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Profa. Dra. Marilia Patrão UNIDADE II Biomedicina Integrada A disciplina aborda técnicas laboratoriais inovadoras e atuais utilizadas na pesquisa científica, no diagnóstico e no tratamento de doenças. O objetivo da disciplina é formar profissionais atualizados quanto às novas tecnologias utilizadas nas ciências da saúde. Objetivos da disciplina Revisar as novas técnicas laboratoriais utilizadas no campo da Biologia Molecular, da Microbiologia, da Imunologia, da Farmacologia e da Hematologia; Promover a avaliação crítica das vantagens e desvantagens de cada técnica; Promover revisão e aprofundamento de conteúdos trabalhados durante o curso de Biomedicina; Incentivar a atualização contínua acerca dos principais temas de relevância na atualidade. Unidade I Maldi-Tof-MS Novas tecnologias em Hematologia e Hemoterapia Microarranjos de DNA (Microarrays) O sistema Crispr-Cas9 Unidade II Ciências ômicas: Exoma e Metaboloma Microbioma Nanobiotecnologia Imunoterapia contra o câncer Conteúdo programático Unidade II Ciências Ômicas: Exoma e Metaboloma Microbioma Nanobiotecnologia Imunoterapia contra o câncer Conteúdo programático Ciências ômicas: identificação e quantificação do conjunto de moléculas biológicas (DNA, RNA, proteínas ou produtos do metabolismo) de um organismo. Ciências Ômicas: Exoma e Metaboloma Fonte: adaptado de: https://commons.wikimedia.org/wik i/File:Omics-en.svg Genômica Transcriptômica Exômica Proteômica Metabolômica DNA RNA Proteínas Bioquímica Fenótipo Conjunto completo dos éxons que integram o genoma de um indivíduo, determinado a partir do sequenciamento de seus nucleotídeos. Éxons: regiões codificadoras dos genes. Exoma Fonte: adaptado de: https://www.britannica.com/s cience/gene RNA mRNA splicing tradução modificações pós-traducionais transcrição cadeia de aminoácidos proteína promotor gene (DNA) exon intron exon intron intron exon exon Cariótipo: identifica alterações cromossômicas extensas; Microarranjos de DNA: identifica inserções e deleções de pequenos trechos de DNA; Exoma: identifica mutações de um único nucleotídeo. Exoma Fonte: adaptado de: https://commons.wikimedia.org/ wiki/File:DNA_sequence.svg G A T A A A T C T G GT C T T A T T T C C 120 130 Doenças multigênicas diagnóstico; Câncer aspectos moleculares envolvidos na patogênese e na resposta a fármacos; Casais consanguíneos investigação de risco genético; Identificação de doenças genéticas cuja hipótese diagnóstica não está clara; Identificação de doenças cujos resultados de outros exames foram inconclusivos. Exoma: principais aplicações Fonte: adaptado de: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:E xomePeak_peak_calling.tiff ip_1.tdf ip_2.tdf ip_3.tdf ip_4.tdf input_1.tdf input_2.tdf input_3.tdf macs2_peak.bed peak.bed RefSeq Genes KLHL21 [0 – 10.00] [0 – 10.00] [0 – 10.00] [0 – 10.00] [0 – 10.00] [0 – 10.00] [0 – 10.00] Não determina se os éxons alterados por mutações serão ou não incorporados ao mRNA pelo mecanismo de splicing alternativo. Para isso, realizar transcriptoma. Exoma: principais limitações Fonte: autoria própria. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Transcritos Gene 1 2 3 4 5 6 7 Conjunto de todas as pequenas moléculas, oriundas do metabolismo, presentes em um organismo. Metabolômica permite a determinação do perfil metabólico do indivíduo. Metaboloma Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.3390/jof5010004 enzima + substrato complexo enzima-substrato Energia necessária para que a conversão do substrato em produto ocorra na ausência da enzima Energia necessária para que a conversão do substrato em produto ocorra na presença da enzima enzima + produto E n e rg ia Tempo Metaboloma: métodos de estudo Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.21577/0100-4042.20170134 Metabolômica alvo moléculas alvo de uma via metabólica em particular; Metabolômica global perfil total dos metabólitos. METABOLÔMICA ALVO (TARGETTED METABOLOMICS) METABOLÔMICA GLOBAL (UNTARGETED METABOLOMICS) Seleção de metabólicos Coleta e preparo de amostra Análise instrumental Processamento dos dados Análise estatística Interpretação biológica Coleta e preparo de amostra Análise instrumental Processamento dos dados Análise estatística Identificação dos metabólitos Interpretação biológica Análises ambientais: resposta dos organismos (plantas e animais) a poluentes; Análises clínicas: metaboloma de diferentes tipos de câncer e biomarcadores de doenças; Fisiologia do esporte: metabolismo durante o exercício físico e alterações metabólicas decorrentes do doping; Nutrição: relação entre dieta, estilo de vida e metabolismo; Microbiologia e parasitologia: metabolismo de bactérias, fungos, protozoários e helmintos; Toxicologia: uso de drogas e mecanismos de dependência. Metaboloma: principais aplicações As ciências ômicas permitem a avaliação integrada do funcionamento do organismo. Elas englobam o genoma, o exoma, o transcriptoma, o proteoma e o metaboloma. Com relação ao exoma, assinale a alternativa correta. a) Refere-se ao sequenciamento de todo o DNA presente no núcleo das células. b) Determina a presença de mutações exclusivamente nas regiões codificadoras dos genes. c) Possibilita a avaliação do conjunto de mRNAs presentes em um organismo. d) É realizado a partir das técnicas de cromatografia e de espectrometria de massas. e) Identifica os produtos das reações enzimáticas que acontecem no nosso organismo. Interatividade As ciências ômicas permitem a avaliação integrada do funcionamento do organismo. Elas englobam o genoma, o exoma, o transcriptoma, o proteoma e o metaboloma. Com relação ao exoma, assinale a alternativa correta. a) Refere-se ao sequenciamento de todo o DNA presente no núcleo das células. b) Determina a presença de mutações exclusivamente nas regiões codificadoras dos genes. c) Possibilita a avaliação do conjunto de mRNAs presentes em um organismo. d) É realizado a partir das técnicas de cromatografia e de espectrometria de massas. e) Identifica os produtos das reações enzimáticas que acontecem no nosso organismo. Resposta Unidade II Ciências ômicas: Exoma e Metaboloma Microbioma Nanobiotecnologia Imunoterapia contra o câncer Conteúdo programático Conjunto de todos os genes presentes em determinada microbiota. Microbiota humana: bactérias (principais), fungos, árqueas, vírus e protozoários. Eubiose: microbiota em equilíbrio com o hospedeiro; Disbiose: desequilíbrio. Microbioma Fonte: https://doi.org/10.7875/togopic.2020.154, CC BY 4.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=89430513 Mais estudada: microbiota intestinal Proteção contra microrganismos patogênicos; Maturação do sistema imunológico (tolerância imunológica e tecido linfoide associado ao intestino); Fortalecimento das mucosas intestinais (estímulo da produção de muco protetor e de moléculas antibacterianas); Metabolismo dos nutrientes que não podem ser digeridos (fibras alimentares); Produção de moléculas importantes para a saúde (ácidos graxos de cadeia curta); Participação no eixo microbiota-intestino-cérebro; Produção de vitaminas (B e K); Participação no metabolismo de primeira passagem. Principais funções da microbiota intestinal Filos Proteobacterias, Actinobacterias, Bacteroidetes e Firmicutes. Bacteroidetes predominam no intestino de vegetarianos e veganos. Combustível energético: glicanas e oligossacarídeos presentes em frutas e legumes; Produção de ácidos graxos de cadeia curta (acetato, propionato, butirato etc.). Firmicutes predominam no intestino de consumidores de gorduras de animais. Ácidos biliares diminuem população de bacteroidetes; Microbiota de carnívoros: menos diversa. Principais bactériaspresentes na microbiota humana Bacteroidetes também costumam predominar no intestino de indivíduos magros. Fonte: http://www.fiocruz.br/ Modulação do sistema imunológico; Inibição da proliferação de bactérias patogênicas (acetato e lactato); Secreção de muco pelos enterócitos (butirato); Síntese das proteínas que participam das junções estreitas ou tight junctions (butirato); Redução do estresse oxidativo (butirato); Diminuição do pH do intestino; Aceleração do peristaltismo. Ácidos graxos de cadeia curta: funções Fonte: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Butyrate.svg Alterações na microbiota intestinal podem estar relacionadas ao desenvolvimento de: Doenças intestinais; Alergias; Diabetes tipo II; Câncer; Transtornos do sistema nervoso central. A disbiose e o desenvolvimento de doenças Fonte: https://www.activepharmaceutica.com.br/blog/conheca-a-relacao-entre- microbiota-intestinal-envelhecimento-e-suplementacao-com-probioticos Eixo intestino-cérebro Fonte: https://www.thieme- connect.com/products/ejournals/pdf/ 10.1055/s-0040-1705652.pdf Estratégias para a correção da microbiota Fonte: https://taubate.sp.gov.br/noticias/prebioti cos-reforcam-imunidade-do-intestino/ Fonte: https://commons.wikimedia.org/wi ki/File:Kefir-grains-90grams.jpg Fonte: http://genewei.com/br/produt o/butirato-600-mg-250-caps/ Prebióticos Probióticos Posbióticos Estratégias para a correção da microbiota Transplante de material fecal Fonte: adaptado de: https://www.microbiologia.ufrj.br/portal/index.php/pt/destaques/novidades- sobre-a-micro/299-transplante-fecal-restaurando-nosso-ecossistema-interno Uma saúde em simbiose. O trato digestivo humano é um complexo ecossistema formado por bilhões de bactérias que auxiliam na digestão. Morte indiscriminada. Antibióticos matam bactérias capazes de causar infecção e a microbiota ‘nativa’. Os esporos do C. difficile resistem e assumem o cólon, causando danos e diarreia Uma nova população se estabiliza no cólon e recoloniza o cólon. Transplante fecal. Introdução da comunidade bacteriana de um doador restaura o balanço do ecossistema Uma nova população se estabiliza no cólon e recoloniza o cólon. Tubo nasogástrico Antibiótico 1 2 3 4 5 Sistema em colapso Métodos de estudo do microbioma humano Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.1177/0706743719874168 Metagenoma Metatranscriptoma Metaproteoma Metaboloma Amostra de fezes Extração do DNA/RNA Sequenciamento do DNA genômico Interpretação dos resultados Identificação das espécies de bactérias e análises funcionais Análise do rRNA 16S Interpretação dos resultados Identificação das espécies de bactérias A microbiota intestinal pode modular o funcionamento de todo o organismo por diferentes mecanismos, que incluem a produção de ácidos graxos de cadeia curta, como o butirato, o propionato e o acetato, por exemplo. São ações mediadas pelos ácidos graxos de cadeia curta, exceto: a) A modulação do sistema imunológico. b) A inibição da proliferação de bactérias patogênicas. c) A redução do estresse oxidativo celular. d) O aumento do pH do intestino. e) A aceleração do peristaltismo. Interatividade A microbiota intestinal pode modular o funcionamento de todo o organismo por diferentes mecanismos, que incluem a produção de ácidos graxos de cadeia curta, como o butirato, o propionato e o acetato, por exemplo. São ações mediadas pelos ácidos graxos de cadeia curta, exceto: a) A modulação do sistema imunológico. b) A inibição da proliferação de bactérias patogênicas. c) A redução do estresse oxidativo celular. d) O aumento do pH do intestino. e) A aceleração do peristaltismo. Resposta Unidade II Ciências ômicas: Exoma e Metaboloma Microbioma Nanobiotecnologia Imunoterapia contra o câncer Conteúdo programático Nanobiotecnologia Nanomateriais dimensões na ordem do nanômetro (geralmente entre 1 e 100 nm). Diversos usos na área da saúde e do meio ambiente. Nanoenzimas; Nanofármacos; Pesticidas encapsulados em nanopartículas; Filtros nanoestruturados; Sensores nanométricos; Nanobolhas; Nanocosméticos. Processos de produção de nanomateriais Fonte: https://doi.org/10.21577/1984- 6835.20200010 Tipos de nanomateriais Fonte: https://doi.org/10.1590/S0100-40422007000600016 Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.3390/bios9020078 Nanopartículas de prata Nanotubos de carbono (a) (b) (A) (B) 20 nm (C) (D) (H)(G)(F)(E) 100 nm 100 nm 500 nm 200 nm100 nm100 nm50 nm Tipos de nanomateriais Fonte: adaptado de: https://revistafitos.far.fiocruz.br/index.php/revista- fitos/article/view/1060/748 Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.1590/S0100- 40422004000500020 Nanoemulsões Nanocompósitos Fase aquosa dispersa (primária) óleo Fase aquosa dispersante (secundária) I II III Nanopartículas Polímero PI (Precursores Inorgânicos) + + + (Monómeros) M Nanocompósito Filtros solares com nanopartículas (óxido de zinco, hera); Cremes que contêm proteínas encapsuladas em lipossomos (fundem-se à membrana das células da pele); Loções que contêm nutrientes encapsulados em nanopartículas suspensas em uma nanoemulsão; Loções com etossomas (carreiam nutrientes que promovem o crescimento capilar). Nanocosmetologia Fonte: adaptado de: http://www.petquimica.ufc.br/a-importancia-da- nanotecnologia-na-industria-de-produtos-cosmeticos/ Cosmético convencional Cosmético com nanotecnologia Epiderme Derme Nanofármacos Sistemas terapêuticos nanoestruturados que visam a aumentar o alcance terapêutico e a eficácia dos princípios ativos contra diferentes patologias direcionamento celular e liberação controlada. Aumento da biodisponibilidade; Maior tempo de meia-vida plasmática; Redução das doses e/ou aumento do intervalo entre doses; Redução dos efeitos adversos. Fonte: https://www.researchgate.net/figure/Figura-1-Caracteristicas- estruturais-dos-alguns-tipos-de-lipossomas-convencionais_fig1_343280085 Estudo dos efeitos tóxicos das nanopartículas sobre a saúde humana e sobre o meio ambiente. Materiais em escala nanométrica atingem mais facilmente os pulmões. Efeitos sobre o meio ambiente? Exemplo: nanopartículas de prata. Nanotoxicologia Animais: alergias, morte de hepatócitos, morte de neurônios. Meio ambiente: inibição da germinação das sementes e do crescimento das plantas e bioacumulação ao longo da cadeia alimentar. Ocupacional: absorção pela pele e por via oral (alteração da microbiota). Os nanofármacos são sistemas terapêuticos nanoestruturados que visam a aumentar o alcance terapêutico e a eficácia dos princípios ativos contra diferentes patologias. Com relação às características dos nanofármacos, assinale a alternativa correta. a) Devido às suas dimensões reduzidas, observa-se aumento da biodisponibilidade quando comparados aos fármacos tradicionais. b) Apresentam menor tempo de meia-vida plasmática, o que é vantajoso do ponto de vista terapêutico. c) O tamanho reduzido dos sistemas nanoestruturados resulta na necessidade de se diminuir o intervalo entre as doses. d) Embora sejam mais eficazes, observa-se, com frequência, aumento significativo dos efeitos adversos. e) Não permitem a liberação controlada do princípio ativo. Interatividade Os nanofármacos são sistemas terapêuticos nanoestruturados que visam a aumentar o alcance terapêutico e a eficácia dos princípios ativos contra diferentes patologias. Com relação às características dos nanofármacos, assinale a alternativa correta. a) Devido às suas dimensões reduzidas, observa-se aumento da biodisponibilidade quando comparados aos fármacos tradicionais. b) Apresentam menor tempo de meia-vida plasmática, o que é vantajoso do ponto de vista terapêutico. c) O tamanho reduzido dos sistemas nanoestruturados resulta na necessidadede se diminuir o intervalo entre as doses. d) Embora sejam mais eficazes, observa-se, com frequência, aumento significativo dos efeitos adversos. e) Não permitem a liberação controlada do princípio ativo. Resposta Unidade II Ciências ômicas: Exoma e Metaboloma Microbioma Nanobiotecnologia Imunoterapia contra o câncer Conteúdo programático Medicamentos capazes de modular o sistema imunológico para que ele combata diferentes tipos de neoplasias. Alternativa à quimioterapia tradicional. Tumores são combatidos com maior facilidade e com menos efeitos adversos. Imunoterapia contra o câncer Fonte: https://imeb.com.br/imunoterapia-contra-o-cancer-uma- nova-fronteira-mas-de-custo-alto/ Principais células envolvidas: Natural Killer (imunidade inata) e linfócitos T CD8+ (imunidade adaptativa). Ação de perforinas e granzimas. Apresentação de antígenos via MCH I Evasão tumoral anergia. Resposta imune contra tumores Fonte: adaptado de: https://rbc.inca.gov.br/site/arquivos/n_54/v01/pdf/revisao_4_pag_63a78.pdf Linfócito T citotóxico CD8+ Célula NK (Natural Killer) CD8 Receptor de célula T MHC I + peptídeos Receptor KIR Receptor NKG2D Sem expressão de MHC I Proteínas induzidas por estresse Célula-alvo da resposta inataCélula-alvo da resposta adaptativa Atuação nos pontos de checagem (checkpoints) Células tumorais podem expressar CTLA-4 e/ou PD-1. Resposta imune contra tumores Fonte: adaptado de: https://doi.org/10.1016/j.it.2014.12.001. CD28 CTLA-4 TCR CTLA-4 CD28 Tconv CD86 MHC CD80 APC Terapias baseadas em anticorpos: Reconhecem receptores presentes nas células imunológicas impedem sua interação com inibidores, o que resulta na destruição dos tumores. Marcam os antígenos presentes nas células neoplásicas, para que os processos de divisão, crescimento e espalhamento do tumor sejam interrompidos. Principais fármacos usados na imunoterapia contra o câncer Rituximabe. Brentuximabe. Herceptin. Anticorpos anti-CD137. Anticorpos que inibem os pontos de checagem (PD-1 e CTLA-4). Citocinas: Pequenas proteínas naturalmente produzidas e secretadas por diversas células do sistema imunológico. Função: promover a comunicação entre diferentes células durante o estabelecimento da resposta imune. Principais fármacos usados na imunoterapia contra o câncer Interferon-alfa (IFN-α) aumenta a resposta imune contra os tumores (alguns tipos de leucemias e linfomas, câncer de rim, melanomas e sarcoma de Kaposi). Interleucina-2 (IL-2) promove a expansão clonal de todas as linhagens de linfócitos T (câncer de rim e do melanoma metastáticos). IL-7, IL-12 e IL-21 em fase de estudos. Vacinas contra o câncer: Vacinas contra o HPV e a hepatite B impedem a infecção por vírus potencialmente neoplásicos. Provenge (Sipuleucel-T) aumenta a sobrevida dos pacientes com tumores de próstata que não respondem mais ao tratamento convencional. Principais fármacos usados na imunoterapia contra o câncer Isolamento dos leucócitos do paciente. Transformação in vitro em células dendríticas. Exposição das células são expostas à fosfatase ácida prostática estabelecimento de resposta imune específica. Terapia com células CAR-T: Contorna a necessidade do reconhecimento do complexo MHC I. Reengenharia de linfócitos T CD8+ do paciente. Principais fármacos usados na imunoterapia contra o câncer Fonte: adaptado de: https://www.cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms/def/car-t-cell- therapy Obtenção das células T do paciente Células CAR-T se ligam às células cancerosas, matando-as Infusão das células CAR-T no paciente Crescimento das células CAR-T Terapia com células CAR-T Inserção do CAR nas células T do paciente em laboratório Célula CAR-T Antígenos Receptor de antígeno quimérico (CAR) Vírus oncolíticos: Partículas virais capazes de penetrar nas células tumorais e provocar sua lise. T-VEC vírus herpes simplex 1 geneticamente modificado para expressar GM-CSF (granulocyte-macrophage colony-stimulating factor), uma citocina que promove a quimioatração de células do sistema imunológico. Pexa-Vec (contra o carcinoma hepatocelular), o CG0070 (contra o câncer de bexiga) e G47Δ (contra o glioblastoma e o câncer prostático). Desvantagem: desencadeiam respostas imunes antivirais e, portanto, não podem ser utilizados a longo prazo, depois da sensibilização do sistema imunológico. Principais fármacos usados na imunoterapia contra o câncer A imunoterapia contra o câncer reúne uma série de estratégias para modular o sistema imune, de modo a direcioná-lo ao combate às células neoplásicas. São estratégias da imunoterapia contra o câncer, exceto: a) O estímulo da ligação do CTLA-4 de tumores aos linfócitos T. b) O estímulo para a expansão clonal dos linfócitos T mediado pela IL-2. c) O uso de vírus que promovem a lise das células tumorais. d) As células CAR-T, criadas a partir da reengenharia dos linfócitos T CD8+ do paciente. e) As vacinas contra o câncer. Interatividade A imunoterapia contra o câncer reúne uma série de estratégias para modular o sistema imune, de modo a direcioná-lo ao combate às células neoplásicas. São estratégias da imunoterapia contra o câncer, exceto: a) O estímulo da ligação do CTLA-4 de tumores aos linfócitos T. b) O estímulo para a expansão clonal dos linfócitos T mediado pela IL-2. c) O uso de vírus que promovem a lise das células tumorais. d) As células CAR-T, criadas a partir da reengenharia dos linfócitos T CD8+ do paciente. e) As vacinas contra o câncer. Resposta ATÉ A PRÓXIMA!