PROVA AV2 BIOTECNOLOGIA E BIOINFORMATICA

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PROVA AV2 BIOTECNOLOGIA/ BIOINFORMATICA
3.Pergunta 1. A tecnologia do DNA recombinante permite aos geneticistas criarem novos genótipos, ou seja, organismos podem “adquirir” novos genes. A utilização de vetores é uma das principais ferramentas dessa “nova possibilidade” da engenharia genética.
Qual o papel dos vetores para a tecnologia do DNA recombinante?
Os vetores promovem intensa proliferação da célula hospedeira.
Os vetores carregam o gene de interesse para dentro da célula hospedeira.
Os vetores ligam as extremidades dos fragmentos de DNA que estão sendo recombinados.
Os vetores são capazes de cortar o DNA em posições com sequências específicas de nucleotídeos.
Os vetores provocam a morte das células hospedeiras.
4.Pergunta 2. A anotação de um genoma pode ser dividida em duas etapas: predição gênica e anotação funcional.
O que é feito na etapa de predição gênica?
A função biológica das proteínas codificadas pelos genes é identificada.
A relação evolutiva entre os genes é determinada através do resultado de alinhamentos.
A ordem dos nucleotídeos no DNA é determinada.
Os fragmentos de DNA sequenciados são sobrepostos através das suas regiões alinhadas.
Os genes são identificados ao longo da sequência de DNA.
5.Pergunta 3. Um pesquisador do INCA decidiu sequenciar o genoma (todo o DNA da célula) de um paciente com câncer de pulmão agressivo (paciente 1) para comparar o resultado com o genoma de outro paciente que vêm tendo uma evolução mais lenta e favorável da doença (paciente 
 Qual tecnologia de sequenciamento de DNA ele deve utilizar?
Ainda não é possível o sequenciamento de genomas completos.
Reação em Cadeia da Polimerase (PCR).
Qualquer tecnologia de sequenciamento de nova geração.
Técnica desenvolvida por Sanger.
Qualquer tecnologia de sequenciamento de primeira geração
6.Pergunta 4. Depois dos resultados do sequenciamento genômico, o pesquisador agora deseja analisar a expressão dos genes e comparar o resultado desses dois pacientes. Para isso ele analisou o conjunto completo de RNAs de uma biopsia do pulmão dos pacientes. 
Como é chamada a abordagem ômica utilizada pelo pesquisador nesse caso?
 
Metagenômica.
Transcriptômica.
Proteômica.
Genômica.
Metabolômica.
7.Pergunta 5. Depois de verificar que o gene p53 tinha influência na evolução do câncer de pulmão, o pesquisador precisou buscar mais informações sobre a proteína P53, codificada por esse gene. Para isso ele acessou um banco de dados primário com a estrutura tridimensional de diferentes proteínas.
Qual dos bancos de dados abaixo ele deve utilizar no caso descrito? 
(10 Pontos)
Uniprot.
RefSeq.
GenBank.
PDB.
PubMed.
8.Pergunta 6. O BLAST é um programa muito utilizado em bioinformática e está instalado em vários sites de bancos de dados.
Sobre o BLAST, é correto afirmar que:
 
É uma ferramenta de alinhamento, que pode ser usada para buscar por sequências similares.
Esse programa usado para construção de árvores filogenéticas.
Esta é uma ferramenta usada para sequenciar o DNA e determinar a ordem de nucleotídeos.
Esta ferramenta é ideal para construção de primers.
Esse programa é indicado para encontrarmos artigos científicos com temas de interesse.
9.Pergunta 7. Primers ou iniciadores são sequências de nucleotídeos que se ligam de forma complementar a um DNA molde e permitem que a replicação aconteça. Na Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), eles indicam a região do DNA molde que será amplificada, pois cada um dos primers se liga a uma das extremidades do molde. Um dos fatores que contam para que a PCR seja eficiente são as características dos primers. 
Explique uma característica importante dos primers, que deve ser levada em consideração para garantir a qualidade da PCR.
Uma das características para garantir uma qualidade melhor do PCR, é importante o comprimento do primer não ser inferior a 15 bases nitrogenadas, Conteúdo G+C : Entre 40 60% estabilidade, a temperatura de Melting Tm, Depende da temperatura de Melting Recomendado valores entre 50 e 60C.
10.Pergunta 8. Através do portal do NCBI (National Center for Biotechnology Information) é possível ter acesso a diferentes bancos de dados biológicos. É importante saber de qual dado precisamos para escolher corretamente em qual banco vamos realizar a busca. 
Caso você esteja desenvolvendo um estudo sobre as variantes do SARS-CoV-2, vírus causador da COVID-19, qual banco do NCBI você deveria acessar para obter sequências de nucleotídeos curadas por especialistas e que poderiam ser usadas como referência?
RefSeq é um banco de dados curados de Nucleotídeos