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ELISA DIAGNÓSTICO LABORATORIAL DAS VIROSES Immunoblotting Western Blotting (WB) Blotting significa transferência de DNA. Separação das proteínas virais usando o método de eletroforese em gel de poliacrilamida. ELETROFORESE EM GEL DE POLIACRILAMIDA - ROTAVÍRUS Detecção do Ácido Nucléico Viral Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) Reação de Hibridização in situ TÉCNICAS DE BIOLOGIA MOLECULAR Para o estudo de vírus que não podem ser isolados em cultura de células, como os papilomavírus e alguns agentes associados a gastrenterites, Para vírus com alta diversidade antigênica, como os enterovírus, o que dificulta a utilização de técnicas sorológicas de detecção de antígeno, A análise do genoma viral diretamente da amostra clínica pode ser vantajosa principalmente para aqueles vírus com genoma RNA, que podem sofrem mutações através de sucessivas passagens in vitro. QUANDO A DETECÇÃO DO GENOMA VIRAL É PARTICULAMENTE IMPORTANTE: PRINCÍPIO Todo ser vivo tem seqüências de ácido nucléico que são específicas e podem ser detectadas por uma reação de hibridização ou de amplificação Técnicas de Biologia Molecular: DNA RNA As fitas da molécula de DNA (dupla hélice) podem ser separadas. Esse processo é denominado desnaturação. A renaturação ocorre quando se volta às condições físico químicas iniciais. Uso de sondas marcadas para detecção de genoma em tecido com alterações patológicas (material de arquivo) SONDA: fragmento de DNA marcado com substância reveladora (radioisótopo, enzima...) Triagem X Tipagem Sensibilidade: 100 cópias DNA/célula Relevância clínica HIBRIDIZAÇÃO IN SITU Sonda REAÇÃO DE HIBRIDIZAÇÃO IN SITU Uso de sondas marcadas para detecção de genoma em membrana de nitrocelulose. Amostra clínica: soro, fezes, tecido Triagem Sensibilidade: 10-50 cópias DNA/célula Pode ocorrer falso-positivos Dot blot Dot Blot Sonda marcada com P32 1 2 3 4 5 6 7 8 9 A B C D E F G H Sonda marcada com biotina DOT BLOT REAÇÃO EM CADEIA PELA POLIMERASE : PCR • Método para produzir cópias de uma segmento de DNA específico • Polimerização de DNA em Cadeia • Polimerização é feita por uma DNA polimerase termoestável • São utilizados dois “primers”, o que delimitam o segmento amplificado e determinam o crescimento exponencial do número de moléculas de DNA • Sensibilidade : 10 cópias de genoma • Primers genéricos x primers específicos PCR AMPLIFICA UMA SEQÜÊNCIA ALVO ALTERNÂNCIA DE TEMPERATURAS A CADA CICLO: DESNATURAÇÃO ANELAMENTO POLIMERIZAÇÃO Replicação “in vitro” do DNASeqüência AlvoDNADNA SupercoiledCromossomo Extensão Seqüência alvo DNAPolymerase 5’ 5’ Anelamento dos primers 55-64°C Denaturaçãopelo calor 95°C REAÇÃO EM CADEIA PELA POLIMERASE : PCR Qualquer seqüência alvo de DNA pode ser amplificada por PCR A localização da seqüência alvo é feita pelos “primers”. Oligonucleotídeos com 20 -24 bases são usualmente seletivos o suficiente para localizar um sítio único em um genoma de alta complexidade, tal como o genoma humano. O pareamento dos “primers” com a seqüência alvo se faz pelo estabelecimento de pontes de hidrogênio, segundo o pareamento convencional descrito por Watsone Crick: A =T C =G VISUALIZAÇÃO DO PRODUTO DA PCR Cuba de eletroforese Produtos da reação de PCR em um gel de agarose Herpesvírus Nested PCR 150pb 150pb NESTED PCR PODE SER UMA ALTERNATIVA PARA MELHORAR A ESPECIFICIDADE E A SENSIBILIDADE DA PCR 427bp MW 1 2 3 4 MW 5 6 7 8 Primers externos Primers internos 681 pb PADRÃO DE RESTRIÇÃO: Sítios de reconhecimento para ENZIMAS DE RESTRIÇÃO são curtas sequências de nucletídeos reconhecidas e clivadas por várias endonucleases EIA - DNA ENSAIO DE CAPTURA DE HÍBRIDO Detecção e tipagem de HPV SEQUENCIAMENTO DE DNA Citosina Dideoxicitosina Detecção de IgM específica Conversão sorológica: soro de fase aguda soro de fase de convalescência Diagnóstico de infecção recente: MÉTODOS INDIRETOS: DETECÇÃO DE AC NO SORO Reações Imunológicas Imunofluorescência (IF) Ensaio Imunoenzimático (EIE) Radioimunoensaio (RIE) Western Blot MÉTODOS INDIRETOS: DETECÇÃO DE AC NO SORO
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