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UFCSPA CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA AD2025 ARTHUR LUIZ SCHEEREN ROHR (TURMA B) ESTUDO DIRIGIDO – CICLO DE KREBS 1. Onde ocorre o ciclo de Krebs? O ciclo de Krebs ocorre na matriz da mitocôndria. 2. A acetil-CoA é o substrato inicial do ciclo de Krebs. Ela tem uma estrutura complexa formada por um grupo acetil unido à coenzima A. a) Qual a origem do grupo acetil? O grupo acetil tem origem na oxidação total de moléculas orgânicas, como piruvato (originado a partir da glicose), ácidos graxos e aminoácidos. b) Qual vitamina é importante na formação da coenzima A? É importante na formação da coenzima A a vitamina B5 (ácido pantotênico). c) O grupo acetil será incorporado ao ciclo de Krebs. Ele irá doar 4 pares de elétrons e dois carbonos. Qual o destino desses carbonos no ciclo? Quem serão os aceptores (transportadores) desses elétrons? Os carbonos irão formar duas moléculas de CO2. E os aceptores desses elétrons serão três moléculas de NADH e uma de FAD2H. d) Qual a reação de incorporação do acetil ao ciclo de Krebs? A reação de incorporação do acetil ao ciclo de Krebs será a reação de condensação da Acetil-CoA com o Oxaloacetato, catalisada pela citrato sintase, originando citrato. e) Qual a importância ligação tiéster da acetil-CoA na incorporação do grupo acetil ao ciclo de Krebs? A ligação tio éster da acetil-CoA possui energia livre de hidrólise de valor grande e negativo. 3. Além do oxaloacetato e do citrato, quais são os demais intermediários metabólicos do ciclo de Krebs? Intermediários metabólicos do ciclo de Krebs: Isocitrato, α-Cetoglutarato, Succinil-CoA, Succinato, Fumarato e Malato. 4. Identifique as enzimas que participam do ciclo. Citrato sintase, aconitase, isocitrato desidrogenase, alfacetoglutarato desidrogenase, succinil-CoA sintetase, succinato desidrogenase, fumarase e malato desidrogenase. 5. Qual o intermediário metabólico que se regenera ao final do ciclo? Regenera-se ao final do ciclo o intermediário oxaloacetato. 6. Quais são as reações de oxi‐ redução e as reações onde ocorre descarboxilação oxidativa? Indique os nucleotídeos transportadores de energia (coenzimas) que participam dessas reações. Ocorre descarboxilação oxidativa na descarboxilação oxidativa do piruvato (coenzimas: TPP, ácido lipoico, coenzima A, FAD e NAD), na descarboxilação do isocitrato, na descarboxilação oxidativa do α-cetoglutarato (pirofosfato de tiamina, ácido lipoico, FAD, NAD e coenzima A). Ocorre reação de oxirredução na síntese do citrato, na isomerização do citrato, na clivagem da succinil-CoA, na oxidação do succinato (FAD), na hidratação do fumarato, na oxidação do malato. 7. O complexo α-cetoglutarato desidrogenase catalisa a descarboxilação oxitativa da α-cetoglutadato em succinil-CoA. Seu funcionamento é semelhante ao do complexo piruvato-desidrogenase que transforma o piruvato em acetil-CoA, na via glicolítica (glicólise aeróbica). Explique o funcionamento destas enzimas, identificando as vitaminas importantes para cada etapa da reação. A reação de descarboxilação oxidativa do α-cetoglutarato libera o segundo CO2 e produz o segundo NADH do ciclo. A enzima α-cetoglutarato descarboxilase utiliza a TPP (tiamina pirofosfato), que é a forma ativa da vitamina B1. A enzima transacilase utiliza o lipoato, que é sintetizado a partir de carboidratos e aminoácidos e não requer precursor vitamínico. A enzima di-hidrolipoil desidrogenase possui FAD (flavina adenina dinucleotídeo), formada a partir da riboflavina (vitamina B2). 8. Identifique a reação onde há formação de ATP em nível de substrato. Há formação de ATP em nível de substrato na reação de clivagem da Succinil- CoA (formação de succinato). 9. Qual a importância da ligação tioéster do succinl-CoA na formção do ATP em nível de subtrato? A clivagem da ligação tioéster de alta energia está acoplada à fosforilação de difosfato de guanosina (GDP), produzindo trifosfato de guanosina (GTP). O GTP e o ATP são energicamente interconversíveis pela reação da nucleosídeo-difosfato-cinase. 10. Quais são os produtos finais a cada volta do ciclo? A cada volta do ciclo obtém-se três moléculas de NADH, uma de FADH2 e uma de ATP. 11. Quais os destinos desses produtos? As moléculas de FADH2 e NADH serão enviadas à fosforilação oxidativa. E o ATP será armazenado nas células. 12. As reações de formação de isocitrato e de regeneração do oxaloacetato possuem um ΔG positivo. O que garante a formação destes compostos? O que garante a formação de oxaloacetato e isocitrato são as reações altamente exoergônicas da citrato-sintase e da aconitase, respectivamente. 13. Qual o ΔG total do ciclo de Krebs? Ele é uma rota metabólica espontânea no sentido de formação de seus produtos finais? O ΔG total do ciclo de Krebs é de -13kJ/mol. O ciclo de Krebs é uma rota metabólica espontânea no sentido de formação de seus produtos. 14. Intermediários do ciclo podem ser utilizados para a formação de diversos compostos celulares. a) Identifique os compostos que podem ser produzidos e seus precursores. Citrato produz ácidos graxos e esteroides. α-Cetoglutarato produz aminoácidos. Succinil-CoA forma porfirinas e radicais heme. Oxaloacetato forma aminoácidos. b) Como se denomina o conjunto de reações de reposição de intermediários do ciclo de Krebs? Qual é a principal reação de reposição e a vitamina necessária para que esta reação ocorra? Os intermediários do ciclo de Krebs são repostos por reações anapleróticas. A principal reação de reposição é a reação da Piruvato Carboxilase, na qual piruvato é convertido em oxaloacetato, que requer a coenzima biotina (vitamina B7). 15. Explique como o a relação NADH/NAD e ADP/ATP regulam o funcionamento do ciclo de Krebs. Quando as relações ADP/ATP e NADH/NAD estão elevadas, o estado metabólico está com energia suficiente e o complexo da piruvato-desidrogenase é alostericamente inibido. Quando essas relações decrescem, ocorre ativação alostérica da oxidação do piruvato. A velocidade do fluxo pelo ciclo de Krebs pode ser limitada pela disponibilidade dos substratos da citrato-sintase, oxaloacetato e acetil-CoA, ou de NAD, o qual é exaurido pela conversão a NADH, retardando as três etapas de oxidação dependentes de NAD. A inibição por retroalimentação por succinil-CoA, citrato e ATP também diminui a velocidade do ciclo pela inibição de etapas iniciais. 16. Há uma máxima da biologia que diz “um gene-uma proteína-uma função”. A aconitase é um exemplo de exceção. Explique a função da aconitase na regulação do metabolismo do ferro. Na falta de ferro, o centro Fe-S da aconitase citosólica se desmantela e a apoenzima (apoaconitase) forma a IRP1 (proteína reguladora do ferro). A IRP1 liga-se ao RNAm da transferrina, estabilizando-o, e liga-se ao RNAm da ferritina, inibindo a sua tradução. Assim, em células com deficiência de ferro, a captação de ferro torna-se mais eficiente e o armazenamento do ferro é reduzido. Quando a concentração celular de ferro retorna aos níveis normais, IRP1 é convertida a aconitase. 17. Qual a função do ciclo de Krebs e a sua importância no metabolismo celular? A função do ciclo de Krebs é promover a degradação de produtos finais do metabolismo dos carboidratos, lipídios e de diversos aminoácidos. Essas substâncias são convertidas em acetil-CoA, com a liberação de CO2 e H2O e síntese de ATP. Além disso, entre as diversas etapas do ciclo de Krebs são produzidos intermediários usados como precursores na biossíntese de aminoácidos e outras biomoléculas. Através do ciclo de Krebs, a energia proveniente das moléculas orgânicas da alimentação é transferida para moléculas carregadoras de energia, como o ATP, para ser utilizada nas atividades celulares.
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