atidade quimica avançada

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FACULDADE MAURÍCIO DE NASSAU
CAMPUS REDENÇÃO	CURSO: FARMÁCIA
Disciplina: Química Medicinal Avançada. professor: Ciro Sá
Exercício de Fixação 
Nome: GISELE MARIA DE SOUSA 
Matrícula:20011368 
01 – As interações entre albumina sérica humana (ASH) com BENZONIDAZOL (BZL) foram estudadas por técnicas espectroscópicas (fluorescência e dicroísmo circular) sobre condições fisiológicas a 296 K, e a representação do melhor resultado de ancoramento molecular para associação ASH:BZL no subdomínio IIA é mostrado na figura e ao lado a representação dessa interação.
Explique as interações do BENZONIDAZOL (BZL) com os aminoácidos de ASH
A interação entre o GLU-449 com o BZL ocorre através de ligação de hidrogênio entre o oxigênio do do grupo ácido de GLU-449 e o hidrogênio do grupo amida do BLZ. A interação entre GLN1220 e o BLZ e o hidrogênio do grupo amida do aminoácido GLN-220. A interação entre ARG-221 e o BLZ ocorre através de ligação de hidrogênio entre o oxigênio da função nitro BZL e o hidrogênio no nitrogênio do aminoácido ARG-221.
2 – Explique como o uso de programas computacionais para os estudos na Química Medicinal podem ser para determinarmos a forma de interação micromolécula-macromolécula, o estudo de docking molecular, para a previsão de propriedades farmacocinéticas e formas de interação proteína-proteína.
Pode ser usada a estratégia baseada no ligante que é o LBDD e podemos usar estratégia baseada no receptor que é LBDD. SBDD é o o que investiga as interações intermolares e macromolates, para a previsão de propriedades farmacocinetocas são utilizados programas computacionais que podem avaliar a lipofelicidade das moléculas então a gente coloca a molécula no programa computacional e pede para que programas de computadores façam a previsão lord p. Também formas de interação do que realizadas em proteína, então conseguem ver a reação de uma proteína para outra.
3 - A Regra de 5 de Lipinski refere-se as propriedades “DRUG-LIKE” ou fármaco-similares, que compostos candidatos à fármacos devem obedecer para se adequarem nas características que a maioria dos fármacos do mercado apresentam. Explique qual a finalidade do uso dessa regra.
O uso dessa regra ocorre principalmente devido a importância de limitarmos a quantidade de moléculas que vamos estudar e vamos usar essa regra para retirar aquelas moléculas que tem maior chance de dar errado. Uma molécula que é muito lipossolúvel ela tem muita dificuldade em solubilidade em água, geralmente o que procuramos é moléculas que se dissolvam no meio aquoso, para que quando a gente tome o medicamento ela se absorva mais rápido. Então vamos retirando do estudo as moléculas que fogem das características gerais do fármaco.
4 – Quais os diferentes métodos de planejamento são mostrados na seguinte figura:
LIBRAY OF SMALL molecular, biblioteca de moléculas pequenas, uma biblioteca de compostos e encima LANG PROTEIN , que é a proteína algo, ele que mostra que tem no estudo compostos de proteína para a esquerda, VIRTUAL SCREEM Creem realiza o processo de DOCKIN ou seja amporamento e encontra os HITS as moléculas com alto scrorem (altas pontuações) realizadas nesse teste elas são consideradas HITS- THROUGHPUT SCREEN ele mostra que tem um robô, ele faz testes em
Larga escala das substâncias que estão sendo estudadas, essas moléculas que apresentam ação IN VITRO também são considerados HITS. Os métodos utilizados são: o método completacional por docken ou amporamento molecular que testa através de programas de computador a interação entre as moléculas e a proteína alvo encontra moléculas com potencial farmacológico, ou os HITS que faz testes IN VITRO em larga escala
5 – Explique a diferença entre os estudos computacionais conhecidos como Mecânica Molecular e Dinâmica Molecular no estudo de interações entre substâncias.
A principal diferença entre modelagem molecular a dinâmica molecular é a flexibilidade, mecânica molecular a gente usa o DOCKEN RÍGIDO ou seja não tem mobilidade entre os átomos da proteína e da molécula estudada. A mecânica molecular usa as moléculas rígidas e possuem menor complexidade de estudo na dinâmica molecular a gente realiza a flexibilidade das moléculas tanto na micromolécula quanto na macromolécula e possuem maior complexidade de cálculo em relação a mecânica molecular, mas representa valores mais próximos do que o real.
6 – Estudos de desenvolvimentos de fármacos baseados no ligante (LDDB) usam os dados farmacocinéticos e farmacodinâmicos de compostos bioativos como base de estudos computacionais. Explique o que são os métodos de Análise Comparativa do Campo Molecular (CoMFA) e os estudos de Relação Estrutura Atividade Quantitativo (QSAR).
O estudo CONFRA a gente utiliza Campos moleculares que vão descrever o padrão de interação das moléculas com o bio receptores dos átomos, do que os átomos individualmente, usando o caráter isterico e da carga formal dos compostos. Já o estudo de QSAR, utilizamos o padrão de interação entre compostos semelhantes comparando apenas as diferenças entre esses compostos. Que vão dar a importância de cada grupo naquela molécula
NH
O
N
N
N
O
O
HOO
N
N
N
H
H
H
H
H
N
O
H
H
Gln-220
Arg-221
Glu-449
3,79
1,59
2,13