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ESTUDO DIRIGIDO 3 MÓDULO 1 1 Bioquímica Química e Função de Aminoácidos 1) Qual a estrutura geral de um aminoácido? Todos os 20 aminoácidos comuns são α-aminoácidos. Eles possuem um grupo carboxil e um grupo amino ligados ao mesmo átomo de carbono (o carbono α). Eles diferem uns dos outros em suas cadeias laterais, ou grupos R, os quais variam em estrutura, tamanho e carga elétrica e influenciam a solubilidade dos aminoácidos em água. Para todos os aminoácidos comuns, exceto a glicina, o carbono α está ligado a quatro diferentes grupos. Na glicina o grupo R é um outro átomo de hidrogênio. Os aminoácidos possuem dois possíveis estereoisômeros, em decorrência do arranjo tetraédrico dos orbitais ligantes ao átomo de carbono α. 2) Explique a semelhança estrutural entre um monossacarídeo e um aminoácido. Assim como os monossacarídeos, os aminoácidos - exceto a glicina - são formados por um átomo central de carbono assimétrico ligado a quatro grupos distintos, sendo, portanto, opticamente ativos. No caso dos aminoácidos, os grupos devem ser um carboxil, um amino e um hidrogênio, variando, apenas, o radical da cadeia lateral. 3) Quais são os grupos dos aminoácidos? Quais são as diferenças entre tais grupos? Cite 3 exemplos de aminoácidos de cada grupo. - Grupos R alifáticos, não polares: Os grupos R nessa classe de aminoácidos são hidrofóbicos e não polares; Alanina, Leucina, Isoleucina. - Grupos R aromáticos: Os grupos R nessa classe são relativamente hidrofóbicos. Todos podem participar de interações hidrofóbicas; Fenilalanina, Tirosina, Triptofano. ESTUDO DIRIGIDO 3 MÓDULO 1 2 - Grupos R não-carregados, polares: Os grupos R desses aminoácidos são mais hidrofílicos que os grupos R não polares, porque eles contêm grupos funcionais que formam pontes de hidrogênio com a água; Serina, Cisteína, Glutamina. - Grupos R carregados negativamente: Aspartato, Glutamato; Os dois aminoácidos citados têm grupos R com uma carga líquida negativa em pH neutro. Ambos possuem um segundo grupo carboxila na molécula. - Grupos R carregados positivamente: Lisina, Histidina, Arginina; Os grupos R mais hidrofílicos são aqueles que são carregados positiva ou negativamente. Os aminoácidos citados possuem grupos R com carga positiva líquida em pH 7,0. Os grupos R exemplificados diferem quanto: aos valores de pKa em seus grupos ácidos e básicos; a ocorrência nas proteínas; e ao índice hidroprático. 4) Cite algumas funções dos aminoácidos comuns e dos aminoácidos incomuns. Os 20 aminoácidos das proteínas são denominados aminoácidos primários para distingui-los dos aminoácidos menos comuns - que são resíduos modificados no interior das proteínas, depois que elas são sintetizadas - e de muitos outros tipos de aminoácidos presentes nos organismos vivos, mas não nas proteínas. Aminoácidos incomuns: Ácido γ-carboxiglutâmico, um aminoácido ligado ao cálcio e encontrado na protrombina, uma proteína da cascata de coagulação sanguínea. Aminoácidos comuns: Fenilalanina, um aminoácido essencial usado para produzir diversos aminoácidos úteis. 5) Como os aminoácidos funcionam como Zwetterion? Quando um aminoácido é dissolvido em água, ele existe na solução como um íon dipolar, ou zwitterion (íon hibrido). Um zwitterion pode agir tanto como um ácido (doador de próton), quanto uma base (receptora de próton). As substâncias que exibem essa natureza são ditas anfóteras e frequentemente chamadas de anfólitos, contração de eletrólitos anfóteros. ESTUDO DIRIGIDO 3 MÓDULO 1 3 6) Defina pKa. O pKa é uma maneira de expressar a força de um ácido. Ele é calculado pela fórmula 𝑝𝐾𝑎 = − log 𝐾𝑎 , onde Ka é a constante de dissociação de um ácido. 7) Defina ponto isoelétrico. O ponto isoelétrico designa o pH característico onde a carga elétrica líquida é zero. O pI pode ser calculado através da média aritmética dos dois valores de pKa, ou seja: 𝑝𝐼 = 1 2 (𝑝𝐾1 + 𝑝𝐾2). 8) Como se dá uma ligação peptídica? A ligação peptídica se dá na união covalente entre duas moléculas de aminoácidos por uma ligação amida substituída, para formar um dipeptídeo. Tal ligação é formada por desidratação de um grupo α-carboxila de um aminoácido e de um grupo α-amino de outro. A formação da ligação peptídica é um exemplo de reação de condensação. 9) Como se dá a função biológica de um peptídeo? Nenhuma generalização pode ser feita com relação aos pesos moleculares de peptídeos e proteínas biologicamente ativas em relação a suas funções. Peptídeos de ocorrência natural variam e tamanho, entre dois a muitos milhares de resíduos de aminoácidos. Mesmo os menores peptídeos podem ter efeitos biológicos importantes. É o caso do dipeptídeo comercial sintético conhecido como aspartame, um adoçante artificial. Muitos peptídeos de pequeno tamanho exercem seus efeitos em concentrações muito pequenas. Por exemplo, diversos hormônios de vertebrados são peptídeos de pequeno tamanho, como a oxitocina (9 resíduos) e a bradicinina (9 resíduos). Um pouco maiores são os pequenos polipeptídeos e os oligopeptídeos, como a insulina (duas cadeias ESTUDO DIRIGIDO 3 MÓDULO 1 4 polipeptídicas, uma com 30 e outra com 21 resíduos de aminoácidos), o glucagon (29 resíduos) e a corticotropina (39 resíduos). 10) O que são proteínas conjugadas? Cite exemplos com funções. Proteínas que contêm componentes químicos permanentemente associados além dos aminoácidos são denominadas proteínas conjugadas. A porção não-aminoácida de uma proteína conjugada é denominada grupo prostético. As proteínas conjugadas são classificadas com base na natureza química de seus grupos prostéticos. Algumas proteínas contêm mais de um grupo prostético. Geralmente, o grupo prostético tem um importante papel na função biológica das proteínas. Classe Grupo(s) prostético(s) Exemplo Lipoproteínas Lipídeos 1-Lipoproteína do sangue Glicoproteínas Carboidratos Imunoglobulina G Fosfoproteínas Grupo fosfato Caseína do leite Hemoproteínas Heme (ferro porfirina) Hemoglobina 11) Como se dá os níveis estruturais de uma proteína? Quatro níveis de estrutura de proteínas costumam ser definidos. Uma descrição de todas as ligações covalentes que conectam os resíduos de aminoácidos em uma cadeia polipeptídica está em sua estrutura primária. O elemento mais importante de sua estrutura primária é a sequência de resíduos aminoácidos. A estrutura secundária refere-se a arranjos de aminoácidos particularmente estáveis, dando origem a padrões estruturais recorrentes. A estrutura terciária descreve todos os aspectos do dobramento tridimensional de um polipeptídeo. Quando uma proteína possui duas ou mais cadeias polipeptídicas sua organização espacial é denominada estrutura quaternária.
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