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Aminoácidos, Peptídios e Proteínas Prof. Pedro Henrique Ferreira Marçal Aminoácidos, Peptídios e Proteínas ¡ As proteínas são as macromoléculas biológicas mais abundantes que ocorrem em todas as células e em todas as partes das células; ¡ Exibem milhares de funções biológicas, sendo os instrumentos moleculares por meio dos quais a informação genética é expressa; ¡ As células podem produzir proteínas com propriedades e atividades diferentes, simplesmente unindos os mesmos 20 aminoácidos em muitas combinações e sequências diferentes. Aminoácidos, Peptídios e Proteínas ¡ A partir desses blocos de construção, os diferentes organismos podem fazer tal diversidade de produtos como enzimas, hormônios, anticorpos, transportadores, fibras musculares, proteínas do cristalino do olho, penas, teia de aranha, chifre do rinoceronte, proteínas do leite, antibióticos, venenos de cogumelos, dentre outras. Aminoácidos ¡ As proteínas são polímeros de aminoácidos, com cada resíduo de aminoácido unido ao seu vizinho por um tipo específico de ligação covalente. (o termo resíduo reflete a perda dos elementos da água quando um aminoácido é unido a um outro); ¡ Proteínas podem ser degradadas (hidrolisadas) aos seus aminoácidos constituintes por uma variedade de métodos; Aminoácidos – características estruturas comuns ¡ Todos os 20 aminoácidos comuns são α-aminoácidos. Eles possuem um grupo carboxila e um grupo amino ligados ao mesmo átomo de carbono (carnobo α); ¡ Diferem um dos outros nas suas cadeias laterais, ou grupos R, que variam em estrutura, tamanho e carga elétrica e que influenciam a solubilidade dos aminoácidos em água. A o s a m in o á c id o s c o m un s d a s p ro te ín a s fo ra m a tr ib uí d a s a b re vi a ç õ e s c o m un s d e t rê s le tr a s e sí m b o lo s d e u m a le tr a . Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Os aminoácidos são são agrupados em cinco classes principais baseadas nas propriedades dos seus grupos R, em particular sua polaridade ou tendência de interagir com a água em pH biológico (próximo de pH 7,0); ¡ A polaridade dos grupos R varia grandemente, desde os não- polares e hidrofóbicos (insolúveis em água) até os altamente polares e hidrofílicos (solúveis em água); ¡ Dentro de cada grupo há gradações de polaridade, tamanho e da forma dos grupos R. Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Grupos R alifáticos, não-polares: Os grupos R nessa classe de aminoácidos são não-polares e hidrofóbicos. As cadeias laterais da alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar dentro das proteínas, estabilizando a estrutura protéica por meio de interações hidrofóbicas. ¡ A glicina possui estrutura mais simples. Embora seja formalmente não-polar, sua cadeia lateral muito pequena não apresenta contribuição real para as interações hidrofóbicas; ¡ A metionina, uma dos aminoácidos contendo enxofre, possui um grupo tioéter na sua cadeia lateral. A prolina possui uma cadeia lateral al i fát ica com estrutura cícl ica diferente; Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Grupo R aromático: Fenilalanina, tirosina e triptofano, com suas cadeias laterais, são relativamente não-polares (hidrofóbicos). Todos podem participar nas interações hidrofóbicas. O grupo hidroxila da tiroxina pode formar ligações de hidrogênio, e ele é um grupo funcional importante de algumas enzimas. ¡ A tirosina e o tr ipotofano são significativamente mais polares que a fenilalanina, por causa do grupo hidroxila da tirosina e do nitrogênio do anel indólico do triptofano; Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Grupo R não-carregado, polares: Os grupos R desses aminoácidos são mais solúveis em água, ou mais hidrofílicos, que aqueles aminoácidos não- polares, porque eles contêm grupos funcionais que formam lig. de hidrogênio com a água; ¡ Serina, treonina, cisteína, asparagina e glutamina. A polaridade da serina e treonina é oferecida por seus grupos hidroxilas; a da cisteína, pelo seu grupo sulfidrila; e as da asparagina e glutamina, pelos seus grupos amidas. Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Asparagina e Glutamina são as amidas de dois outros aminoácidos também encontrados nas proteínas, aspartato e glutamato, respectivamente, para os quais a asparagina e a glutamina são facilmente hidrolisadas por ácido ou base; ¡ A cisteína é facilmente oxidada para formar um aminoácido dimérico unido de maneira covalente, chamado cistina, onde duas moléculas ou resíduos de cisteína são unidos por uma ponte dissfulfeto; ¡ Os resíduos unidos pelo dissulfeto são fortemente hidrofóbicos (não-polares). As pontes dissulfeto desempenham papel especial nas estruturas de muitas proteínas formando elos covalentes entre partes de uma molécula de proteína ou entre duas cadeias polipeptídicas diferentes. Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Grupo R positivamente carregados (básico): Os grupos R mais hidrofílicos são os positiva ou negativamente carregados. Os aminoácidos nos quais os grupos R possuem carga positiva significante em pH 7,0 são a lisina, que possui um segundo grupo amino primário na posição εda sua cadeia alifática; ¡ A arginina, que possui um grupo guanidino carregado positivamente; ¡ A histidina, que possui um grupo imidazol; ¡ A histidina é o único aminoácido comum que possui uma cadeia lateral ionizável com um pKa próximo da neutralidade. Em muitas reações catalisadas por enzimas, um resíduo His facilita a reação funcionando como um doador/receptor de próton. Aminoácidos – classificação pelo grupo R ¡ Grupo R negativamente carregados (acídico) os dois aminoácidos que possuem grupos R com uma carga líquida negativa em pH 7,0 são o aspartato e o glutamato, cada um possui um segundo grupo carboxila; Aminoácidos – atuação como ácidos e bases ¡ Quando um aminoácido é dissolvido na água, ele existe em solução como um íon dipolar, ou zwitterion; ¡ Um zwitterion pode atuar tanto como ácido (doador de próton): ¡ Quanto um base (receptora de próton): Peptídios e Proteínas ¡ Duas moléculas de aminoácidos podem estar de forma covalente unidas por meio de uma ligação chamada de ligação peptídica, para produzir um dipeptídio; ¡ Três aminoácido podem ser unidos por duas ligações peptídicas para formar um tripeptídio; semelhantemente, aminoácidos podem ser unidos para formar um tetrapeptídio e assim po diante; Peptídios e Proteínas ¡ Quando uns poucos aminoácidos são unidos dessa maneira, a estrutura é chama de oligopeptídio. Quando muitos aminoácidos são unidos o produto é chamado de polipeptídio; ¡ Proteínas podem ter milhares de resíduos de aminoácidos; ¡ Em um peptídio, o resíduo de aminoácido na extremidade com o grupo amino é o resíduo amino terminal (ou N-terminal); o resíduo na outra extremidade, que possui um grupo carboxila livre, é o resíduo carboxila terminal (ou C-terminal). Níveis de estrutura protéica ¡ As proteínas podem ser cadeias polipeptídicas muito longas de 100 a vários milhares de resíduos de aminoácidos. Entretanto alguns peptídios de ocorrência natural possuem apenas uns poucos resíduos de aminoácidos; ¡ Algumas proteínas são compostas de cadeias polipeptídicas únicas, mas outras são compostas de várias cadeias polipeptídicas associadas, chamadas subunidades; ¡ Proteínas simples produzem apenas aminoácidos quando hidrolisadas; proteínas conjugadas contêm em aldiçãoalgum outro componente (lipoproteínas, glicoproteínas, metaloproteínas); Níveis de estrutura protéica ¡ Quatro níveis de estrutura protéica são definidos comumente: ¡ Uma descrição de todas as ligações covalentes (principalmente ligações peptídicas e ligações dissulfeto) unindo resíduos de aminoácidos em uma cadeia polipeptídica é sua estrutura primária; ¡ O elemento mais importante da estrutura primária é a sequência de resíduos de aminoácidos; Níveis de estrutura protéica ¡ A estrutura secundária refere-se a arranjos particularmente estáveis de resíduos de aminoácidos dando origem a padrões estruturais recorrentes; ¡ A estrutura terciária descreve todos os aspectos do enovelamento tridimensional de um polipeptídeo; ¡ Quando uma proteína possui duas ou mais subunidades poliptídicas, seu arranjo no espaço é referido como estrutura quaternária. A estrutura covalente das proteínas – estrutura primária ¡ O que é que faz uma proteína uma enzima, uma outra um hormônio, outra uma proteína estrutura e ainda outra um anticorpo?Como elas diferem quimicamente? ¡ As distinções mais óbvias são estruturais, e elas podem ser abordadas em cada nível de estrutura; ¡ As diferenças na estrutura primária podem ser especialmente informativas; ¡ Cada proteína possui um número e uma sequência de resíduos de aminoácidos diferentes; ¡ A estrutura primária determina como ela se enovela em uma única estrutura tridimensional e por sua vez sua função. A estrutura covalente das proteínas – estrutura primária ¡ O que é que faz uma proteína uma enzima, uma outra um hormônio, outra uma proteína estrutura e ainda outra um anticorpo?Como elas diferem quimicamente? ¡ As distinções mais óbvias são estruturais, e elas podem ser abordadas em cada nível de estrutura; ¡ As diferenças na estrutura primária podem ser especialmente informativas; ¡ Cada proteína possui um número e uma sequência de resíduos de aminoácidos diferentes; ¡ A estrutura primária determina como ela se enovela em uma única estrutura tridimensional e por sua vez sua função.
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