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Problema 4 – Maquinaria Proteica 1) Definir o que é proteína É um polímero composto por monômeros (aminoácidos). Os aminoácidos têm a fórmula geral: Todos os aminoácidos têm uma cadeia lateral, ou grupo R (reativo). É o que propicia a propriedade dos aminoácidos. A ligação peptídica é formada por uma extremidade amino e outra carboxila entre dois aminoácidos, essa ligação ocorre por meio da desidratação intermolecular. Uma cadeia peptídica tem sempre uma extremidade amino (NH2) e uma extremidade carboxila (COOH). Possuem quatro níveis organizacionais, podem ser feitos através de mais uma cadeia polipeptídica. Possui função estrutural ou funcional. Funcional: Enzima, Hormônio Estrutural: Compor membrana, queratina. 2) Citar as organelas que participam da síntese proteica. Ribossomo mitocondrial, Ribossomo presente no citosol, Retículo Endoplasmático Rugoso e Núcleo (DNA, RNAm...). 3) Caracterizar o ribossomo. (Estrutura e função) É uma organela não membranosa. Consiste em uma subunidade pequena e uma grande, cada uma feita de RNA ribossômico e proteínas. Cada subunidade é composta de um a três tipos de RNAr e até 50 proteínas. As subunidades são caracterizadas por sua velocidade de sedimentação quando centrifugadas, então, seus nomes são derivados de seus coeficientes de sedimentação em unidades de Svedberg (S), que são uma indicação do tamanho molecular. Procariontes: Associação de uma subunidade 50s e uma 20s, formando uma 70s. Eucariontes: São formadas por uma parte 50s e 30s. 80 s. A subunidade menor tem sítios de ligação para o RNAm, RNAt e um sítio de saída. A subunidade maior se liga à subunidade menor e tem um RNAr especial que atua como enzima (riboenzima), a qual catalisa a formação de ligações peptídicas, formando polipeptídeos. Ou seja, a função do ribossomo é a produção, por meio da “comunicação do RNAm com o RNAt, a montagem da proteína, mediante a ação enzimática do RNAr (riboenzima), catalisando a formação de ligações peptídicas. São responsáveis por proteínas que permaneceram no citosol, ou serão incorporadas ao núcleo, mitocôndria, cloroplasto ou peroxissomo. → centro decodifcador garante que o apenas os anticodons do rnat serão aceitos no sítio → centro peptídio transferase onde ocorre a ligação peptídica inicio da tradução é colocar o primeiro aminoacil (anticodon) no sítio P do ribossomo e com isso vai estabelecer a leitura correta AUG(metionina) Alongamento→ mapa ribossomo fábrica cada aminoácido vai formandoi término quando o ciclo vai continuar até os códons finais UGA UAA UAG 5’→3’ 4) Caracterizar o retículo endoplasmático. (Estrutura e função) É constituído por uma rede de membranas que delimitam cavidades (cisternas, lúmen ou luz). Possui membranas lipoproteicas. O RE se estende a partir da carioteca e percorre grande parte do citoplasma, formando uma rede tridimensional de cavidades que se intercomunicam. Existem duas partes do retículo; O rugoso, que apresenta ribossomos na face de suas membranas, na forma de polirribossomos (associados ao RNAm), ocorre por meio da subunidade maior do ribossomo. As proteínas produzidas permanecem no próprio retículo, ou são transportadas para o complexo de Golgi, formam lisossomos, compõe a membrana plasmática ou são secretadas. - As cadeias polipeptídicas são segregadas nas cisternas. - Lâminas achatadas dispostas paralelamente. O liso que não apresenta tais organelas. - Vesículas globulares, ou como túbulos contorcidos, que podem ter continuidade com o RER. - Participa na síntese de lipídios. - No músculo, armazena cálcio. - Metaboliza o glicogênio. - Desintoxicação de substâncias nocivas. 5) Caracterizar os proteassomas. (Estrutura e função) São complexos multienzimáticos que se dispõem como um cilindro, contendo uma câmara central. Existem os proteossomos 20S e 26S. A câmara central é constituída por quatro anéis superpostos, cada um contendo sete enzimas. Os dois anéis internos contêm enzimas proteolíticas, ou seja, que degradam proteínas. Cada um deles apresenta três sítios ativos voltados para o interior da câmara, então, a atividade catalítica ocorre em ambiente isolado do citosol. - Os complexos 19S reconhecem e controlam a entrada das proteínas a serem degradadas, e ainda desnaturam essas proteínas para torná- las acessíveis aos sítios ativos das enzimas presentes na câmara proteolítica. - As proteínas que devem ser digeridas são marcadas por se ligarem covalentemente a diversas moléculas de uma proteína chamada ubiquitina. - A cada resíduo do aminoácido lisina, a proteína é marcada pela ubiquitina. Várias enzimas ativam a ubiquitina e promove sua ligação com o aminoácido. - A E1 cliva o ATP, ativando a ubiquitina. - A E2 apresenta-a para a E3. Ela liga-se à proteína a ser degradada e interage com E2 para estabelecer a ligação covalente, esse processo ocorre diversas vezes, formando uma cadeia de poliubiquitinas, que é a marca para a destruição da proteína. - É reconhecido pelo complexo 19S, que contém cadeias polipeptídicas com atividade de ATPase para fornecer energia para a atividade proteolítica. - As ubiquitinas são retiradas - As enzimas do complexo desnaturam a proteína e liberam seu acesso para a câmara proteolítica. – Penetra no complexo 20S, entrando em contato com os sítios ativos das enzimas proteolíticas, onde é clivada em peptídios, que são devolvidos ao citosol, no qual são digeridos até aminoácidos por enzimas citosólicas. Esses são reaproveitados. - São encontrados no núcleo, degradando enzimas envolvidas no processo de replicação e transcrição do DNA, bem como as enzimas que regulam o ciclo celular. - Pode ser regulada pelo estresse oxidativo intracelular, uma vez que uma das suas principais funções é degradar proteínas danificadas por radicais livres. * Em células cancerosas a atividade do proteossomo pode ser benéfica. * Diferenças estruturais e funcionais entre proteossomo 20S e 26S 20S - Câmara central 20S - Degrada proteínas não ubiquitinadas dobradas ou reunidas incorretamente - Independe do ATP. - Resistente ao estresse oxidativo 26S – Câmera central 20S e duas subunidades 19S - Degrada proteínas poliubiquitinadas, reguladoras da expressão gênica, apoptose e ciclo celular. - Regula os níveis enzimáticos da célula. - Degradação dependente do ATP e da ubiquitina. - Facilmente inativado em células durante o estresse oxidativo. * proteolitica for inativada é bom para o cancer
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