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* Regulação de expressão gênica - procariotos Universidade Federal da Bahia Instituto Multidisciplinar em Saúde Campus Anísio Teixeira Parte 1 * Processos que afetam as concentrações celulares de uma proteína * Regulação de expressão gênica São os mecanismos que aumentam ou diminuem a expressão de um determinado gene à medida que a necessidade do seu produto varia. * Princípios da regulação da expressão gênica: Genes de Expressão Constitutiva: “genes housekeeping” Genes cuja Expressão varia em resposta a sinais moleculares: - Genes de Expressão Regulada - Indução - Repressão * Regulação gênica em Procariotos * * * * * * Operon Promotor (RNApol) Operador (prot. reg.) Genes estruturias Terminador Tradução Proteína * Princípios * Princípios Princípios * Regulação negativa e positiva * Metabolismo da lactose em E. coli * * * Óperon Lac Regulação Gênica em E.coli Óperon Lac: Região gênica responsável pela síntese de moléculas que vão metabolizar a lactose dentro de bactérias. * O Operon da lactose A proteína tiogalactosídeo-transacetilase inativa os galactosídeos tóxicos que tb são transportados para a cell. * transacetilase permease β-galactosidase * Óperon Lac * - Controle negativo do Operon Lac Expresso constitutivamente A região do operador Lac sobrepõe-se a do promotor. * Meio sem ou com pouca lactose Mínima produção das respectivas enzimas * Meio com muita lactose Controle negativo * - Controle positivo do Operon Lac O CAP monitora o efeito da glicose. Ele recruta a RNA polimerase. O CAP age sobre mais de 100 genes de E. coli atuando com diversos parceiros – ex: gene gal * * * Influência da glicose glicose cAMP Bloqueia a adenilato ciclase: ATP cAMP Controle positivo ou CAP * Sem glicose e com alta lactose cAMP Sítio CRP CAP + * Com alta glicose e com alta lactose inativo CAP * CAP = Proteína ativadora de catabolito * Óperon Trp Responsável pela síntese de moléculas que participam da biosintese do triptofano. * Estrutura do Óperon Trp * Grupamento de genes bacterianos transcritos a partir de um único promotor que codificam enzimas que sintetizam o AA triptofano. Só são expressos quando o Trp é limitante. Regulação do operon do triptofano * * * * Regulação por repressão * * Atenuação A atenuação baseia-se na estreita ligação entre a transcrição e a tradução nas bactérias, e na capacidade do RNA formar estruturas alternativas através do pareamento intramolecular de suas bases. 161 nucleotídeos – sequencia líder * O RNA do líder contém uma fase de leitura que codifica um pequeno peptídeo líder (14AA) a qual é precedido por um forte sítio de ligação ao ribossomo. * * * * * Regulação de expressão gênica - procariotos Universidade Federal da Bahia Instituto Multidisciplinar em Saúde Campus Anísio Teixeira Parte 2 * Mecanismo quorum-sensing * * * 1970s Vibrio fischeri e V. harveyi Simbiontes, habitantes dos órgãos da luz de peixe e lulas. Densidades bacterianas: 1010 – 1011 CFU/mL. A luz é emitida por bactérias que vivem nos órgãos luminosos de peixes * * A luz é produzida após a ativação da transcrição do operon lux * * * * Synthesis of HSL – a signaling molecule * Signaling molecules are diverse * * Comunicação entre bactérias Peptideos secretados Sistema de detecção baseado em cinases membranares (two component system) Comunicação intra- específica Identificada em vários Streptococci orais * 1. Podem entrar na via lítica (CASCATA LÍTICA) – produzem grandes quantidades de fago e matam a célula; 2. Entram na via lisogênica (CASCATA LISOGÊNICA), durante a qual inserem covalentemente seu cromossomo, em um estado “reprimido” ou dormente, no cromossomo do hospedeiro. Bacteriófago lambda – Regulação lisogenia ou lise * * Genes fagos lambda * Genes fagos lambda * Repressão dos genes líticos CASCATA LISOGÊNICA * * Genes cro, N e Q – envolvidos na cascata reguladora lítica * CASCATA LÍTICA Os genes λ podem ser classificados em 3 grupos: genes iniciais imediatos – genes Cro e N genes postergados – gene Q, genes replicação, recombinação e regulação genes tardios – 23 genes envolvidos na morfogênese (cauda, cabeça, lise) As proteínas: Cro – é um repressor que se liga aos sítios OL e OR com maior afinidade por OR3 Proteína N – necessária para expressar os genes postergados Proteína Q – necessária para expressar os genes tardios * CASCATA LÍTICA repressor repressor Genes iniciais * Regulação gênica em procariotos Resposta SOS Regulação por síntese de proteínas ribossomais e fator estringente Regulação por pequenos RNA Regulação por recombinação genética * Resposta SOS Dano extenso ao DNA no cromossomo bacteriano dispara a indução de muitos genes localizados a distância. Essa resposta chamada de resposta SOS. As proteínas regulatórias chave são a RecA e o repressor LexA. * * A protease RecA fornece a ligação funcional entre o sinal biológico (dano do DNA) e indução dos genes SOS, auxiliando na clivagem do LexA. Danos intensos do DNA levam a numerosos intervalos em uma das fitas do DNA, onde RecA se liga. É a bactéria utilizando a mutação como forma de defesa. * Se liga ao mRNA e bloqueia a tradução. A r-proteína só se liga ao mRNA quando não tem mais rRNA para ela se ligar. Tradução é reprimida apenas quando a síntese de r-proteína excede a quantidade para fazer os ribossomos funcionarem. Síntese de proteínas ribossomais é coordenada com a síntese de rRNA * Quanto mais ppGpp, menos síntese de rRNA * Funcionamento de mRNA regulado por pequenos RNA Uma molécula de RNA separada pode se ligar ao mRNA “em trans” e afetar sua atividade. Alternativamente, uma porção do próprio mRNA pode regular seu próprio funcionamento, ou seja, ela atua “em cis”. * * Riboswitch (em cis) Domínios enovelados de RNA que servem como receptores para metabólitos específicos. A ligação de um riboswitch de mRNA ao seu ligante resulta em uma mudança conformacional no mRNA. A transcrição é inibida pela estabilização de uma estrutura de terminação da transcrição. * * * Regulação por recombinação genética Uma recombinase inverte periodicamente um segmento de DNA, possibilitando ou não a expressão de um gene. * * * * * * * O operon Lac é uma * * * * * * * * * * * * * * * * * ➊ Quando o DNA é extensamente danificado (como pela luz UV), a replicação do DNA é suspensa e aumenta o número de intervalos de fita simples no DNA. ➋ A proteína RecA se liga a esse DNA danificado de fita simples, ativando a atividade de coprotease da proteína. ➌ Enquanto está ligada ao DNA, a proteína RecA facilita a quebra e inativação do repressor LexA. Quando o repressor é inativado, os genes SOS, inclusive recA, são induzidos; os níveis de RecA aumentam 50 a 100 vezes. A ligação de RecA nas fitas simples de DNA é a sinalização que o repressor LexA precisa para ser clivado, inativado e induzir a reposta SOS. * A síntese de rRNA responde à velocidade de crescimento celular e a alterações na disponibilidade de nutrientes cruciais, particularmente aminoácidos. Necessidade de síntese de ribossomos. Coordenação da síntese dos componentes ribossomais (rRNA e r-proteínas). Uma r-proteína funciona também como repressor de tradução. Se liga ao mRNA e bloqueia a tradução. * A ligação de um fator estringente *aminoácido por exemplo, causa a formaçãode um ppGpp (tetrafosfato de guanosina). O sinalizador ppGpp reduz a transcrição de alguns genes e aumenta aquela de outros, por se ligar RNA-polimerase e alterar a especificidade do promotor da enzima. A síntese de rRNA é reduzida quando os níveis de ppGpp aumentam. * Trans- uma molécula afeta a outra * Nova classe de antibióticos pretende atuar nesse fator. Um farmaco que se ligasse e ativasse um ligante, desligaria o gene, impediria a transcrição, * Em uma posição expressa A e B. A produz proteina que reprime C. Na outra posição não expressa nem A nem B, e portanto, C NÃO é reprimido. Facilita evasão do Sistema Imune. *
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