pH:

• o sítio ativo da enzima  pode conter aminoácidos com grupos ionizados que podem variar com pH.
• A ionização de aminoácidos que não estão no sítio ativo pode provocar modificações na conformação da enzima.
• O substrato pode ser afetado pelas variações de pH

Temperatura: toda enzima tem uma temperatura ótima de trabalho. Sendo assim, variações de temperatura podem interferir na velocidade da reação enzimática, até mesmo desnaturá-la.

Concentração de enzimas: afeta a velocidade de transformação do substrato em produto final.

Cofatores: algumas enzimas precisam de um cofator para entrarem em reação, outras não.

Inibidores: podem ocupar o centro ativo ou alterar a conformação espacial da enzima, inibindo sua ação catalítica.