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14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 1/27 Nat Rev Microbiol. Manuscrito do autor; disponível no PMC 2017, 11 de fevereiro. Publicado na forma final editada como: Nat Rev Microbiol. 11 de agosto de 2016; 14 (9): 576–588. doi: 10.1038 / nrmicro.2016.89 PMCID: PMC5056591 NIHMSID: NIHMS809455 PMID: 27510864 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas Kai Papenfort e Bonnie Bassler Department of Biology I, Ludwig-Maximilians-University Munich, Martinsried, Germany Department of Molecular Biology, Princeton University, USA Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD 20815 Corresponding authors: Bonnie Bassler, bbassler@princeton.edu, Phone: +1-609-258-2857, Department of Molecular Biology, Princeton University, Lewis Thomas Laboratory, Washington Road, 08544 Princeton, NJ, USA, Kai Papenfort, kai.papenfort@lmu.de, Phone: +49-89-2180-74502, Department of Biology I, LMU, Munich, Biocenter, Groβhaderner Str.2-4, 82152 Martinsried, Germany Copyright notice Resumo / Prefácio As bactérias usam quorum sensing para orquestrar programas de expressão gênica que fundamentam comportamentos coletivos. O sensor de quorum depende da produção, liberação, detecção e resposta em nível de grupo às moléculas de sinalização extracelular, que são chamadas de autoindutores. Um trabalho recente descobriu novos autoindutores em bactérias Gram-negativas, mostrou como essas moléculas são reconhecidas por receptores cognatos, revelou novos componentes reguladores que estão embutidos em circuitos de sinalização canônicos e identificou novos projetos de rede regulatória. Nesta revisão, examinamos como, juntos, esses recursos dos sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum se combinam para controlar comportamentos coletivos em bactérias Gram-negativas e discutimos as implicações para associações microbianas hospedeiro e terapia antibacteriana. Introdução O sensor de quorum é um processo de comunicação célula a célula que permite que as bactérias modifiquem coletivamente o comportamento em resposta às mudanças na densidade celular e na composição de espécies da comunidade microbiana circundante. O sensor de quorum envolve a produção, liberação e detecção de todo o grupo de moléculas de sinalização extracelular, que são chamadas de autoindutores. Os autoindutores se acumulam no meio ambiente à medida que a densidade da população bacteriana aumenta. Bactérias monitoram mudanças na concentração de autoindutores para rastrear mudanças em seus números de células e para alterar coletivamente os padrões globais de expressão gênica. Os processos controlados por quorum sensing, como a bioluminescência, a secreção de fatores de virulência, a produção de bens públicos e a formação de biofilmes, são improdutivos e caros quando realizados por uma única célula bacteriana, . As bactérias Gram-positivas e Gram-negativas usam quorum sensing. Os sistemas Gram-positivos geralmente usam oligopeptídeos secretados e sistemas de dois componentes, que consistem em receptores de cinase sensores ligados à membrana e fatores de transcrição citoplasmáticos que direcionam as alterações na expressão gênica. Os papéis biológicos do quorum sensing em bactérias 1, # 2, 3, # 1 2 3 # 1 2 4 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=pubmed&retmode=ref&cmd=prlinks&id=27510864 https://dx.doi.org/10.1038%2Fnrmicro.2016.89 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27510864 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Papenfort%20K%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=27510864 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Bassler%20B%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=27510864 mailto:dev@null mailto:dev@null https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/about/copyright/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 2/27 Gram-positivas foram extensivamente revisados em outros lugares . Nesta revisão, enfocamos o quorum sensing em bactérias Gram-negativas e destacamos moléculas de sinalização incomuns, novos componentes regulatórios e heterogeneidade nas respostas de quorum sensing. Quatro características comuns são encontradas em quase todos os sistemas de detecção de quorum Gram-negativos conhecidos . Em primeiro lugar, os autoindutores em tais sistemas são acil- homoserina lactonas (AHLs) ou outras moléculas que são sintetizadas a partir de S- adenosilmetionina (SAM) e são capazes de se difundir livremente através da membrana bacteriana. Em segundo lugar, os autoindutores são ligados por receptores específicos que residem na membrana interna ou no citoplasma. Terceiro, o quorum sensing normalmente altera dezenas a centenas de genes que sustentam vários processos biológicos. Quarto, em um processo denominado autoindução, a ativação do sensor de quorum conduzida por autoindutor estimula o aumento da síntese do autoindutor, que estabelece um loop feed-forward proposto para promover a expressão gênica síncrona na população. Bactérias Gram-negativas freqüentemente usam vários autoindutores, e novos estudos estão revelando os determinantes moleculares que fornecem aos receptores uma especificidade extraordinária na distinção entre moléculas intimamente relacionadas. As informações de detecção de quorum são frequentemente integradas por pequenos RNAs (sRNAs) que controlam a expressão do gene alvo e que também funcionam em loops de feedback. As arquiteturas de rede de detecção de quorum promovem fidelidade de sinalização, controle temporal e dinâmica de entrada-saída flexível. Questões importantes sobre o sensor de quorum são: como as células bacterianas priorizam um autoindutor em detrimento de outro? Como os recursos de rede permitem um desempenho ideal? E quais são os requisitos que permitem que os sistemas de detecção de quorum sintonizem suas relações de entrada e saída aos estímulos variáveis? O sensor de quorum sustenta comportamentos coletivos que muitas vezes envolvem bens públicos caros . Colocar tais ativos sob controle coletivo evita sua exploração. No entanto, evidências recentes sugerem que os processos estocásticos também são relevantes; por exemplo, a heterogeneidade fenotípica que decorre de vias que são controladas por quorum sensing pode permitir a cobertura de aposta e a divisão de trabalho entre os membros constituintes de uma população bacteriana . Como a heterogeneidade individual pode ser inserida em processos que são executados de forma síncrona no nível da população, está sendo intensamente investigado . A heterogeneidade de detecção de quorum também pode ser crucial para células vizinhas que não são parentes próximos - por exemplo, na microbiota do hospedeiro . Autoindutores e outras moléculas que são produzidas por organismos procarióticos e eucarióticos podem ser usados para comunicação unilateral, bidirecional ou múltipla. A interpretação adequada das informações contidas nessas misturas químicas em nível individual e populacional pode ser crucial para a sobrevivência de células individuais e para a proteção do hospedeiro e de sua microbiota estabelecida de invasores bacterianos, fúngicos ou virais. De fato, em hospedeiros eucarióticos, os autoindutores fornecem funções probióticas, alteram a composição da microbiota, afetam a expressão de genes de virulência e estimulam a dispersão de patógenos dos biofilmes . Esta revisão se concentra em novos autoindutores bacterianos Gram-negativos, receptores, princípios de design que controlam arquiteturas de rede regulatórias e as respostas coordenadas que o sensor de quorum controla. Discutimos funções recém-descobertas que são mediadas por quorum sensing, destacamos sua relevância para comportamentos bacterianos coletivos, a possibilidade de heterogeneidade nas respostas de quorum sensing e enfatizamos papéis nas interações hospedeiro- bactéria. Autoindutores, receptores e especificidade As bactérias que vivem em populaçõesheterogêneas presumivelmente encontram misturas complexas de autoindutores que são produzidos por elas mesmas, seus irmãos clonais, parentes próximos e seus vizinhos não-parentes, que podem ser competidores ferozes . Assim, as bactérias enfrentam o desafio de extrair informações de misturas de moléculas relacionadas e não relacionadas. Esse problema é agravado pelo fato de que as bactérias frequentemente dependem da produção e detecção de vários autoindutores. Como as bactérias interpretam corretamente as combinações de moléculas que 2 - 4 5 6 7 8 9 10 11 7 , 12 , 13 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 3/27 são produzidas por elas mesmas e por outras espécies na vizinhança, e como elas provocam mudanças apropriadas e coordenadas na expressão do gene em resposta a essas combinações são questões importantes. Autoindutores Em bactérias Gram-negativas, os AHLs são a classe mais comum de autoindutores. Eles têm um anel N- acilado de homoserina-lactona central e uma cadeia de acil de 4 a 18 carbonos que pode conter modificações (FIGO. 1a) Centenas de espécies bacterianas contêm sintases do tipo LuxI que produzem esses AHLs . O comprimento da cadeia acil pode afetar a estabilidade, o que pode ter consequências para a dinâmica de sinalização . 14 15 16 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 4/27 Abra em uma janela separada figura 1 Sintases, autoindutores e receptores de detecção de quorum Esta figura mostra as estruturas de vários autoindutores junto com suas correspondentes sintases (azul) e receptores (os fatores de transcrição são mostrados como ovais verdes e rosa e os receptores transmembrana são mostrados como esquemas laranja). a | Autoindutores de homosserina lactona (HSL) produzidos por diferentes bactérias Gram-negativas. b | Éster metílico do ácido 3-hidroxipalmítico (3-OH PAME) e ( R ) -metil-3-hidroximiristato (( R ) -3-OH MAME) são produzidos e detectados por Ralstonia spp. c | O fator de sinal difusível (DSF) é usado para detecção de quorum em Xanthomonas campestris . d| A sintase do autoindutor CAI-1 (CqsA) e o sistema receptor CqsS produz e reconhece várias moléculas do autoindutor 1 do cólera (CAI-1). As moléculas Vibrio harveyi e Vibrio cholerae CAI-1 são mostradas. e | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f1.jpg 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 5/27 4,5-dihidroxi-2,3-pentanodiona (DPD) é sintetizado por todas as enzimas LuxS e é, portanto, o precursor universal para a ampla família de autoindutores quorum sensing que são designados coletivamente como autoindutor 2 (AI-2). Na presença de boro, o AI-2 forma ( 2S , 4S ) -2-metil-2,3,3,4-tetra-hidroxitetra- hidrofurano-borato ( S -THMF-borato), o autoindutor ativo em Vibrio spp. Na ausência de boro, AI-2 existe como (2 R , 4S ) -2-metil-2,3,3,4-tetrahidroxitetrahidrofurano ( R- THMF), o autoindutor ativo em bactérias entéricas. Os esquemas dos receptores LuxPQ e LsrB mostrados destinam-se a designar que o reconhecimento do autoindutor ocorre no periplasma, não no citoplasma. LuxP e LsrB são homólogos de proteínas de ligação à ribose. LuxP funciona em conjunto com as funções LuxQ e LsrB da proteína quinase do sensor de dois componentes junto com um complexo transportador de cassete de ligação de ATP (ABC) que abrange a membrana. f | 2- (2-hidroxifenil) -tiazol-4-carbaldeído (IQS) é produzido por Pseudomonas aeruginosa . O receptor IQS é atualmente desconhecido. g | O sistema 2-heptil-3-hidroxi-4- quinolona (PQS) é um dos vários sistemas de detecção de quorum emP. aeruginosa . h | Photorhabdus asymbiotica usa dialquilresorcinóis (DARs) para a comunicação célula-célula. eu | PpyS de Photorhabdus luminescens produz várias fotopironas, que são detectadas pelo regulador transcricional PluR. E. coli, Escherichia coli ; RpaI, 4-coumaroil-homoserina lactona sintase. As enzimas LuxI produzem AHLs derivando a porção lactona do SAM e, na maioria dos casos, a cadeia acila particular é obtida a partir de intermediários da biossíntese de ácidos graxos. Uma exceção notável é a bactéria fotossintética associada a plantas Rhodopseudomonas palustris em que a enzima do tipo LuxI, 4-coumaroil-homoserina lactona sintase (RpaI), produz p -coumaroil-homoserina lactona (HSL), para a qual o grupo acil vem do metabólito hospedeiro p- cumarato (FIGO. 1a) O uso de um composto derivado de planta permite que R. palustris conecte sua resposta de detecção de quorum à densidade da população bacteriana e à disponibilidade de consumíveis vegetais. Outras bactérias associadas a plantas sintetizam autoindutores de HSL incomuns. Bradyrhizobium japanicum e Aeromonas spp. produzem isovaleril-HSL18, enquanto Bradyrhizobium BTAi produz cinamoil-HSL (FIGO. 1a), mas todas essas espécies usam substratos bacterianos. Duas outras bactérias associadas a plantas, Ralstonia solanacearum e Xanthomonas campestris , produzem autoindutores atípicos. Dependendo da cepa, a proteína PhcB de R. solanacearum sintetiza um dos dois autoindutores relacionados, éster metílico do ácido 3-hidroxipalmítico (3-OH PAME) e ( R ) -metil-3-hidroxmiristato (( R ) - 3-OH MAME;FIGO. 1b) . Esses autoindutores controlam a virulência e a formação de biofilmes . X. campestris também usa ácido cis -11-metil-2-dodecenóico, que é conhecido como fator de sinal difusível (DSF;FIGO. 1c), para modular as transições entre os estilos vida planctônico e associado ao biofilme . Homólogos estruturais de DSF foram descobertos recentemente, inclusive em patógenos humanos, como Pseudomonas aeruginosa e Burkholderia cenocepacia . Todas as moléculas do tipo DSF são sintetizadas por proteínas RpfF ( FIGO. 1c) Curiosamente, um organismo pode gerar vários sinais DSF, todos os quais são sintetizados por uma única proteína RpfF . Muitas bactérias produzem e detectam vários autoindutores. A bactéria marinha bioluminescente Vibrio harveyi foi a primeira bactéria descoberta a usar vários autoindutores e continua sendo o modelo para entender como as bactérias processam misturas químicas. V. harveyi usa três autoindutores para comunicação intra-espécies, intra-gêneros e inter-espécies para regular aproximadamente 600 genes- alvo . V. harveyi produz um AHL canônico, 3OH-C4-HSL (HAI-1;FIGO. 1a), usando a LuxM sintase . Surpreendentemente, LuxM não é um homólogo de LuxI, mas realiza reações análogas usando SAM e intermediários de ácidos graxos como substratos . Até onde se sabe, apenas V. harveyi e seu parente mais próximo, Vibrio parahaemolyticus, produzem HAI-1, o que sugere que este autoindutor é usado para comunicação intra-espécies . V. harveyi também usa ( Z ) -3-aminoundec-2-en-4-one como um autoindutor (FIGO. 1d) A molécula relacionada, ( S ) -3-hidroxitriecan-4-ona, foi descoberta pela primeira vez como um autoindutor em Vibrio cholerae (FIGO. 1d) Coletivamente, essas moléculas são chamadas de autoindutor de cólera 1 (CAI-1). Em V. cholerae , o CAI-1 autoindutor sintase (CqsA) atua sobre SAM e decanoil-CoA para 17 19 20 21 22 de 23 24 25 26 27 28 29 , 30 31 5 32 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 6/27 produzir amino-CAI-1, que é imediatamente convertido, possivelmente espontaneamente, em CAI-1. Ambos amino-CAI-1 e CAI-1 são biologicamente ativos; no entanto, CAI-1 predomina em fluidos de cultura livre de células . Amino-CAI-1 é mais estável do que CAI-1 (REF. 33 ), o que levanta a possibilidade de que CAI-1 promova uma resposta rápida às flutuações do autoindutor. As enzimas CqsA existem em todos os Vibrio spp. e eles podem produzir várias porções CAI-1 que têm diferentes comprimentos e modificações de cadeia de acila. Vibriospp. respondem aos CAI-1s uns dos outros com afinidades diferentes dos seus próprios CAI-1s, o que sugere que o CAI-1 é usado para comunicação intra- Vibrio . Curiosamente, além de Vibrio spp., Os homólogos c qsA existem nas bactérias distantemente relacionadas Legionella pneumophila e Janthinobacterium sp. HH01 (REFS ). Em L. pneumophila , o autoindutor correspondente, 3-hidroxipentadecano-4-ona (LAI-1), regula a captação de DNA e a interação da célula hospedeira, o que implica LAI-1 na comunicação inter-reino . O autoindutor final em V. harveyi é o autoindutor 2 (AI-2), que consiste em um conjunto de moléculas autoindutoras interconvertidas que são todas derivadas de 4,5-dihidroxi-2,3-pentanodiona (DPD; FIGO. 1e) . LuxS, a sintase DPD, está presente em mais de 500 espécies bacterianas, tornando o AI- 2 o autoindutor bacteriano mais comum identificado até o momento . DPD é altamente reativo e se cicliza espontaneamente em várias metades de furanona. Espécies bacterianas específicas detectam diferentes formas de DPD como seus sinais ativos de AI-2. Por exemplo, em V. harveyi , AI-2 contém boro , enquanto em Escherichia coli e Salmonella spp., O sinal de AI-2 é uma fração DPD ciclizada não borada (FIGO. 1e) Como os diferentes DPDs se interconvertem rapidamente, o AI-2 fornece um meio para a comunicação entre as espécies . Certas bactérias, como P. aeruginosa , não codificam LuxS e, portanto, não produzem AI-2. No entanto, eles podem detectar o AI-2 produzido por outras espécies bacterianas, e o AI-2 altera seus programas de expressão gênica . P. aeruginosa usa dois autoindutores canônicos de AHL (FIGO. 1a), bem como autoindutores não AHL para detecção de quorum. Especificamente, os dipeptídeos cíclicos (2,5-dicetopiperazinas; DKPs) são gerados por ciclodipeptídeo sintases e 2- (2-hidroxifenil) -tiazol-4-carbaldeído (IQS) dependente de tRNA, que é produzido por proteínas que são codificadas por Grupo de genes da sintase do peptídeo ribossomal ambBCDE (FIGO. 1f) Além disso, uma quinolona (2-heptil-3-hidroxi-4-quinolona, conhecida como PQS;FIGO. 1g) é usado como um autoindutor . O PQS é produzido por proteínas codificadas pelos genes pqsABCDH e, juntamente com os dois AHLs, controla a formação de biofilmes e a produção de fatores de virulência . As quinolonas são amplamente conhecidas por suas atividades antibióticas e anticâncer , o que demonstra a multifuncionalidade de determinados autoindutores. A multifuncionalidade de autoindutor também foi relatada para espécies de Photorhabdus . Photorhabdus asymbiotica é um inseto e patógeno humano que produz dialquilresorcinóis (DARs; FIGO. 1h), enquanto Photorhabdus luminescens , em que a virulência é limitada a nematóides, sintetiza autoindutores de fotopirona (PPYs;FIGO. 1i) Além do quorum sensing, os PPYs funcionam como toxinas de insetos, enquanto os DARs têm atividade antibiótica . Oito PPYs diferentes (PPYA, PPYB, PPYC, PPYD, PPYE, PPYF, PPYG e PPYH) são produzidos pela PpyS sintase e a cetosintase DarB produz 2,5-dialquilciclohexano-1,3-dionas (CHDs) a partir de ácidos graxos precursores derivados, que podem ser posteriormente oxidados em DARs pela aromatase DarA . Receptores e especificidade Comumente, as bactérias Gram-negativas usam receptores do tipo LuxR, que são fatores de transcrição citoplasmáticos que detectam AHLs produzidos por sintases do tipo LuxI parceiras. As proteínas LuxR contêm dois domínios funcionais: um domínio de ligação ao ligante do terminal amino e um domínio de ligação ao DNA do terminal carboxi . Na ausência do autoindutor cognato, a maioria dos receptores do tipo LuxR não se dobram e são degradados. Em contraste, as proteínas LuxR que estão ligadas a um autoindutor são estáveis, dimerizam e se ligam ao DNA . Complexos de LuxR- auto-indutor associar com sequências curtas de DNA denominada ' lux a montante caixas' de genes 33 - 35 36 , 37 38 39 40 41 42 13 , 43 44 45 46 47 48 49 50 51 50 52 de 53 54 , 55 6 8 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 7/27 alvo . Curiosamente, EsaR, a proteína do tipo LuxR de Pantoea stewartii, funciona como um repressor transcricional na ausência de seu autoindutor cognato e libera DNA após a ligação do autoindutor . As estruturas de quatro receptores do tipo LuxR de comprimento total foram resolvidas: TraR ( FIGO. 2a) de Agrobacterium tumefaciens e Rhizobium sp. NGR234 (REF. 62 ), QscR (FIGO. 2b ) de P. aeruginosa e CviR (FIGO. 2c) de Chromobacterium violaceum . Estruturas dos domínios de ligação ao ligante de LasR65 de P. aeruginosa e SdiA66 de E. coli também foram resolvidas. Em todos os casos, os receptores do tipo LuxR formam homodímeros. As regiões N-terminais dos receptores do tipo LuxR se assemelham aos domínios GAF e PAS, que são mediadores bem conhecidos dos processos de transdução de sinal . As regiões C-terminais têm domínios de hélice-virada-hélice de ligação ao DNA, que são característicos de muitos fatores de transcrição bacteriana . Os resíduos polares nos terminais N, incluindo três resíduos de triptofano altamente conservados, contatam a porção HSL do autoindutor, que define a orientação de ligação. Os resíduos que fornecem interações hidrofóbicas e de van der Waals com as porções da cadeia de acila são menos conservados. As cadeias de acila podem ocupar o bolso de ligação em diferentes configurações: AHLs curtos são estendidos e apontam para o solvente, enquanto as cadeias longas são dobradas e voltadas para o interior do bolso . Aparentemente, as proteínas LuxR usam uma combinação de variação de aminoácidos e flexibilidade no bolso de ligação para atingir a especificidade de ligação de AHL. Abra em uma janela separada Figura 2 Estruturas de receptores de detecção de quorum do tipo LuxR Esta figura mostra as estruturas cristalinas de quatro receptores do tipo LuxR. a | TraR de Agrobacterium tumefaciens ligado ao autoindutor e entrada 1L3L do DNA (Protein Data Bank (PDB ). b | QscR de Pseudomonas aeruginosa ligado ao autoindutor (entrada PDB 3SZT ). c | CviR de Chromobacterium violaceum ligado a um inibidor chamado clorolactona (entrada PDB 3QP5 ). As setas indicam as posições dos ligantes. As estruturas dos domínios de ligação ao ligante de todas as três proteínas são semelhantes; no entanto, enquanto TraR (painel a ) adota um dímero assimétrico, QscR (painel b) e CviR (painel c ) formam arquiteturas de subunidades cruzadas quase simétricas. As localizações e conformações que são adotadas pelos domínios de ligação ao DNA diferem substancialmente, permitindo (painéis a e b ) ou prevenindo (painel c ) a ligação ao DNA e ativação transcricional de genes alvo. Aproximadamente76% das proteínas LuxR anotadas pertencem à chamada classe LuxR-solo de fatores de transcrição , ou seja, elas não têm sintases LuxI acompanhantes. Isso sugere que muitos mais autoindutores podem existir produzidos por sintases não LuxI ou que são fornecidos por outras bactérias e modulam a atividade desses receptores. QscR de P. aeruginosa é provavelmente o receptor LuxR-solo mais bem caracterizado. QscR relaxou a especificidade de ligação ao ligante em comparação com os dois receptores LuxR não-solo, LasR e RhlR. Na verdade, QscR ativa a expressão 56 - 58 59 , 60 55 , 61 63 64 67 68 69 70 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F2/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F2/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F2/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f2.jpg https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F2/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F2/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 8/27 do gene alvo em concentrações nanomolares de C8-HSL, C10-HSL, 3-oxo-C10-HSL, C12-HSL, 3- oxo-C12-HSL e C14-HSL71 (FIGO. 1a) Assim, QscR pode ser usado por P. aeruginosa para detectar autoindutores que são produzidos por espécies coabitantes, como Burkholderia cepacia . A segunda classe principal de receptores Gram-negativos de detecção de quorum são as histidina quinases ligadas à membrana de dois componentes que sinalizam para fatores de transcrição citoplasmáticos por meio da fosforilação. Os exemplos mais bem estudados vêm de V. harveyi e V. cholerae . HAI-1, CAI-1 e AI-2 são detectados por LuxN , CqsS e LuxQ , respectivamente ( FIGO. 1a, d, e) LuxN é específico para V. harveyi , enquanto os outros dois receptores (CqsS e LuxQ) são conservados em V. cholerae . A detecção de AI-2 também requer a proteína periplasmática LuxP . Prevê-se que LuxN e CqsS contenham nove e seis hélices transmembrana, respectivamente, o que evita o uso de métodos baseados em estrutura para definir a detecção de autoindutor e determinantes de especificidade. Em vez disso, a mutagênese do receptor acoplada à permutação dos ligantes AHL e CAI-1 revelou os bolsos de ligação LuxN e CqsS e descobriu os aminoácidos 'guardiões' que são cruciais para distinguir entre os autoindutores . Ambos os receptores mostram especificidade estrita para seus ligantes cognatos. Na verdade, LuxN não é ativado por qualquer variante AHL e AHLs mais longos funcionam como potentes antagonistas , o que sugere que V. harveyi detecta autoindutores não cognatos que são produzidos por concorrentes e, em resposta, desativa a detecção de quorum para evitar a exploração de seus bens públicos. Com relação ao CqsS, os derivados CAI-1 que têm cadeias acil alteradas não conseguem ativar o CqsS, enquanto o aumento do grupo da cabeça converte o autoindutor em um antagonista . As estruturas cristalinas de LuxP em complexo com o domínio periplasmático de LuxQ foram determinadas . Na ausência de AI-2, os dois complexos LuxPQ formam um heterotetrâmero simétrico, que, após a ligação de AI-2, sofre uma alteração conformacional substancial. A rotação do protômero na região periplasmática quebra a simetria do tetrâmero LuxPQ – LuxPQ, que impede a fosforilação dos domínios citoplasmáticos (veja abaixo). Em LuxP de V. harveyi, dois resíduos de arginina carregados positivamente que estão localizados no bolso de ligação estabilizam a fração AI-2 com carga negativa e complexada com boro e facilitam a ligação de hidrogênio do ligante a cinco aminoácidos adicionais. Curiosamente, a ligação de AI-2 também promove o agrupamento de tetrâmeros LuxPQ – LuxPQ, que podem influenciar a sensibilidade de AI-2 e a dinâmica de resposta . Várias proteobactérias possuem um sistema alternativo de detecção de AI-2. O operon lsrACDBFGE ( lsr significa regulado por LuxS) codifica um transportador de cassete de ligação de ATP (transportador ABC) que internaliza AI-2. O operon também codifica enzimas responsáveis pela degradação do AI-2 (REF.40). O operon é regulado pelo repressor LsrR, que se liga a um produto AI-2 processado no citoplasma. Neste caso, LsrB é o equivalente a LuxP e está localizado no periplasma (FIGO. 1e) LsrB liga-se a uma porção de AI-2 ciclizada sem boro. Três estruturas cristalinas de LsrB complexadas com AI-2 mostram que, apesar da sequência e variação estrutural, seis aminoácidos altamente conservados conduzem a interação de LsrB com AI-2 (REF. 77 ). Dada a baixa porcentagem (~ 11%) de identidade de sequência entre os receptores do tipo LuxP e do tipo LsrB, é possível que existam receptores de AI- 2 adicionais, ainda não descobertos. Arquiteturas de rede quorum sensing Para executar com precisão comportamentos de detecção de quorum, as bactérias devem detectar, interpretar e integrar informações químicas extracelulares e converter essas informações em mudanças na expressão gênica. Como as bactérias conseguem esses feitos é especialmente interessante quando vários autoindutores são usados e em consórcios de espécies mistas . Além disso, a informação pode ser corrompida por ruído interno (como flutuações no transcrito ou número de proteínas), mudanças externas (temperatura, pH, osmolaridade e assim por diante), ou se bactérias concorrentes contribuem ou consomem autoindutores, e todos esses recursos exigem compensação. Abordagens de biologia de sistemas descobriram princípios comuns de design de rede que ocorrem em sistemas de detecção de 72 5 73 32 74 75 12 , 76 12 76 74 , 75 75 78 9 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 9/27 quorum que são capazes de superar esses problemas . Abaixo, para ilustrar esses princípios, discutimos as duas arquiteturas de rede canônicas mais comuns usando Pseudomonas spp. e Vibrio spp. como exemplos. Pseudomonas spp. sensor de quorum Pseudomonas spp., Especificamente P. aeruginosa , usam uma rede densa de receptores e reguladores de detecção de quorum (FIGO. 3) Os principais receptores de P. aeruginosa são receptores do tipo LuxR que, após a ligação de um autoindutor no citoplasma, funcionam como ativadores transcricionais de ligação ao DNA . Atualmente, existem quatro vias de detecção de quorum bem conhecidas em P. aeruginosa : dois sistemas do tipo LuxR e LuxI chamados LasR e LasI e RhlR e RhlI, o sistema de quinolona controlado por PqsR e o sistema IQS que funciona sob condições limitantes de fosfato . Abra em uma janela separada Figura 3 Circuitos de detecção de quorum em Pseudomonas aeruginosa As quatro autoindutoras sintases, LasI, RhlI, PqsABCDH e AmbBCDE, produzem os autoindutores, 3- oxo-C12-homoserina lactona (HSL), C4-HSL, 2-heptil-3-hidroxi-4-quinolona (PQS) e 2- (2-hidroxifenil) - tiazol-4-carbaldeído (IQS), respectivamente. 3-oxo-C12-HSL, C4-HSL e PQS, são reconhecidos por fatores de transcrição citoplasmáticos. O receptor para IQS é atualmente desconhecido. A produção do sinal IQS é induzida sob privação de fosfato. Os circuitos individuais são altamente interconectados e envolvem autoindução (setas vermelhas). Os sistemas são organizados em uma hierarquia com LasR no topo da cascata (FIGO. 3) LasR, em complexo com 3-oxo-C12-HSL (FIGO. 1a), ativa um grande regulon de genes downstream que inclui o gene lasI sintase, que leva à autoindução . O LasR-autoindutor complexo também activa a expressão de RHLR e RHLI , que codificam para a segunda via de quorum sensing , e os pqsR e pqsABCDH genes, que codificam o sistema PQS . RhlR opera de forma semelhante ao LasR,e quando ligado a 79 80 46 81 48 82 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F3/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f3.jpg https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F3/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F3/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F3/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 10/27 C4-HSL (FIGO. 1a), ativa seu próprio regulon que inclui rhlI e, assim, estabelece o segundo ciclo de alimentação direta de autoindução . O complexo PqsR – PQS realimenta para ativar o rhlRI 85, que conecta os três módulos de sinalização. Além disso, RhlR inibe a expressão de pqsR e pqsABCD , e esta alça é sugerida para garantir a proporção correta de 3-oxo-C12-HSL para C4-HSL, que, por sua vez, dita a ativação de PQS . Uma pesquisa recente de reguladores que afetam a detecção de quorum em P. aeruginosa listou 13 fatores de transcrição, dos quais 10 reprimiram e 3 ativaram funções dirigidas por Rhl e / ou por Las . Este alto grau de interconectividade destaca como várias pistas intracelulares e extracelulares são integradas para modular a saída de detecção de quorum. Presumivelmente, o ajuste fino da resposta por meio de várias camadas de regulação permite uma comunicação robusta célula-célula sob diversas condições. Curiosamente, RhlR é um componente chave de quorum sensing em P. aeruginosa que controla a expressão de genes de virulência . Como rhlI pode ser ativado por LasR ou PqsR, junto com RhlR ligado a C4-HSL, pelo menos um outro autoindutor é necessário para a patogenicidade. Em P. aeruginosa de tipo selvagem , o autoindutor adicional necessário é geralmente fornecido pelo sistema Las. No entanto, isolados de P. aeruginosa de pacientes com fibrose cística freqüentemente apresentam mutações no lasR . Nesse caso, a proteína de privação de fosfato PhoB pode substituir a necessidade de LasR por meio da ativação da produção de IQS. Por sua vez, o IQS ativa a expressão do pqs genes ( FIGO. 3), que produz o autoindutor adicional necessário por meio da ativação da expressão de rhl . Esse mecanismo de desvio alternativo torna a expressão do gene de virulência em P. aeruginosa imune a mutações no LasR, o que pode ser particularmente relevante durante a infecção crônica . Vibrio spp. sensor de quorum V. harveyi e V. cholerae fornecem o segundo exemplo de um circuito de detecção de quorum canônico; neste exemplo, o sistema depende de receptores ligados à membrana. Embora as vantagens e desvantagens dos fatores de transcrição de ligação ao DNA citoplasmático versus receptores ligados à membrana não sejam totalmente compreendidos, uma questão é clara: ambos os tipos de sistema devem evitar responder a autoindutores produzidos endogenamente antes de atingir 'um quorum'. A rápida degradação das proteínas do tipo LuxR na ausência de autoindutor impede a ativação prematura do quorum sensing em sistemas tipo Pseudomonas , enquanto a localização dos receptores na membrana em VibrioOs sistemas de tipo dissociam a produção citosólica de autoindutores da detecção no periplasma . V. harveyi e V. cholerae usam CqsS e LuxPQ como receptores de detecção de quorum, que interagem com CAI-1 e AI-2, respectivamente. Além disso, V. harveyi usa um terceiro receptor de ligação HAI-1, LuxN. Em ambas as espécies, os relés de sinalização são arranjados em paralelo (FIGO. 4) Na ausência de autoindutores, LuxN, LuxPQ e CqsS são quinases que se autofosforilam e transportam fosfato para LuxU, que passa o fosfato para o regulador de resposta LuxO . LuxO fosforilado funciona junto com σ (REF. 90 ) para ativar a transcrição de genes que codificam quatro ( V. cholerae ) ou cinco ( V. harveyi ) sRNAs homólogos, conhecidos como sRNAs reguladores de quorum (Qrr sRNAs) . Os sRNAs Qrr são sRNAs dependentes de Hfq que regulam a expressão gênica por emparelhamento de bases com mRNAs alvo e alteração da tradução . Os sRNAs Qrr ativam ou reprimem a tradução de 20 mRNAs . Mais importante ainda, eles ativam a tradução do mRNA que codifica o regulador mestre de baixa densidade celular, AphA, e reprimem a tradução dos mRNAs que codificam os reguladores mestre de alta densidade celular, LuxR em V. harveyi e HapR em V. cholerae (FIGO. 4) 83 , 84 86 48 80 87 46 48 88 5 89 54 91 6 , 92 93 91 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F3/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 11/27 Abra em uma janela separada Figura 4 Circuitos de detecção de quorum em Vibrio harveyi Painel esquerdo: Transdução de sinal em baixas densidades de células. Durante esse estágio, os níveis de autoindutor são baixos e os receptores LuxN, LuxPQ e CqsS atuam como quinases. LuxO é fosforilada e os pequenos RNAs reguladores de quorum (Qrr sRNAs) Qrr1, Qrr2, Qrr3, Qrr4 e Qrr5 (Qrr1–5) são transcritos. Os sRNAs Qrr reprimem luxR e ativam aphA . AphA controla genes que estão envolvidos em comportamentos individuais e ativa genes que são necessários para a virulência e a formação de biofilmes (em Vibrio cholerae) Painel direito: Transdução de sinal em altas densidades celulares. Durante esta fase, os níveis de autoindutor são elevados e os receptores LuxN, LuxPQ e CqsS funcionam como fosfatases. LuxO é desfosforilada, os sRNAs Qrr1–5 não são transcritos; portanto, AphA não é produzido, enquanto LuxR é produzido. LuxR controla genes que são necessários para comportamentos de grupo, incluindo genes que são responsáveis pela bioluminescência (em Vibrio harveyi ). AI-2, autoindutor 2; Ea-C8-CAI- 1, ( Z ) -3-aminoundec-2-en-4-ona; HAI-1, 3OH-C4-homoserina lactona. Em alta densidade celular, a ligação do autoindutor inibe a autofosforilação, que permite que as atividades de fosfatase dos receptores dominem . LuxO desfosforilada é inativa, o que encerra a expressão dos genes qrr . Na ausência de sRNAs Qrr, luxR ou hapR é descomprimido e aphA não é ativado. Sob esta condição, LuxR ou HapR é produzido e ativa genes que sustentam comportamentos coletivos de detecção de quorum (FIGO. 4) Além disso, os sRNAs Qrr reprimem luxMN , que codifica uma sintase de autoindutor e par de receptor (FIGO. 5) e reprimir a tradução de luxO . Os sRNAs Qrr reprimem luxR ou hapR através da degradação catalítica do mRNA, reprimem luxMN por degradação acoplada do mRNA, reprimem a tradução de luxO sequestrando mRNA luxO e ativam aphA revelando o local de ligação ao ribossomo . Embora a degradação catalítica do luxR ou hapR mRNA pelos Qrr sRNAs não altere o conjunto Qrr, a degradação acoplada e o sequestro removem os Qrr sRNAs do sistema . Esses mecanismos regulatórios são cruciais para a manutenção de pools Qrr adequados e dinâmica geral de detecção de quorum (FIGO. 5) 94 95 96 97 97 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f4.jpg https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F5/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F5/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 12/27 Abra em uma janela separada Figura 5 Os loops de feedbackcontrolam a dinâmica de detecção de quorum do Vibrio harveyi Seis diferentes loops de feedback estão embutidos no circuito de detecção de quorum do Vibrio harveyi . a | LuxO autorepressa sua própria transcrição. b | Os pequenos RNAs reguladores de quorum (Qrr sRNAs) inibem a tradução de luxO por sequestro de mRNA alvo. c | LuxR ativa a transcrição qrr . Os sRNAs Qrr, por sua vez, inibem a produção de LuxR por degradação catalítica do mRNA luxR . d | LuxR reprime sua própria transcrição. e | AphA e LuxR reciprocamente reprimem a transcrição um do outro. f | Emparelhamento de base dos sRNAs Qrr com o luxMNO mRNA facilita a degradação do duplex de RNA (degradação acoplada). As setas indicam ativação. Setas inibitórias denotam repressão. Setas cinza indicam regulação pós-transcricional. Todos esses loops de feedback, exceto o loop Qrr-to- luxMN, também existem no Vibrio cholerae . Em V. cholerae , LuxR é conhecido como HapR. HAI-1, 3OH-C4- homoserina lactona; RNAP, RNA polimerase. A probabilidade de um determinado receptor estar no estado de quinase ou fosfatase é ditada pela diferença de energia livre entre as duas configurações . Esta arquitetura molecular é análoga aos receptores de quimiotaxia em E. coli e sugere a relevância geral de modelos de energia livre de dois estados para quinases sensoriais bacterianas . É importante ressaltar que todos os receptores de detecção de quorum em Vibrio spp. têm ambas as atividades quinase e fosfatase, e transferem fosfato para e da mesma proteína fosforosa, LuxU, a detecção de quorum nunca pode ser totalmente ativada ou totalmente desativada, a menos que todos os autoindutores estejam presentes ou ausentes, respectivamente. Dinâmica de detecção de quorum em Vibrio spp. são posteriormente modulados pelos loops de feedback mencionados acima, bem como outros feedbacks regulatórios que ajustam a informação que flui através da rede. Existem seis ciclos de feedback conhecidos (FIGO. 5): Primeiro, LuxO auto- reprime sua própria transcrição . Em segundo lugar, os sRNAs Qrr sequestram o mRNA luxO , que reprime a tradução luxO . Ambos os loops limitam a produção de LuxO em baixas densidades de células, o que define o limite inferior abaixo do qual os sRNAs de Qrr e, portanto, a detecção de quorum, não podem ser mais reprimidos . Terceiro, LuxR ou HapR ativa a expressão dos genes qrr e o feedback de Qrr sRNAs para desestabilizar o luxR ou HapR mRNA . Este loop duplo 73 98 99 96 , 97 97 , 100 101 91 102 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f5.jpg https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F5/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F5/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F5/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 13/27 torna as transições de detecção de quorum acionadas por LuxR ou HapR mais rápidas . Quarto, LuxR ou HapR reprime sua própria transcrição, o que evita a produção descontrolada de LuxR ou HapR em altas densidades celulares, o que coloca um limite na possível saída de detecção de quorum . Quinto, AphA e LuxR ou HapR reciprocamente reprimem a transcrição um do outro, o que garante a produção máxima de AphA em baixa densidade celular e produção máxima de LuxR ou HapR em alta densidade celular . Sexto, em baixa densidade celular, os sRNAs Qrr facilitam a degradação de luxMNmRNA, que diminui a síntese e detecção de HAI-1. Este loop desenfatiza o sinal HAI-1 em baixa densidade celular e aumenta a sensibilidade HAI-1 em alta densidade celular . Presumivelmente, em baixa densidade celular, o número de células não-parentes é crucial para rastrear, mas em alta densidade celular, monitorar e cooperar com as células-parentes são fundamentais. Na verdade, o trabalho teórico sugere que em comunidades de espécies mistas, o amplo sinal AI-2 é mais informativo durante os estágios iniciais da formação de biofilme, enquanto os autoindutores específicos da espécie dominam em comunidades de uma única espécie ou durante estágios posteriores de formação de biofilme . Juntos, todos esses loops de feedback garantem a dinâmica ideal, fidelidade e transições suaves entre os estados de detecção de quorum. Funções de detecção de quorum Tradicionalmente, o quorum sensing era definido como a comunicação célula-célula entre bactérias que resulta em mudanças na atividade do fator de transcrição e, portanto, mudanças na expressão gênica. Comportamentos direcionados por quorum sensing foram definidos como aqueles que exigem que todas as bactérias na população atuem em uníssono para tornar os comportamentos bem-sucedidos . Uma nova pesquisa amplia essas definições, mostrando comunicação entre reinos , respostas por sinais químicos de pequenas moléculas intracelulares e heterogeneidade na expressão gênica que é controlada por quorum sensing . O sensor de quorum é conhecido por controlar a produção de fatores de virulência e a formação de biofilmes . Da mesma forma, biofilmes e virulência são conhecidos por depender de moléculas de sinalização de segundo mensageiro intracelular, incluindo monofosfato de guanosina dimérico cíclico (c-di-GMP) e monofosfato de adenosina cíclico (cAMP) . Esta sobreposição é exemplificada em B. cenocepacia : o autoindutor da família DSF ácido cis -2-dodecenóico (BDSF) se liga a RpfR, que é uma proteína que contém os domínios GGDEF e EAL. A ligação de BDSF a RpfR causa uma diminuição na concentração intracelular de c-di-GMP, que afeta a motilidade da enxameação, a formação de biofilmes e a virulência . Existem outros exemplos de conexões de detecção de quorum para c-di-GMP e cAMP em Vibrio spp., Pseudomonas e outros patógenos Gram-negativos . Ligar a detecção de quorum a segundos mensageiros baseados em nucleotídeos permite a conversão de informações complexas codificadas em combinações de autoindutoras em uma única molécula de sinalização intracelular geral. Os comportamentos de quorum sensing são frequentemente estudados isoladamente, ou seja, em culturas bem misturadas e agitadas e / ou na ausência de microrganismos cooperantes ou concorrentes. No entanto, condições de crescimento não uniformes e / ou comunidades mistas influenciam as funções de detecção de quorum . Por exemplo, o fluxo de fluido, especialmente em geometrias complexas, influencia a ativação temporal e regional de genes de formação de biofilme controlado por quorum sensing entre membros individuais de comunidades de V. cholerae , o que leva a padrões complexos de colonização . Na cavidade oral, que é não uniforme e sujeita a fluxo, a comunicação baseada em AI-2 é necessária para a formação de biofilmes multiespécies e o desenvolvimento de placa dentária . Em outras comunidades de biofilme, o sensor de quorum promove a competição, pelo menos entre não-parentes. Por exemplo, em V. cholerae , quorum sensing ativa tipo VI secreção, provocando lise das células vizinhas não parentes , que promove a eliminação de ADN a partir de células lisadas e a transferência de genes horizontal . No intestino, foi relatado recentemente que a sinalização de AI-2 promove a expansão de Firmicutes sobre a de Bacteroidetes após o tratamento com antibióticos, o que sugere que a detecção de quorum molda pelo menos parcialmente a composição da microbiota (FIGO. 6) Curiosamente, uma 102 103 , 104 103 95 105 , 106 107 , 108 109 110 8 3 111 112 113 114 115 , 116 117 118 - 120 121 122 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F6/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 14/27 proporção muito maior de espécies nos Firmicutes do que nos Bacteroidetes codifica sistemas de sinalização AI-2 funcionais. Além disso, o AI-2 produzido pela bactéria comensalintestinal Blautia obeum (anteriormente conhecida como Ruminococcus obeum ) restringe a virulência de V. cholerae , o que é relevante durante a recuperação do cólera . Curiosamente, o receptor de V. cholerae que é relevante para detecção de AI-2 sob essas condições é o fator de transcrição LuxR-solo, VqmA, em vez de LuxPQ . Abra em uma janela separada Figura 6 Detecção de quorum mediada por AI-2 no intestino de mamíferos Os microrganismos intestinais se comunicam usando o autoindutor 2 (AI-2). O tratamento com antibióticos pode alterar a composição da microbiota, que pode ser melhorada pela modulação dos níveis de AI-2. As células eucarióticas produzem citocinas, como a interleucina-8 (IL-8), em resposta ao AI-2. Hormônios (adrenalina e noradrenalina) e miméticos de AI-2 são produzidos pelo hospedeiro e podem ser detectados por bactérias. O sensor de quorum pode alterar a heterogeneidade fenotípica entre os membros isogênicos de uma população bacteriana, o que afeta as características relacionadas à virulência, como a formação de biofilme. A modulação do microbioma intestinal e / ou de suas atividades também pode resultar da sinalização de autoindutor inter-reinos . Por exemplo, a exposição de células epiteliais de mamíferos ao AI-2 induz a produção da citocina inflamatória interleucina-8 (REF. 126 ). O AI-2 produzido por P. aeruginosa causa apoptose em alguns tipos de células de mamíferos . Por outro lado, as bactérias entéricas detectam os hormônios adrenalina e noradrenalina produzidos pelo hospedeiro usando os sensores quinases QseC e QseE, respectivamente . Mais recentemente, descobriu-se que células epiteliais de mamíferos liberam um mimetizador de AI-2 em resposta a bactérias ou ao rompimento de junções fechadas. O mimetizador de AI-2 é detectado pelo receptor bacteriano AI-2, LuxP ou LsrB, e 123 124 , 125 109 127 128 129 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/core/lw/2.0/html/tileshop_pmc/tileshop_pmc_inline.html?title=Click%20on%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=5056591_nihms809455f6.jpg https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F6/?report=objectonly https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F6/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 15/27 ativa a expressão gênica impulsionada por quorum sensing na bactéria (FIGO. 6) Explorar o AI-2 como um sinal de comunicação geral, ao contrário de outros autoindutores específicos da espécie, pode ser uma estratégia que permite ao hospedeiro se comunicar ao máximo e conduzir mudanças globais na expressão gênica em populações mistas, como as que existem no intestino. Da mesma forma, diversas plantas e algas produzem mimetizadores de autoindutores que influenciam os comportamentos controlados por quorum sensing em seus colonizadores bacterianos, embora, em muitos casos, o significado dessas interações não seja claro . Finalmente, nem todas as vias de detecção de quorum promovem a sincronização da expressão gênica entre todos os membros do grupo (FIGO. 6) Essa heterogeneidade fenotípica é considerada uma importante estratégia de hedge de aposta . A heterogeneidade orientada por quorum sensing foi extensivamente estudada em V. harveyi e pode ser atribuída ao status de fosforilação de LuxO (FIGO. 4 ), que tem consequências para a formação de biofilmes . Células não conformistas também foram relatadas em outros sistemas; entretanto, na maioria dos casos, os mecanismos moleculares subjacentes à heterogeneidade não são definidos . Um trabalho recente em Pseudomonas putida sugere que a produção de autoindutores pode ser heterogênea em biofilmes imaturos e que os autoindutores podem desencadear a auto-indução de funções de detecção de quorum em células individuais , o que indica que a função biológica de um sinal de detecção de quorum pode variar dependendo do condições de crescimento. Conclusões A comunicação química entre as bactérias por meio do quorum sensing é uma característica central da vida bacteriana que permite às bactérias fazer um censo da população e discernir quem são seus vizinhos, sejam eles parentes ou não, e / ou amigos ou inimigos. O sensor de quorum permite que as bactérias orquestrem comportamentos coletivos. Nesta revisão, resumimos como os sistemas de detecção de quorum funcionam usando um conjunto semelhante de princípios operacionais, que estão embutidos nas propriedades físicas e químicas dos autoindutores, os receptores correspondentes e seus reguladores a jusante. A detecção de quorum é crucial para muitos processos bacterianos e, não surpreendentemente, moduladores sintéticos de detecção de quorum estão sendo ativamente buscados para alterar o comportamento bacteriano sob demanda ( CAIXA 1) É possível que os princípios que fundamentam as redes de detecção de quorum bacteriano também sejam cruciais para comportamentos coletivos em organismos superiores. Por exemplo, insetos sociais, como abelhas e formigas, usam o sensor de quorum para determinar os locais de nidificação . Outro exemplo tentador é que os folículos pilosos de animais só podem se regenerar em conjunto com os folículos próximos, e esse processo coletivo segue uma lógica semelhante a quorum sensing . Esta e outras novas pesquisas levantam a possibilidade empolgante, mas agora plausível, de que o quorum sensing não se restrinja a microrganismos, mas sim um mecanismo geral que funciona em toda a árvore da vida. Caixa de texto 1: moduladores sintéticos de detecção de quorum A desativação do quorum sensing bacteriano com pequenas moléculas tem sido proposta como uma estratégia para prevenir a formação de biofilmes e patogenicidade. Os circuitos de detecção de quorum de Pseudomonas aeruginosa e Vibrio cholerae contêm vários alvos possíveis. Em P. aeruginosa , antagonistas LasR foram identificados que são derivados da lactona de homoserina de acilo-nativa (AHL) . Compostos não relacionados estruturalmente também foram desenvolvidos e alguns inibidores de LasR também são inibidores de RhlR . Por exemplo, a meta-bromo-tiolactona (mBTL) reprime parcialmente LasR e RhlR e bloqueia a produção de fatores de virulência e a formação de biofilmes . Algumas moléculas pequenas podem ser antagonistas de um receptor (por exemplo, RhlR) e agonistas de outro receptor (por exemplo, LasR) , que destaca a complexidade inerente ao desenvolvimento bem-sucedido de abordagens anti-quorum-sensing. LasR e RhlR podem ter funções regulatórias opostas para alguns alvos (por exemplo, o LasR reprime e RhlR ativa certos alvos e vice-versa) e outras vias regulatórias podem ter uma função . Inibidores PqsR foram sintetizados com base no 129 130 131 132 , 133 8 9 134 , 135 136 137 - 140 141 140 142 142 , 143 13 136 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F6/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F6/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/figure/F4/ 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 16/27 naturais 2-heptil-3-hidroxi-4-quinolona (PQS) ligando e têm sido recentemente demonstrado que a função como agentes anti-virulência . Digno de nota, bloquear a função de PqsR com uma pequena molécula também pode interferir na formação de células persistentes . Bloquear sintases de indutor automático é outra opção; por exemplo, a biossíntese de PQS depende do antranilato como intermediário, e sua produção pode ser inibida pelo antranilato antranilato, metil antranilato . Uma triagem para inibidores das sintases LasI e RhlI identificou ácido salicílico, ácido tânico e trans- cinamaldeído. As análises mecanísticas de acompanhamento mostraram que o ácido tânico e o trans- cinamaldeído inibem o RhlI . Em V. cholerae , o quorum sensing reprime a produção de fatores de virulência e promove a dispersão do biofilme. Assim, moléculas que ativam prematuramente a detecção de quorum estãosendo buscadas para o desenvolvimento terapêutico. A adição do autoindutor-1 sintético da cólera (CAI-1) reprime a produção da toxina da cólera e do pilus co-regulado pela toxina . Vários agonistas CqsS de molécula pequena foram identificados como específicos para Vibrio spp. . Uma possibilidade alternativa é a inibição de LuxO, que ativa o sensor de quorum. Uma tela de alto rendimento levou à identificação de um conjunto de derivados de 6-tio-5-azauracil, como AzaU, que são inibidores potentes da atividade LuxO ATPase . AzaU tem atividade de amplo espectro contra Vibrio spp. No entanto, AzaU é específico para proteínas LuxO e não antagoniza outros homólogos NtrC e, portanto, AzaU não afeta o crescimento. Finalmente, um inibidor sintético da 5′-metiltioadenosina / S- adenosil-homocisteína nucleosidase (MTAN; também conhecido como Pfs), uma enzima que está envolvida na síntese de CAI-1 e autoindutor 2 (AI-2) , bloqueia o quorum detecção em V. cholerae . Embora os inibidores de MTAN bloqueiem a produção de autoindutores e a formação de biofilmes, a deleção do gene que codifica MTAN não impede o desenvolvimento de biofilme, o que indica que os inibidores de MTAN poderiam operar por um mecanismo pleiotrópico . Poucos ensaios clínicos que envolvem essas moléculas foram realizados até o momento. Uma preocupação é que a inibição do quorum sensing poderia aumentar a prevalência de genótipos virulentos . A identificação dos moduladores de detecção de quorum mais eficazes, à prova de resistência e confiáveis é uma tarefa desafiadora. No entanto, a promessa dessa estratégia inovadora para o tratamento antimicrobiano em tempos de surgimento de patógenos bacterianos multirresistentes gerou grande interesse e atividade. Agradecimentos Este trabalho foi financiado pelo Howard Hughes Medical Institute, NIH Grant 5R01GM065859 e National Science Foundation Grant MCB-0948112 (para BLB). KP foi apoiado pelo DFG Grant PA2820 / 1. Glossário 135 , 136 144 - 146 147 148 149 27 , 32 150 , 151 152 35 , 39 153 154 155 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 17/27 Sistemas de dois componentes Um grande grupo de circuitos de transdução de sinal que normalmente consistem em uma cinase de sensor de histidina ligada à membrana que detecta um estímulo ambiental específico e um regulador de resposta cognata que medeia a resposta celular, principalmente por meio da regulação transcricional de genes alvo. RNAs pequenos (sRNAs) Os pequenos RNAs bacterianos (sRNAs) são um grupo heterogêneo de reguladores pós-transcricionais que freqüentemente atuam junto com o chaperone Hfq. Bens públicos Recursos comuns que estão freqüentemente presentes em sistemas biológicos e sociais. Os bens públicos estão disponíveis para todos os membros da comunidade, independentemente se um membro contribuiu para sua produção ou não. Portanto, os bens públicos estão sujeitos à exploração por não produtores. Loop feed- forward Um motivo de rede regulatória comum em vias biológicas. O loop feed-forward é composto por dois fatores de entrada (geralmente reguladores transcricionais), um dos quais regula o outro, de modo que ambos regulam em conjunto os genes alvo a jusante. Cobertura de apostas Uma estratégia de sobrevivência que reduz a variância temporal da aptidão às custas de uma redução da aptidão média aritmética. Domínios GAF e PAS Domínios que são frequentemente conservados em proteínas de sinalização nas quais funcionam como domínios de ligação ao ligante. interações de van der Waals Forças atrativas ou repulsivas fracas entre moléculas ou grupos atômicos que não resultam de ligações covalentes ou interações eletrostáticas entre íons ou grupos iônicos. Transportador de casstte de ligação de ATP (transportador ABC) Membro de uma grande superfamília de sistemas de transporte de pequenas moléculas que estão presentes em todos os filos. σ Um fator sigma alternativo em bactérias que é codificado pelo gene rpoN , que foi originalmente identificado como um regulador de genes que estão envolvidos no metabolismo do nitrogênio. Hfq Uma proteína de ligação a RNA de ação global que facilita o emparelhamento de pequenos RNAs bacterianos com seus mRNAs alvo. Monofosfato de guanosina dimérico cíclico (c-di- GMP) Uma segunda molécula mensageira usada na transdução de sinal em uma ampla variedade de bactérias. Monofosfato de adenosina cíclico (cAMP) Uma segunda molécula mensageira importante em muitos processos biológicos em organismos, desde bactérias até humanos. Domínio GGDEF e domínios EAL Domínios de proteína que são onipresentes em bactérias e funcionam para sintetizar e degradar a molécula de sinalização intracelular monofosfato dimérico de guanosina cíclico (c-di-GMP), respectivamente. 54 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 18/27 Secreção tipo VI Sistemas que são usados por bactérias Gram-negativas para injetar proteínas efetoras e fatores de virulência do interior de uma célula bacteriana em outra célula chamada presa. Transferência horizontal de genes A troca de informações genéticas entre organismos de uma maneira diferente da reprodução tradicional. A transferência horizontal de genes é a chave para a aquisição de resistência a antibióticos em bactérias e a transferência horizontal de genes também tem um papel importante na evolução e geração de diversidade. Células persistentes Membros isogênicos de uma população bacteriana que entrou em um estado fisiológico de não crescimento ou de crescimento extremamente lento, o que os torna tolerantes a uma ampla gama de antimicrobianos. Referências 1. Bassler BL, Losick R. Bacterially falando. Célula. 2006; 125 : 237–246. [ PubMed ] [ Google Scholar ] 2. LaSarre B, Federle MJ. Explorando quorum sensing para confundir patógenos bacterianos. Microbiol Mol Biol Rev. 2013; 77 : 73–111. [ Artigo grátis PMC ] [ PubMed ] [ Google Scholar ] 3. Rutherford ST, Bassler BL. Detecção de quorum bacteriano: seu papel na virulência e possibilidades de seu controle. Cold Spring Harb Perspect Med. 2012; 2 [ artigo gratuito PMC ] [ PubMed ] [ Google Scholar ] 4. Novick RP, Geisinger E. Quorum sensing in staphylococci. Annu Rev Genet. 2008; 42 : 541–564. [ PubMed ] [ Google Scholar ] 5. Ng WL, Bassler BL. Arquiteturas de rede com detecção de quorum bacteriano. Annu Rev Genet. 2009; 43 : 197–222. [ Artigo grátis PMC ] [ PubMed ] [ Google Scholar ] 6. Papenfort K, Vogel J. Regulatory RNA in bacterial pathogens. Cell Host Microbe. 2010; 8 : 116– 127. [ PubMed ] [ Google Scholar ] 7. Schuster M, Sexton DJ, Diggle SP, Greenberg EP. Acyl-homoserine lactone quorum sensing: from evolution to application. Annu Rev Microbiol. 2013;67:43–63. [PubMed] [Google Scholar] 8. Grote J, Krysciak D, Streit WR. Phenotypic Heterogeneity, a Phenomenon That May Explain Why Quorum Sensing Does Not Always Result in Truly Homogenous Cell Behavior. Appl Environ Microbiol. 2015;81:5280–5289. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 9. Carcamo-Oyarce G, Lumjiaktase P, Kummerli R, Eberl L. Quorum sensing triggers the stochastic escape of individual cells from Pseudomonas putida biofilms. Nat Commun. 2015;6:5945. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 10. Vogt SL, Pena-Diaz J, Finlay BB. Chemical communication in the gut: Effects of microbiota- generated metabolites on gastrointestinal bacterial pathogens. Anaerobe. 2015;34:106–115. [PubMed] [Google Scholar] 11. Gill EE, Franco OL, Hancock RE. Antibiotic adjuvants: diverse strategies for controlling drug- resistant pathogens. Chem Biol Drug Des. 2015;85:56–78. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 12. Ke X, Miller LC, Bassler BL. Determinants governing ligand specificity of the Vibrio harveyi LuxN quorum-sensing receptor. Mol Microbiol. 2015;95:127–142. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 13. XavierKB, Bassler BL. Interference with AI-2-mediated bacterial cell-cell communication. Nature. 2005;437:750–753. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16630813 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Cell&title=Bacterially+speaking&author=BL+Bassler&author=R+Losick&volume=125&publication_year=2006&pages=237-246&pmid=16630813& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3591984/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23471618 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Microbiol+Mol+Biol+Rev&title=Exploiting+quorum+sensing+to+confuse+bacterial+pathogens&author=B+LaSarre&author=MJ+Federle&volume=77&publication_year=2013&pages=73-111&pmid=23471618& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3543102/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23125205 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Cold+Spring+Harb+Perspect+Med&title=Bacterial+quorum+sensing:+its+role+in+virulence+and+possibilities+for+its+control&author=ST+Rutherford&author=BL+Bassler&volume=2&publication_year=2012& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18713030 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Annu+Rev+Genet&title=Quorum+sensing+in+staphylococci&author=RP+Novick&author=E+Geisinger&volume=42&publication_year=2008&pages=541-564&pmid=18713030& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4313539/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19686078 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Annu+Rev+Genet&title=Bacterial+quorum-sensing+network+architectures&author=WL+Ng&author=BL+Bassler&volume=43&publication_year=2009&pages=197-222&pmid=19686078& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20638647 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Cell+Host+Microbe&title=Regulatory+RNA+in+bacterial+pathogens&author=K+Papenfort&author=J+Vogel&volume=8&publication_year=2010&pages=116-127&pmid=20638647& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23682605 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Annu+Rev+Microbiol&title=Acyl-homoserine+lactone+quorum+sensing:+from+evolution+to+application&author=M+Schuster&author=DJ+Sexton&author=SP+Diggle&author=EP+Greenberg&volume=67&publication_year=2013&pages=43-63&pmid=23682605& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4510197/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26025903 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Appl+Environ+Microbiol&title=Phenotypic+Heterogeneity,+a+Phenomenon+That+May+Explain+Why+Quorum+Sensing+Does+Not+Always+Result+in+Truly+Homogenous+Cell+Behavior&author=J+Grote&author=D+Krysciak&author=WR+Streit&volume=81&publication_year=2015&pages=5280-5289&pmid=26025903& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4309448/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25592773 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Nat+Commun&title=Quorum+sensing+triggers+the+stochastic+escape+of+individual+cells+from+Pseudomonas+putida+biofilms&author=G+Carcamo-Oyarce&author=P+Lumjiaktase&author=R+Kummerli&author=L+Eberl&volume=6&publication_year=2015&pages=5945&pmid=25592773& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25958185 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Anaerobe&title=Chemical+communication+in+the+gut:+Effects+of+microbiota-generated+metabolites+on+gastrointestinal+bacterial+pathogens&author=SL+Vogt&author=J+Pena-Diaz&author=BB+Finlay&volume=34&publication_year=2015&pages=106-115&pmid=25958185& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4279029/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25393203 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Chem+Biol+Drug+Des&title=Antibiotic+adjuvants:+diverse+strategies+for+controlling+drug-resistant+pathogens&author=EE+Gill&author=OL+Franco&author=RE+Hancock&volume=85&publication_year=2015&pages=56-78&pmid=25393203& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4275348/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25367076 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Mol+Microbiol&title=Determinants+governing+ligand+specificity+of+the+Vibrio+harveyi+LuxN+quorum-sensing+receptor&author=X+Ke&author=LC+Miller&author=BL+Bassler&volume=95&publication_year=2015&pages=127-142&pmid=25367076& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1388276/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16193054 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Nature&title=Interference+with+AI-2-mediated+bacterial+cell-cell+communication&author=KB+Xavier&author=BL+Bassler&volume=437&publication_year=2005&pages=750-753&pmid=16193054& 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 19/27 14. Galloway WR, Hodgkinson JT, Bowden SD, Welch M, Spring DR. Quorum sensing in Gram- negative bacteria: small-molecule modulation of AHL and AI-2 quorum sensing pathways. Chem Rev. 2011;111:28–67. [PubMed] [Google Scholar] 15. Case RJ, Labbate M, Kjelleberg S. AHL-driven quorum-sensing circuits: their frequency and function among the Proteobacteria. ISME J. 2008;2:345–349. [PubMed] [Google Scholar] 16. von Bodman SB, Willey JM, Diggle SP. Cell-cell communication in bacteria: united we stand. J Bacteriol. 2008;190:4377–4391. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 17. Schaefer AL, et al. A new class of homoserine lactone quorum-sensing signals. Nature. 2008;454:595–599. [PubMed] [Google Scholar] 18. Lindemann A, et al. Isovaleryl-homoserine lactone, an unusual branched-chain quorum-sensing signal from the soybean symbiont Bradyrhizobium japonicum. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011;108:16765–16770. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 19. Ahlgren NA, Harwood CS, Schaefer AL, Giraud E, Greenberg EP. Aryl-homoserine lactone quorum sensing in stem-nodulating photosynthetic bradyrhizobia. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011;108:7183–7188. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 20. Flavier AB, Clough SJ, Schell MA, Denny TP. Identification of 3-hydroxypalmitic acid methyl ester as a novel autoregulator controlling virulence in Ralstonia solanacearum. Mol Microbiol. 1997;26:251–259. [PubMed] [Google Scholar] 21. Kai K, et al. Methyl 3-Hydroxymyristate, a Diffusible Signal Mediating phc Quorum Sensing in Ralstonia solanacearum. Chembiochem. 2015;16:2309–2318. [PubMed] [Google Scholar] 22. Genin S, Denny TP. Pathogenomics of the Ralstonia solanacearum species complex. Annu Rev Phytopathol. 2012;50:67–89. [PubMed] [Google Scholar] 23. Tao F, Swarup S, Zhang LH. Quorum sensing modulation of a putative glycosyltransferase gene cluster essential for Xanthomonas campestris biofilm formation. Environ Microbiol. 2010;12:3159– 3170. [PubMed] [Google Scholar] 24. Ryan RP, An SQ, Allan JH, McCarthy Y, Dow JM. The DSF Family of Cell-Cell Signals: An Expanding Class of Bacterial Virulence Regulators. PLoS Pathog. 2015;11:e1004986. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 25. Zhou L, et al. The Multiple DSF-family QS Signals are Synthesized from Carbohydrate and Branched-chain Amino Acids via the FAS Elongation Cycle. Sci Rep. 2015;5:13294. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 26. Deng Y, Wu J, Eberl L, Zhang LH. Structural and functional characterization of diffusible signal factor family quorum-sensing signals produced by members of the Burkholderia cepacia complex. Appl Environ Microbiol. 2010;76:4675–4683. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 27. Miller MB, Skorupski K, Lenz DH, Taylor RK, Bassler BL. Parallel quorum sensing systems converge to regulate virulence in Vibrio cholerae. Cell. 2002;110:303–314. [PubMed] [Google Scholar] 28. van Kessel JC, Rutherford ST, Shao Y, Utria AF, Bassler BL. Individual and combined roles of the master regulators AphA and LuxR in control of the Vibrio harveyi quorum-sensing regulon. J Bacteriol. 2013;195:436–443. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 29. Bassler BL, Wright M, Showalter RE, Silverman MR. Intercellular signalling in Vibrio harveyi: sequence and function of genes regulating expression of luminescence. Mol Microbiol. 1993;9:773– 786. [PubMed] [Google Scholar] 30. Cao JG, Meighen EA. Purification and structural identification of an autoinducer for theluminescence system of Vibrio harveyi. J Biol Chem. 1989;264:21670–21676. [PubMed] [Google Scholar] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21182299 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Chem+Rev&title=Quorum+sensing+in+Gram-negative+bacteria:+small-molecule+modulation+of+AHL+and+AI-2+quorum+sensing+pathways&author=WR+Galloway&author=JT+Hodgkinson&author=SD+Bowden&author=M+Welch&author=DR+Spring&volume=111&publication_year=2011&pages=28-67&pmid=21182299& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18273067 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=ISME+J&title=AHL-driven+quorum-sensing+circuits:+their+frequency+and+function+among+the+Proteobacteria&author=RJ+Case&author=M+Labbate&author=S+Kjelleberg&volume=2&publication_year=2008&pages=345-349&pmid=18273067& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2446813/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18456806 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=J+Bacteriol&title=Cell-cell+communication+in+bacteria:+united+we+stand&author=SB+von+Bodman&author=JM+Willey&author=SP+Diggle&volume=190&publication_year=2008&pages=4377-4391&pmid=18456806& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18563084 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Nature&title=A+new+class+of+homoserine+lactone+quorum-sensing+signals&author=AL+Schaefer&volume=454&publication_year=2008&pages=595-599&pmid=18563084& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3189028/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21949379 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A&title=Isovaleryl-homoserine+lactone,+an+unusual+branched-chain+quorum-sensing+signal+from+the+soybean+symbiont+Bradyrhizobium+japonicum&author=A+Lindemann&volume=108&publication_year=2011&pages=16765-16770&pmid=21949379& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3084126/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21471459 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A&title=Aryl-homoserine+lactone+quorum+sensing+in+stem-nodulating+photosynthetic+bradyrhizobia&author=NA+Ahlgren&author=CS+Harwood&author=AL+Schaefer&author=E+Giraud&author=EP+Greenberg&volume=108&publication_year=2011&pages=7183-7188&pmid=21471459& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9383151 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Mol+Microbiol&title=Identification+of+3-hydroxypalmitic+acid+methyl+ester+as+a+novel+autoregulator+controlling+virulence+in+Ralstonia+solanacearum&author=AB+Flavier&author=SJ+Clough&author=MA+Schell&author=TP+Denny&volume=26&publication_year=1997&pages=251-259&pmid=9383151& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26360813 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Chembiochem&title=Methyl+3-Hydroxymyristate,+a+Diffusible+Signal+Mediating+phc+Quorum+Sensing+in+Ralstonia+solanacearum&author=K+Kai&volume=16&publication_year=2015&pages=2309-2318&pmid=26360813& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22559068 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Annu+Rev+Phytopathol&title=Pathogenomics+of+the+Ralstonia+solanacearum+species+complex&author=S+Genin&author=TP+Denny&volume=50&publication_year=2012&pages=67-89&pmid=22559068& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20636376 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Environ+Microbiol&title=Quorum+sensing+modulation+of+a+putative+glycosyltransferase+gene+cluster+essential+for+Xanthomonas+campestris+biofilm+formation&author=F+Tao&author=S+Swarup&author=LH+Zhang&volume=12&publication_year=2010&pages=3159-3170&pmid=20636376& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4504480/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26181439 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=PLoS+Pathog&title=The+DSF+Family+of+Cell-Cell+Signals:+An+Expanding+Class+of+Bacterial+Virulence+Regulators&author=RP+Ryan&author=SQ+An&author=JH+Allan&author=Y+McCarthy&author=JM+Dow&volume=11&publication_year=2015&pages=e1004986&pmid=26181439& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4542539/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26289160 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Sci+Rep&title=The+Multiple+DSF-family+QS+Signals+are+Synthesized+from+Carbohydrate+and+Branched-chain+Amino+Acids+via+the+FAS+Elongation+Cycle&author=L+Zhou&volume=5&publication_year=2015&pages=13294&pmid=26289160& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2901730/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20511428 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Appl+Environ+Microbiol&title=Structural+and+functional+characterization+of+diffusible+signal+factor+family+quorum-sensing+signals+produced+by+members+of+the+Burkholderia+cepacia+complex&author=Y+Deng&author=J+Wu&author=L+Eberl&author=LH+Zhang&volume=76&publication_year=2010&pages=4675-4683&pmid=20511428& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12176318 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Cell&title=Parallel+quorum+sensing+systems+converge+to+regulate+virulence+in+Vibrio+cholerae&author=MB+Miller&author=K+Skorupski&author=DH+Lenz&author=RK+Taylor&author=BL+Bassler&volume=110&publication_year=2002&pages=303-314&pmid=12176318& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3554009/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23204455 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=J+Bacteriol&title=Individual+and+combined+roles+of+the+master+regulators+AphA+and+LuxR+in+control+of+the+Vibrio+harveyi+quorum-sensing+regulon&author=JC+van+Kessel&author=ST+Rutherford&author=Y+Shao&author=AF+Utria&author=BL+Bassler&volume=195&publication_year=2013&pages=436-443&pmid=23204455& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8231809 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=Mol+Microbiol&title=Intercellular+signalling+in+Vibrio+harveyi:+sequence+and+function+of+genes+regulating+expression+of+luminescence&author=BL+Bassler&author=M+Wright&author=RE+Showalter&author=MR+Silverman&volume=9&publication_year=1993&pages=773-786&pmid=8231809& https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2600086 https://scholar.google.com/scholar_lookup?journal=J+Biol+Chem&title=Purification+and+structural+identification+of+an+autoinducer+for+the+luminescence+system+of+Vibrio+harveyi&author=JG+Cao&author=EA+Meighen&volume=264&publication_year=1989&pages=21670-21676&pmid=2600086& 14/06/2021 Sistemas de resposta de sinal de detecção de quorum em bactérias Gram-negativas https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5056591/ 20/27 31. Hanzelka BL, et al. Acylhomoserine lactone synthase activity of the Vibrio fischeri AinS protein. J Bacteriol. 1999;181:5766–5770. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 32. Higgins DA, et al. The major Vibrio cholerae autoinducer and its role in virulence factor production. Nature. 2007;450:883–886. [PubMed] [Google Scholar] 33. Kelly RC, et al. The Vibrio cholerae quorum-sensing autoinducer CAI-1: analysis of the biosynthetic enzyme CqsA. Nat Chem Biol. 2009;5:891–895. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 34. Ng WL, et al. Signal production and detection specificity in Vibrio CqsA/CqsS quorum-sensing systems. Mol Microbiol. 2011;79:1407–1417. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 35. Wei Y, Perez LJ, Ng WL, Semmelhack MF, Bassler BL. Mechanism of Vibrio cholerae autoinducer-1 biosynthesis. ACS Chem Biol. 2011;6:356–365. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 36. Spirig T, et al. The Legionella autoinducer synthase LqsA produces an alpha-hydroxyketone signaling molecule. J Biol Chem. 2008;283:18113–18123. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 37. Hornung C, et al. The Janthinobacterium sp. HH01 genome encodes a homologue of the V. cholerae CqsA and L. pneumophila LqsA autoinducer synthases. PLoS One. 2013;8:e55045. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 38. Simon S, et al. Inter-kingdom Signaling by the Legionella Quorum Sensing Molecule LAI-1 Modulates Cell Migration through an IQGAP1-Cdc42-ARHGEF9-Dependent Pathway. PLoS Pathog. 2015;11:e1005307. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar] 39. Schauder S, Shokat K, Surette MG, Bassler BL. The LuxS family of bacterial autoinducers: biosynthesis of a novel quorum-sensing signal molecule. Mol Microbiol. 2001;41:463–476. [PubMed]
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