou cálcio) RESPIRAÇÃO CELULAR • Processo gerador de ATP no qual moléculas são oxidadas Aeróbica Utiliza O2 Ciclo de Krebs Libera CO2 Anaeróbica Não utiliza O2 e pode ser morto por ele Somente uma parte do ciclo de Krebs funciona sob condições anaeróbicas Rendimento de ATP menor Os anaeróbicos tendem a crescer mais lentamente TESTES BIOQUÍMICOS E IDENTIFICAÇÃO BACTERIANA • Detectar a presença de enzimas • Teste de fermentação – Meio testado contém proteínas, um único carboidrato, um indicador de pH e um tubo de Durham invertido para capturar gás • Bactérias utilizam a proteína ou o carboidrato como fonte de carbono e energia. • Utilizam carboidrato produzem ácido, o indicador de pH muda de cor. • Produzem gás bolha no tubo de Durham CRESCIMENTO BACTERIANO P R O F E S S O R A T H A I S INTRODUÇÃO • Crescimento bacteriano = aumento do número de células (não do tamanho) • Controlar o crescimento dos micro-organismos que causam doenças ou deterioração de alimentos • Como estimular o crescimento de micro-organismos benéficos • Fatores que controlam o crescimento: – Físicos: temperatura, pH e pressão osmótica – Químicos: fontes de carbono, nitrogênio, enxofre, fosforo, oxigênio, elementos traços e fatores orgânicos FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES FÍSICOS TEMPERATURA • a) Psicrófilos: ótimo crescimento a 10ºC, – Toleram entre -10ºC a 20ºC – Ambientes glaciais; • b) Psicrotróficos: ótimo crescimento a 20ºC – Toleram entre 0ºC a 30ºC. – Ambientes refrigerados; • c) Mesófilos: ótimo crescimento a 35ºC – Toleram entre 10ºC a 45ºC. – Ambiente e da microbiota humana e de animais; • d) Termófilos: ótimo crescimento a 60ºC – Toleram entre 40ºC a 70ºC. – Compostagem ou processos térmicos; • e) Extremófilos: ótimo crescimento a 90ºC – Toleram entre 65ºC a 110ºC. – Ambientes quentes (vulcões, regiões termais, gêiser). FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES FÍSICOS • pH – Melhor crescimento perto da neutralidade – Acidófilas (resistentes à acidez) – Quando bactérias são cultivadas no laboratório, elas com frequência produzem ácidos que algumas vezes interferem com o seu próprio crescimento FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES FÍSICOS • PRESSÃO OSMÓTICA – Isotônico x hipertônico x hipotônico – Hipertônico com sal ou açúcar: peixe salgado, mel e leite condensado (preservação de alimentos) FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES QUÍMICOS • Carbono – Esqueleto estrutural – Proveniente de proteínas, carboidratos e lipídeos ou dióxido de carbono • Nitrogênio, exofre e fósforo – Nitrogênio amino aminoácidos proteínas – Enxofre aminoácidos contendo enxofre proteínas – Enxofre tiamina e biotina – Fósforo ácido nucléico e fosfolipídeos FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES QUÍMICOS • Elementos traços – Quantidade muito pequena – Ferro – Cobre – Molibdênio – Zinco – Estão presentes na água de torneira FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES QUÍMICOS • Oxigênio Escherichia coli Clostridium spp. Lactobacilos Campylobacter jejuniSalmonella spp. • Por que o oxigênio causa danos nos seres anaeróbios? – Oxidação de componentes celulares essenciais – A oxidação gera radicais livres e outras espécies tóxicas de derivados do O2 – O2 pode inibir algumas enzimas de organismos anaeróbios • As bactérias aneróbias obrigatórias não produzem enzimas peroxidase e superóxido dismutase, que elimina os radicais peróxido e superóxido do metabolismo oxigenativo. • Portanto, as que não formam esporos, morrem em presença do oxigênio. FATORES QUE CONTROLAM O CRESCIMENTO FATORES ORGÂNICOS • Vitaminas • Aminoácidos • Purinas • Pirimidinas • Muitas bactérias sintetizam suas próprias vitaminas • Algumas bactérias não possuem as enzimas necessárias para a síntese de certas vitaminas CURVA NORMAL DE CRESCIMENTO BACTERIANO • Crescimento de forma assexual por fissão binária ou cissiparidade 1. Alongamento 2. Replicação do DNA 3. Invaginação da membrana e da parede celular Tempo de geração Escherichia coli TG: 20 minutos Mycobacterium tuberculosis TG >18 horas Fase log: conhecida como fase logarítmica ou de crescimento exponencial. Divisão constante das células, duplicando a população a cada geração. Intensa atividade metabólica Fase lag: fase adaptativa ou de latência. Cél ativa intensamente seu metabolismo, porém não se multiplica. Pode levar horas ou dias Fase estacionária: nº céls novas sendo geradas diminui, equivalendo-se ao nº de células destruídas. Há multiplicação mas não crescimento; alta competitividade por espaço e nutrientes. Início da esporulação Fase de declínio: multiplicação rara; população decresce; escassez nutricional e formação de substâncias tóxicas. Algumas bactérias conseguem se manter viável por longo tempo, mesmo nestas condições. AUL A 4 GENÉTICA BACTERIANA P R O F E S S O R A T H A I S GENOMA BACTERIANO • Características estruturais (morfologia) • Reações bioquímicas (metabolismo) • Motilidade • Capacidade de sobrevivência • Interação com outros microrganismos • Etc. DNA Transmitido entre gerações • Alta capacidade de mutação • Código genético doenças e atividademicrobiana • Genoma • Gene • Proteína • DNA • Bases nitrogenadas – Purinas: Adenina (A) e Guanina (G); – Pirimidinas: Citosina (C), Timina (T), Uracila (U) • Nucleotídeo: uma base ligada a um açúcar e um ou mais fosfatos CROMOSSOMO E PLASMÍDEO • Cromossomo bacteriano: uma única molécula de DNA • Plasmídio: informações não essenciais, com a mesma estrutura física do cromossomo, porém em menor quantidade de informações. • Os tipos de plasmídio são: F (sexual ou fertilidade), R (resistência), V (virulência), M (metabólico) etc. TRANSPOSONS • Elementos transponíveis, com capacidade de movimentar-se de um local para outro no genoma • Movimentam-se da fita de plasmídio para o DNA TRANSPOSONS • TIPOS DE TRANSPOSONS a) Sequência de inserção (SI): • Um gene que codifica a transposase e locais de • reconhecimento que são sequências curtas, invertidas de DNA; • b) Transposon (Tn): • são maiores que as SI e carreiam outros genes (como resistência, antagonismo, síntese enzimática) SÍNTESE PROTEICA: TRANSCRIÇÃO E TRADUÇÃO VARIABILIDADE GENÉTICA – MUTAÇÃO • Alterações ocorridas na sequência de nucleotídeos na molécula de DNA • É um fenômeno comum • Tem caráter evolutivo VARIABILIDADE GENÉTICA – MUTAÇÃO • Espontânea: falhas no mecanismo de replicação, onde um ou alguns pares de nucleotídeos são suprimidos ou inseridos no DNA); • Induzida: ocorre pela exposição aos agentes mutagênicos (ioniza o DNA) – Radiação (raios ultravioleta, raios X, raios gama): – Corantes, antibióticos, metais pesados, drogas, calor etc. • Mutações pontuais PROCESSOS DE TRANSFERÊNCIA DE GENES • Micro-organismos transferem material genético entre si • A transferência de genes pode ocorrer de três formas conhecidas: Transformação, conjugação e transdução PROCESSO DE TRANSFERÊNCIA DE GENES
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