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28/11/2018 1 Enzimologia 1. Por que você considera as enzimas importantes? Dê dois exemplos. 2. Faça uma breve revisão histórica da descoberta das enzimas. 3. Toda enzima é uma proteínas mas nem toda proteína é uma enzima, essa afirmação está correta ? Justifique 4. Defina e cite exemplos do que são: Cofatores, Coenzimas, Grupo prostético, Holoenzima e Apoproteína. 5. Qual o princípio de nomenclatura enzimática? Vida 1. Autorreplicação 2. Catalisar reações químicas Enzimas Mais notáveis Especializadas Altamente Eficiência catalítica Aceleram reações químicas Poucos catalisadores não-biológicos possuem essa função Intolerância à lactose • Lactose em galactose e glicose Quimosina 28/11/2018 2 Introdução às enzimas 1850 Louis Pasteur Açúcar em álcool por leveduras (fermentos) inseparáveis da estrutura das células 1897 Eduard Buchner Fermentação somente com extratos da levedura Ativas mesmo fora das células Frederick W. Kühne Enzimas Chave-fechadura Postulados As enzimas realizam reações catalíticas e transformam moléculas umas nas outras Os organismos biológicos são ricos em enzimas e as enzimas funcionam também fora dos organismos biológicos → biotecnologia! Postulados As enzimas são proteínas formadas por polímeros de aminoácidos (Na maioria das vezes) A multiplicidade de função se dá pela interação tridimensional formada (modelo chave-fechadura) por interações não-covalentes a partir de uma série de aminoácidos ligados covalentemente (ligação peptídica) Enzima é sempre proteína? Não!, há alguns RNAs que funcionam enquanto enzimas também Componente químico adicional necessário para a função Cofator: íons inorgânicos Coenzima: moléculas orgânicas complexas Se liga muito firmemente: grupo prostético Enzima completa: holoenzima Parte protéica: apoenzima ou apoproteína Enzima completa 28/11/2018 3 Enzimas Ribozima Molécula de RNA com atividade catalítica Coenzima Carreadores transitórios de grupos funcionais específicos A maioria deles é derivada das vitaminas Deve estar na dieta em pequenas quantidades Coenzima Vitaminas Coenzimas Nomenclatura Normalmente se adiciona o sufixo ase ao nome do substrato ou à atividade realizada Urease – hidrolisa a ureia DNA-polimerase – polimeriza DNA Reação enzimática Reação se dá em fases: Enzima aumenta a velocidade das reações Os catalisadores aumentam a velocidade das reações porque diminuem a energia de ativação 28/11/2018 4 Sem enzima...com enzima... Interferências na ação enzimática Temperatura Enzimas humanas está entre 35 e 40ºC. Acima de 40ºC, as enzimas desnaturam. pH Cadeias laterais ionizáveis ou não ionizáveis Hexoquinase Sofre um ajuste induzido quando ligada ao substrato Fosforila um resíduo de glicose Primeiro passo da via glicolítica Inibidores de Proteases PROBLEMA I Uma mulher de origem hispânica, 48 anos de idade, apresentava queixas de distensão abdominal, flatulências e diarreia episódios há um ano. Esses sintomas ocorriam de 30 minutos a 4 horas após as refeições. Ela não recordava de fatores agravantes, mas lembra, de que se sentia melhor pela manhã antes de começar a se alimentar. Um jejum de 8 horas era suficiente para provocar um completo alívio de todos os sintomas. Não havia outras queixas clínicas correlatas. Relatava apenas que nos últimos 15 anos apresentava dor na região lombar atribuída à osteoporose. Há um ano, seu médico a aconselhara a ingerir três xícaras de leite por dia, para aumentar sua ingestão diária de cálcio PROBLEMA I 1. Existe algum termo no problema que você não entendeu? 2. Qual ou quais são os problemas? 3. O que você sabe sobre o problema? Como você poderá resolvê-lo? 4. Quais são os temas que teremos que aprender? 5. Faça então, os objetivos do estudo que você fará. 6. Estude os temas escolhidos e faça resumo de todos eles 28/11/2018 5 Aminoácidos 20 tipos de aminoácidos Ligados covalentemente Sequências lineares “semelhante ao alfabeto” Podem ser produzidos milhões de componentes Hormônios, enzimas, teias de aranhas, chifres...etc Queratina Aminoácidos Proteínas são polímeros De vários aminoácidos ligados Covalente 20 tipos Alfa-aminoácidos Diferentes entre si pelas cadeias laterais Ou Grupos R Variação de tamanho Carga elétrica e solubilidade em água Estrutura geral Estrutura comum Exceto prolina Grupo amino Grupo Carboxílico Hidrogênio Carbono alfa Quiral Lisina Comparações 28/11/2018 6 Grupos R apolares e alifáticos Apolar Alifático Não tem anel aromático Grupos R aromáticos Anéis fechados Grupos R não-carregados, polares Pontes de hidrogênio com a água Grupos R positivos ou negativos Positivo Básico Negativo Ácido Aminoácidos essenciais O organismo humano é incapaz de sintetizar cerca de metade dos vinte aminoácidos comuns. Tem então de os obter através da dieta, pela ingestão de alimentos ricos em proteínas. • Fenilalanina • Histidina • Isoleucina • Lisina • Leucina • Metionina • Treonina • Triptofano • Valina Aminoácidos não essenciais O organismo humano é capaz de sintetizar cerca de metade dos vinte aminoácidos comuns • Alanina • Arginina • Ácido aspártico • Cisteína • Ácido glutâmico • Glutamina • Glicina • Prolina • Serina • Asparagina • Pirrolisina 28/11/2018 7 Ligação peptídica Formação de um dipeptídeo Desidratação Reação de um grupo carboxila com amino Ligação peptídica H2O Peptídeos Condensações 2 a 100 resíduos Peptídeos biologicamente ativos Aspartame, Hormônios ( Oxitocina, bradicinina), venenos e antibióticos Insulina (30 e 21) e glucagon (29) Peptídeos Classificação dos peptídeos De acordo com o número de aminoácidos Dipeptídeo, tripeptídeo, tetrapeptídeo... Oligopeptídeo Polipeptídeo Peptídeos de importância biológica 28/11/2018 8 Estrutura primária Sequência de aminoácido, esqueleto covalente Estrutura primária Aminoácidos sulfurados ( cisteína) pontes dissulfeto Estabilizam a estrutura tridimensional das proteínas Estrutura secundária Arranjo espacial hélices, folhas ou dobras Estrutura terciária Arranjo tridimensional global Depende da sequencia de aminoácidos Estrutura Quaternária Estrutura das proteínas 28/11/2018 9 Questões importantes Como as enzimas funcionam? O que é catálise? Explique o que é equilíbrio da reação e a velocidade da reação. Os dois fatores são alterados pela ação enzimática? Explique o porquê. O que é estado fundamental e estado de transição? Represente no gráfico e dê as definições Conceitue os intermediários de uma reação? Porque eles não devem ser confundidos com o estado de transição? Por que o conceito de chave-fechadura é errado? Qual seria a real interação entre a enzima e seu substrato? O que é energia de ligação?? Como as enzimas funcionam A catálise enzimática Sem catálise lentas As enzimas proporcionam Ambiente ideal Cadeias laterais Ligação aos substratos Transformação química Englobando As enzimas alteram a velocidade da reação, não o equilíbrio Variação da energia Energia livre Ponto de partida Estado fundamental A função do catalisador é aumentar a velocidade da reação. A catálise não afeta o equilíbrio da reação. Reaçãocatalisada por enzima com uma não catalisada Para a reação ocorrer Moléculas mais alto de energia O topo da curva Estado de transição Pode ir para um lado ou outro Não são os intermediários Os catalisadores aumentam a velocidade das reações por diminuírem as energias de ativação. Pontos importantes da ação enzimática Essas enzimas não apenas aceleram as reações, mas também as organizam e as controlam de modo que boa parte da energia liberada é recuperada em outras formas químicas; As reações podem ter várias etapas, incluindo a formação e o consumo de espécies químicas transitórias denominadas intermediários da reação. Etapa limitante da velocidade é o ponto de maior energia no diagrama da interconversão entre S e P. A energia de ativação é uma barreira energética para as reações químicas. As interações fracas entre enzima e substrato são otimizadas no estado de transição 28/11/2018 10 As interações fracas entre enzima e substrato são otimizadas no estado de transição Chave em uma fechadura?? As ENZ não se encaixam perfeitamente Estabilização do substrato Reação não ocorrerá Complementares Estado de transição da reação As interações fracas entre enzima e substrato são otimizadas no estado de transição Grupos catalíticos Ácido-base A enzima transfere prótons para o substrato Covalente A enzima se liga covalentemente ao substrato Íons metálicos Estabilizam o substrato no estado de transição As enzimas podem ser reguladas Expressão gênica Regulação alostérica Efetores positivos Efetores negativos Modificação covalente Zimogênio Apenas em determinadas situações Cinética enzimática Determinar as constantes de afinidade de substratos e dos inibidores Conhecer as condições ótimas da catálise Ajudar a elucidação do mecanismo da reação Função enzimática e rota metabólica Cinética enzimática 28/11/2018 11 Velocidade da reação x substrato Inibição Não competitiva Velocidade da reação x substrato Equação de Michaelis-Menten Equação de Michaelis-Menten Constante de Michaelis Quanto menor é o Km, mais forte é a interação entre a enzima e o substrato Afinidade da enzima pelo seu substrato 28/11/2018 12 Atividades Qual a concentração de substrato para que uma enzima com Km de 0,005 M opere com um quarto da velocidade máxima? Enzimas que catalisam a reação X↔Y são isoladas de 2 espécies de bactérias. As enzimas possuem a mesma Vmáx, mas diferentes valores de Km. A enzima A tem Km=2 µM e a enzima B tem Km=0,5 µM. Qual destas enzimas possui maior afinidade pelo substrato? Constante catalítica (Kcat) Numero de renovação (turnover) Constante de velocidade da etapa limitante Quanto maior o seu valor, mais rápido é a reação Comparação Kcat /Km Constante de especificidade** Comparação Kcat x Km Inibição enzimática Inibição reversível Competitiva Não-competitiva mista Inibição irreversível Inibição competitiva 28/11/2018 13 Inibição competitiva Inibição não-competitiva Inibição não-competitiva Inibição mista Tipos de enzimas Isoenzimas Catalizam a mesma reação Estruturas diferentes Físicas e de resistências a inativação Codificadas por mesmo gene Híbridas Isoenzimas associadas Dímeros Tetrâmeros 28/11/2018 14 Isoenzimas Híbridas Não se distribuem uniformemente pelos tecidos Lactato desidrogenase Subunidade H Coração Subunidade M Músculo Creatino Quinase Subunidade H Coração Subunidade M Músculo Creatino Quinase LDH LDH Seleção das enzimas Em exames, não deve ser levado em consideração somentre o resultado enzimático 28/11/2018 15 Utilidades das enzimas Reagentes analíticos Maior especificidade pelo analito Especificidade absoluta Uricase, urease, glicose oxidase... Não precisa de etapas preliminares de separação e centrifugação Análise das enzimas plasmáticas Erros na determinação enzimática Hemólise Lipêmico Plasma x Soro 28/11/2018 16 Tempo Métodos usados na prática Consumo do substrato Método que determina o produto formado Dosagem de fosfatase pelo método do p-nitrofenol Metodos que avaliam a variação da coenzima Desidrogenase Lática
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