questoes biomolecular

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1.Estudamos as teorias do surgimento da vida e as
características estruturais das moléculas que compõem o
genoma. Sobre esses assuntos, leia as afirmativas abaixo e
responda.
I. A teoria de Oparin e Haldane era a mais aceita até a
descoberta do meteoro de Murchinson; a partir de então, a
mais aceita foi a da panspermia.
II. A teoria mais aceita atualmente para a origem da vida
na Terra é derivada da teoria de Oparin e Haldane,
segundo a qual a vida surgiu de forma espontânea a partir
de pequenas moléculas orgânicas.
III. O RNA e o DNA são moléculas capazes de armazenar
informação genética; entretanto, o DNA é mais estável e
se consolidou nessa função.
IV. O mundo RNA dependia de organismos complexos.
Estão corretas as afirmativas:
II e III.
2.Vimos as principais diferenças na organização das
células procariontes e eucariontes. Sobre a organização
nos eucariotos, como você espera que esteja organizado o
DNA de uma célula pronta para se replicar?
DNA desenovelado em estado de eucromatina.
3.São exemplos de modificações pós-transcricionais em
organismos eucariontes:
Adição da cauda poli-A e adição do cap 5’.
4.Quais são as principais funções da DNA polimerase I e
da III, respectivamente?
Remover os primers de RNA, adicionando DNA, e
construir a fita líder.
5.Apesar das diferenças ecológicas, genéticas e
fisiológicas, os genes e genomas dos procariotos –
bactérias e arqueas – possuem alguns aspectos
semelhantes. Sobre os seus conhecimentos nesse assunto,
marque a alternativa que traz uma característica dos
genomas procarióticos. marque a alternativa que traz uma
característica dos genomas procarióticos.
Uma característica típica dos genes procarióticos é a
existência de colinearidade entre um gene e seu produto.
6.Em um cenário onde não há presença de a glicose, as
bactérias da espécie E. coli tem a capacidade de utilizar a
lactose como fonte de energia. O operon lac é necessário
para codificar as enzimas fundamentais para a absorção e
metabolismo da lactose. Na regulação do operon lac, se a
lactose estiver presente no meio, ocorre:
A ligação da lactose ao repressor, impedindo a ligação ao
operador e os genes são transcritos.
7.É comum que células eucarióticas sejam maiores e mais
complexas quando comparadas com células procarióticas.
Além do aspecto morfológico, o genoma das primeiras
também tem tamanho e complexidade maiores que as
segundas. Analise as afirmativas, levando em
consideração a organização e estrutura dos genes
eucarióticos.
I – Sequências de íntrons estão presentes no DNA
genômico eucariótico, mas são removidas durante o
processamento do RNA maduro.
II – Comparando diferentes grupos de eucariotos, percebe-
se uma frequente falta de associação entre a complexidade
biológica do organismo e o tamanho do seu genoma.
III – As regiões reguladoras dos genes eucarióticos
geralmente apresentam um número menor de elementos
reguladores que os genomas procarióticos.
IV – Analisando o DNA de ribossomos e lisossomos,
sugere-se que o genoma eucariótico possui origem híbrida.
É correto o que se afirma nas afirmativas:
I e II
8.Os elementos transponíveis são sequências de DNA
capazes de se integrarem por transposição em outros lócus
genômicos. Os ________________ constituem a maioria
dos elementos móveis de eucariotos e sua mobilização
envolve a transcrição reversa de um intermediário de
RNA. Já os ______________ são mobilizados por meio de
intermediários de DNA e representam uma parte menor
dos elementos transponíveis eucarióticos.
Qual das alternativas apresenta a sequência adequada de
denominações que preenche a sentença?
retrotransposons - transposons
9.De maneira geral e resumida, os genes são formados por
regiões codificadoras, que são as sequências nucleotídicas
que codificam o RNA, e pelas sequências reguladoras que
controlam a sua expressão. Em relação às sequências
reguladoras de procariotos e eucariotos, marque a
alternativa correta:
RNA, e pelas sequências reguladoras que controlam a sua
expressão. Em relação às sequências reguladoras de
procariotos e eucariotos, marque a alternativa correta:
O promotor, localizado a montante da região codificadora,
é o sítio de ligação do complexo de transcrição.
10.Em procariotos e eucariotos, o DNA genômico é
compactado em um arranjo complexo, cujo grau de
compactação varia de acordo com o estado funcional do
DNA. Chamamos esse arranjo de cromatina. O
nucleossomo é a forma estrutural básica da cromatina
eucariótica, formada por DNA e proteínas chamadas de:
Histonas
11.A partir da elucidação da estrutura do DNA, os
pesquisadores Francis Crick e James Watson postularam
que o mecanismo para a síntese das novas fitas era
semiconservativo. A confirmação de que os pesquisadores
estavam certos veio em 1958 a partir dos experimentos de
Matthew Meselson e Franklin Stahl, que cultivaram a
bactéria Escherichia coli em meios contendo um isótopo
pesado de nitrogênio (15N) e um nitrogênio com
densidade mais leve, o 14N. Como é caracterizada a
síntese semiconservativa de DNA?
Na síntese semiconservativa, a dupla hélice de cada
molécula filha de DNA contém um filamento original e
um filamento recém-sintetizado
12.A síntese do DNA é um mecanismo fundamental para a
transmissão do material genético. Durante o processo de
replicação, a enzima DNA polimerase constrói a nova fita
com base no molde (fita parental), cuja
complementariedade das bases (A,T,C,G) determina qual
nucleotídeo será adicionado. Para conseguir adicionar
nucleotídeo, a DNA polimerase precisa de uma
extremidade 3’-OH livre e por isso a síntese só ocorre no
sentido 5’-3’. Nesse contexto, como é possível que a
síntese das fitas filhas ocorra simultaneamente?
Uma das fitas filhas é sintetizada continuamente, enquanto
a outra é polimerizada de forma descontínua, por meio de
diversos fragmentos (fragmentos de Okasaki).
13.A expressão gênica consiste em utilizar a informação
contida em um gene e transformá-la em um produto
funcional como as proteínas. Para que isso ocorra é
necessário um sistema complexo contendo DNA, RNA,
enzimas, proteínas e diversos outros fatores. A transcrição
do DNA em mRNA é uma das primeiras etapas para a
expressão do gene. Com base no que você aprendeu sobre
transcrição, marque a alternativa correta.
Tanto na transcrição dos procariotos quanto dos
eucariotos, o mRNA é o grande responsável por ler e
transportar a informação contida no gene para os
ribossomos.
14.A RNA polimerase é a enzima que catalisa a adição de
ribonucleotídeos à cadeia crescente de mRNA durante a
transcrição. A síntese de RNA pela RNA polimerase
acontece em organismos procarióticos e eucarióticos,
porém, em ambos, a RNA polimerase só é capaz de iniciar
a transcrição na presença de outros fatores.
No caso dos procariotos, o fator sigma precisa se associar
à RNA polimerase, pois é ele que reconhece o promotor
do gene.
A tradução consiste na síntese de proteínas pelos
ribossomos a partir da leitura das informações contidas no
RNA mensageiro. O responsável por traduzir a informação
para os ribossomos é o tRNA, que identifica o aminoácido
que deve ser adicionado à cadeia polipeptídica crescente.
Como o mRNA fornece a informação para o tRNA?
A informação é fornecida por meio dos códons, que são
grupos de três nucleotídeos presentes na molécula de
mRNA.
O código genético começou a ser desvendado em 1961
pelo bioquímico Marshall W. Nirenberg e seus colegas.
Nessa época, já se sabia que três nucleotídeos
correspondiam a um aminoácido, porém somente em 1965
é que o código genético foi total decifrado, verificando-se
que ele era degenerado. Por que o código genético é
degenerado?
Porque vários códons especificam o mesmo aminoácido.
Os erros gerados pelo mal emparelhamento entre um par
de bases pode ser perpetuado e se tornar uma mutação se
não for corrigido antes da replicação da sequência que
contém a base errada. Os problemas causados por
mutações podem interferir nas sequências dos códons,
afetando o produto final, a proteína. Com relação a isso,
assinale a alternativa correta.
A mutação com sentido trocadoé caracterizada por uma
modificação em uma das bases do códon que irá
especificar um aminoácido diferente.
As mutações induzidas são geradas pela ação de um
agente mutagênico químico ou físico. Os agentes
mutagênicos são capazes de alterar a taxa de mutação
normal de um organismo. As substâncias 5-bromouracila,
por exemplo, são capazes de substituir uma timina durante
a replicação, graças à sua semelhança com essa base. Com
relação às mutações e aos agentes mutagênicos, assinale a
alternativa correta.
Um agente mutagênico bastante conhecido são as bases
análogas, que consistem em moléculas estruturalmente
semelhantes a uma das quatro bases nitrogenadas.
Os operons são responsáveis pela expressão de uma série
de proteínas com determinada função final em comum,
como é o caso, por exemplo, de uma via metabólica. Que
tipo de influência sobre o operons o produto dessa via
tende a realizar?
O produto da via metabólica tende a inibir a expressão
do operon.
Sabemos que o RNAm dos procariotos é formado por
diversos trechos, formando apenas um RNAm chamado de
policistrônico. Considerando as regulações da expressão
gênica de tais organismos, estão corretas somente as
afirmativas: 
I. A presença de glicose, mesmo em altas concentrações de
lactose, é capaz de inibir o operon Lac. 
II. O operon TRP possui duas regulações, ambas
dependentes de triptofano. 
III. As regiões “operadoras” do operon Lac são
responsáveis pelo acoplamento da RNA polimerase. 
IV. A formação dos diferentes grampos na região trpL do
operon TRP é fundamental para o funcionamento dessa
região.
I, II e IV.
Alguns seres procariotos possuem um DNA muito mais
extenso que o DNA dos organismos eucariontes, mas o
nível de complexidade de um ser unicelular é bem menor.
Como isso se explica?
O DNA dos eucariotos é menor, porque o RNAm
processado já passou por uma série de alterações que
causam uma enorme diversidade, expressando, assim,
diferentes proteínas.
A expressão gênica em eucariotos possui diferentes pontos
de regulação, visando a um ajuste fino em todos os
processos devido à alta complexidade. Um desses ajustes é
a adição do cap 5’ e da cauda poli A. Em qual etapa da
regulação esses dois exemplos se encaixam?
Pós-transcricional
A epigenética estuda como as alterações causadas no
padrão de expressão gênica modificam a vida de um
organismo. Dentro desse contexto, quais alterações são
consideradas epigenéticas?
Metilação do DNA, metilação e acetilação de histonas e
interferência de miRNAs.
Alguns padrões epigenéticos podem ser herdados,
perpetuando para os filhos características oriundas de um
ambiente ou de condições que os pais viveram. Os traumas
da Segunda Guerra, por exemplo, levaram para uma nova
geração algumas doenças devido à mudança de um padrão
de expressão gênica. Qual das afirmativas a seguir explica
da melhor forma o motivo da hereditariedade de padrões
epigenéticos?
O apagamento dos padrões epigenéticos ocorre logo antes
da formação dos gametas para que os gametas sejam
isentos de alterações prejudiciais; entretanto, algumas
dessas marcações se perpetuam na reprogramação e são
passadas adiante.
Estudamos as diferenças entre hipótese nula e hipótese
alternativa e os possíveis erros gerados a partir da
interpretação errada dessas análises. O erro tipo 1 consiste
em:
Rejeitar a hipótese nula, uma vez que a hipótese nula é
verdadeira.
O armazenamento de amostras biológicas é fundamental
para uma boa análise. Com base no que estudamos, qual
seriam as melhores condições para armazenamento de
uma amostra de tecido, por mais de 1 semana, para a
extração de RNA?
Após a coleta, um rápido congelamento em nitrogênio
líquido (-196°C), seguido do congelamento a -70°C.
Vimos que existem diferentes técnicas para avaliação da
qualidade das amostras de DNA e RNA obtidas. Além
disso, vimos que uma das técnicas é a mais utilizada para
quantificar as amostras. Sobre esse assunto, marque a
alternativa correta.
Fluorometria: quantificamos a partir da intensidade da
fluorescência.
A extração de DNA/RNA é uma importante técnica de
biologia molecular a qual pode ser empregada em
amostras clínicas, alimentos, forenses, plantas entre outras.
A partir da extração de DNA/RNA, é possível a realização
de outras técnicas moleculares como a quantificação de
material genético e reação em cadeia de polimerase
(PCR). Sobre a técnica de extração de DNA/RNA,
responda qual desses elementos abaixo é empregado na
extração de DNA/RNA?
Solução de fenol/clorofórmio
Vimos que a PCR é uma ferramenta molecular para
amplificação do DNA in vitro. Sobre a PCR, é correto
afirmar que
a especificidade da reação é por oligonucleotídeos
iniciadores para demarcar a sequência e permitir que a
polimerase inicie a síntese.
A PCR convencional contém diversas etapas, desde
pipetagem da reação até sua leitura. Considerando as
etapas, leia as afirmativas a seguir e assinale a alternativa
correta: 
I - A temperatura de desnaturação deve ser alta o
suficiente para separar as fitas duplas de DNA em fitas
simples.
II - A Taq polimerase é termorresistente e sua temperatura
ótima de síntese de DNA é próxima a 70ºC.
III - Logo após a amplificação, podemos facilmente
visualizar o resultado, pois se trata de reação
colorimétrica.
IV - Para identificarmos se nossa sequência-alvo foi
amplificada, devemos separar as moléculas de acordo com
o tamanho, através de eletroforese em gel de agarose, e
depois revelar, usando intercalantes de DNA fluorescentes
em ultravioleta.
V - A eletroforese usa a carga negativa do DNA para fazê-
lo migrar através do gel em direção ao cátodo, quando
submetido à corrente elétrica.
Somente as afirmativas I, II, IV e V estão corretas.
A PCR possui diversas aplicações, sejam elas práticas ou
na pesquisa. A respeito da aplicação da PCR e de suas
variações, é correto afirmar que
na RT-PCR, ocorrem duas reações subsequentes: uma de
síntese de cDNA a partir de RNA, e outra de amplificação
da sequência-alvo presente no cDNA.
Existem diferentes técnicas de PCR com aplicações
variadas. Considerando isso, leia as afirmativas abaixo e,
em seguida, assinale a alternativa correta. 
I – Podemos usar PCR convencional para amplificar um
gene e cloná-lo em um vetor, e modificarmos
geneticamente um organismo simples.
II – Pelo uso de diferentes sondas marcadas com sinais
diferentes, a qPCR TaqMan pode ser usada na
identificação e quantificação de mutações em diferentes
alelos.
III – As técnicas moleculares são de pouca importância na
rotina clínica, pois são demoradas e de aplicações muito
restritas.
IV – O tamanho de STRs é relevante no diagnóstico de
doenças genéticas.
Somente as afirmativas I, II e IV estão corretas.
A PCR possui diversas aplicações, sejam elas práticas ou
na pesquisa. A respeito da aplicação da PCR e de suas
variações em ciências forenses, é correto afirmar que:
as STRs são regiões cuja variabilidade as tornam úteis
para distinguir indivíduos geneticamente.
A técnica de PCR e suas variações são metodologias
importantes para amplificações na pesquisa e diagnósticos.
Sobre a PCR, escolha a alternativa correta:
Ao utilizar a técnica para amplificar o DNA (ou RNA) de
algum agente infeccioso, podemos diagnosticar uma
infecção, já que o material genético de tal agente não
deveria estar presente naquela amostra biológica.