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FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 1 INTRODUÇÃO Os organismos vivos são constituídos por moléculas, átomos e íons, que por si só, não possuem vida. Mas o que distingue organismos vivos de objetos? - Capacidade de se reproduzir; - Capacidade de extrair, transformar e usar energia do meio; - Alto grau de complexidade e organização de moléculas. A maioria dos constituintes dos seres vivos são compostos orgânicos, também conhecidos como biomoléculas, por serem os sistemas biológicos a principal fonte dessas moléculas. Moléculas com massa molecular menor que 500u tal como aminoácidos, nucleotídeos e monossacarídeos, servem como monômeros para macromoléculas como proteínas, ácidos nucléicos e polissacarídeos. Outras moléculas, como lipídeos, alcaloides e terpenos, servem como fonte de energia, unidades estruturais, hormônios, etc. AMINOÁCIDOS São substâncias orgânicas que possuem um grupo amina e um grupo carboxila em sua estrutura. Fórmula estrutural da glicina A principal fonte de aminoácidos naturais é a partir da hidrolise de proteínas. O número de proteínas encontradas nos reinos Vegetal e Animal, alcança facilmente a cada dos bilhões. Curiosamente essas proteínas são formadas basicamente por apenas 20 aminoácidos diferentes, chamados primários. Todos os 20 aminoácidos primários são α– aminoácidos, que quer dizer que o grupo amina está ligado ao carbono vizinho do grupo carboxila. Analisando a estrutura dos 20 α–aminoácidos primários, observa-se que em todos o carbono alfa possui um grupo carboxila, u, grupo amina e um hidrogênio, de forma que a diferença entre os 20 aminoácidos primários fica a cargo da quarta ligação, feita com um grupo R. Forma geral do alfa-aminoácido Com exceção da glicina, cujo grupo R é um hidrogênio, os demais aminoácidos primários terão no mínimo um carbono quiral, exatamente o carbono alfa da figura anterior. Importante: não confundir aminoácido primário com aminoácido essencial. Os primários são os que entram na composição das proteínas. Já os essenciais são os que o organismo humano não é capaz de sintetizar, de forma que se tornam essenciais na dieta (ver tabela de aminoácidos no final desse material). Em decorrência do caráter ácido do grupo carboxila e do caráter básico do grupo amino, quando os aminoácidos são dissolvidos em água, sofrem neutralização interna e tornam-se íons dipolares, um composto químico eletricamente neutro. Essa característica dos aminoácidos permite que sofram reação tanto com ácido como com base. Compostos com esse comportamento são ditos anfóteros. PEPTIDEOS E PROTEINAS Duas moléculas de aminoácidos podem ser conectadas covalentemente por meio da formação de uma função ainda. Essa ligação entre aminoácidos é chamada de ligação peptídica. Formação de um dipeptídeo FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 2 Três aminoácidos podem ser conectados por duas ligações peptídicas e formar um tripeptídeo. De forma similar, aminoácidos podem ser conectados e formar tetra, penta ou hexapeptídeos. Moléculas com poucos aminoácidos conectados são chamadas de oligopeptídeos e quando muitos aminoácidos são conectados, temos os polipeptídeos. Muitos oligopeptideos exercem funções relativamente potentes mesmo em baixas concentrações. Um exemplo notável é o hormônio oxitocina (nove resíduos de aminoácidos), que estimula as contrações dos músculos uterinos do parto. Fórmula estrutural e bastão do hormônio oxitocina Apesar de não existir um numero definido de aminoácidos para essa classificação, polipeptídeos maiores recebem o nome de proteínas. Existem proteínas pequenas tais como o citocromo c, formada por apenas 104 aminoácidos em uma única cadeia e proteínas de cadeias relativamente grandes, tais como a glutamina sintetase, com 5628 aminoácidos distribuídos em 12 cadeias peptídicas. Estrutura das proteínas As proteínas são macromoléculas com níveis de organização variados que dependem muitas vezes de sua função no organismo. - Estrutura primária É a sequencia de aminoácidos que compõe uma proteína. A informação da sequencia de aminoácidos que cada proteína deve possuir é exatamente a informação guardada nos ácidos nucléicos. - Estrutura secundária É a forma como os aminoácidos próximos estão organizados no espaço, gerando um padrão de disposição. As duas principais estruturas secundárias são alfa-hélice e folha-beta, representadas a seguir: Folha beta e alfa-hélice A principal diferença entre elas é o arranjo tridimensional de suas ligações de hidrogênio. Na folha-beta a cadeia polipeptídica está “esticada” e possibilita a formarão de ligações de hidrogênio entre cadeias lateralmente. Na estrutura alfa-hélice, a cadeia peptídica se enrola na forma de uma mola, que é mantida por ligações de hidrogênio intramoleculares entre os hidrogênios ligados ao nitrogênio das amidas ou ao oxigênio da carbonila do quarto aminoácido na sequencia. Os cabelos são longos filamentos constituídos por várias moléculas da porteína queratina que, por sua vez, apresentam estrutura secundária tipo α–hélice. - Estrutura terciária: é o formato tridimensional que uma cadeia polipeptídica adquire após ser dobrada e enrolada sobre si mesma. A estrutura terciária das proteínas é mantida por um conjunto de 4 forças de interações principais: • Pontes de dissulfetos: cisteínas relativamente distantes na sequencia de aminoácidos podem, por uma reação de oxidação conectar os enxofres formando uma ponte dissulfeto. Essa é a mais forte das interações e, além de promover curvas FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 3 na cadeia polimérica, aumenta a estabilidade da estrutura terciária. • Interações iônicas: alguns aminoácidos possuem grupo carboxila ou grupo amina na cadeia lateral. Esses grupos sofrem ionização no pH intracelular, de forma que os grupos R adquirem cargas negativa ou positiva. Grupos R de aminoácidos distantes com cargas elétricas opostas se atraem e promovem curvas na cadeia polipeptídica para se aproximarem. • Ligações de hidrogênio: além das ligações de hidrogênio que podem ocorrer nas estruturas alfa-hélice e na folha-beta, existe a possibilidade de grupos R contendo grupos –OH ou NH2 formarem ligações de hidrogênio com grupos R de aminoácidos distantes. • Interações hidrofóbicas: vários aminoácidos possuem grupo R hidrofóbico. Proteínas globulares solúveis em água “escondem” os grupos hidrofóbicos no seu interior. Pode-se dizer que, por ser muito polar, a água promove dobras nas proteínas “espremendo” os grupos hidrofóbicos um contra o outro no interior de uma proteína globular. Essa é a principal interação que mantém a estrutura terciária de uma proteína. Figura estrutura terciaria - Estrutura quaternária: muitas proteínas são formadas por mais de uma cadeia polipeptídica. A maneira pela qual essas cadeias se arranjam em uma estrutura tridimensional é chamada de estrutura quaternária. A hemoglobina é um caso clássico de proteína que apresenta estrutura quaternária. São quatro cadeias polipeptídicas, duas alfa (α) e duas beta (β), formando a estrutura protéica. Figura da estrutura quaternária As quatro estruturas de proteínas Desnaturação de proteínas Toda proteína esta envolvida em alguma função particular dentro da célula. A estrutura tridimensional de uma proteína é de fundamental importância para que a mesma exerça sua função. O aquecimento de uma proteína pode, dependendoda temperatura, enfraquecer essas interações (principalmente ligações de hidrogênio e interações hidrofóbicas) a um ponto em que a estrutura tridimensional entra em colapso e a proteína é desdobrada. Como a proteína saiu de seu estado natural, diz-se que a proteína sobre desnaturação. A clara de ovo é rica em uma proteína globular chamada albumina, cuja função é nutrir o embrião. Essa proteína nos eu estado natural ou nativo é uma proteína globular que dissolve facilmente em água. O aquecimento da clara do ovo promove a desnaturação da albumina. O desdobramento da cadeia polipeptídica expõe os grupos hidrofóbicos e imediatamente essa proteína deixa de misturar-se com a água, o FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 4 que pode ser facilmente observado pelo caráter insolúvel que a clara do ovo adquire. Não só o aquecimento leva à desnaturação das proteínas, mas variações bruscas de pH no meio, solventes orgânicos (álcool e cetona), solução de ureia e detergentes também levam à desnaturação desses biopolímeros. A desnaturação não rompe as ligações peptídicas de uma proteína, de forma que uma proteína desnaturada não perde o valor nutritivo como alimento. Enzimas Uma das funções mais importantes das proteínas é a enzimática. Enzimas são proteínas que atuam como catalisadores biológicos, aumentando a velocidade de reações bioquímicas sem serem consumidas. O principal mecanismo de catálise exercida pelas enzimas é baseado na orientação das moléculas dos reagentes, tornando o choque entre elas altamente efetivo, ou seja, as enzimas possuem um sítio de posicionamento para os reagentes (substratos) que orientam o choque entre as moléculas e, consequentemente, diminui a energia necessária para que a reação ocorra. Ação de uma enzima Como as enzimas são proteínas globulares que possuem estrutura terciária e as vezes quaternária, estão também sujeitas à desnaturação. EXERCÍCIOS 01 Assinale a alternativa INCORRETA a respeito da molécula dada pela fórmula geral a seguir: a) É capaz de se ligar a outra molécula do mesmo tipo através de pontes de hidrogênio. b) Entra na constituição de enzimas. c) R representa um radical variável que identifica diferentes tipos moleculares dessa substância. d) Os vegetais são capazes de produzir todos os tipos moleculares dessa substância, necessários à sua sobrevivência. 02 Defina proteínas e diga quais são os produtos de hidrólise total de uma proteína. 03 Escreva a fórmula geral de um aminoácido, citando os componentes dessa fórmula. 04 Há alguns meses, foi lançado no mercado um novo produto alimentício voltado para o consumidor vegetariano: uma bebida sabor iogurte feita à base de leite de soja. À época, os comerciais informavam tratar-se do primeiro iogurte totalmente isento de produtos de origem animal. Sobre esse produto, pode-se dizer que é isento de: a) colesterol e carboidratos. b) lactose e colesterol. c) proteínas e colesterol. d) proteínas e lactose. e) lactose e carboidratos. 05 Considere as quatro frases seguintes. I – Enzimas são proteínas que atuam como catalisadores de reações químicas. II – Cada reação química que ocorre em um ser FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 5 vivo, geralmente, é catalisada por um tipo de enzima. III – A velocidade de uma reação enzimática independe de fatores como temperatura e pH do meio. IV – As enzimas sofrem um enorme processo de desgaste durante a reação química da qual participam. São verdadeiras as frases: a) I e III, apenas. b) III e IV, apenas. c) I e II, apenas. d) I, II e IV, apenas. e) I, II, III e IV. 06 (Mackenzie) As substâncias usadas pelos organismos vivos como fonte de energia e como reserva energética são, respectivamente: a) água e glicídios. b) água e sais minerais. c) lipídios e sais minerais. d) glicídios e sais minerais. e) glicídios e lipídios. 07 (UMC-SP) Para formar proteínas, a célula une aminoácidos, como está esquematizado entre 2 deles nesta questão. Responda: a) Como se chama a ligação entre dois aminoácidos? b) Em que partes das moléculas dos aminoácidos se dá a ligação? c) Qual é o nome da molécula resultante desta ligação entre dois aminoácidos? d) Qual é o significado de R1 e R2 nas moléculas dos aminoácidos? Gabarito: 1 – A 2 - Proteínas: são compostos orgânicos de alto peso molecular, formadas de aminoácidos. Representam cerca de 50% a 80% do peso seco da célula sendo, portanto, o composto orgânico mais abundante de matéria viva. A hidrólise completa dessas proteínas produz unicamente aminoácidos. 3 - Os aminoácidos tem uma fórmula básica comum, na qual os grupos amino e carboxila estão ligados ao carbono , ao qual também se liga um átomo de hidrogênio e um grupo variável chamado cadeia lateral ou grupo R. 4 – B 5 – C 6 – E 7. a) ligação peptídica (dipeptídica). b) Entre os grupamentos amina e ácido carboxílico. c) dipeptídeo. d) Indicam os radicais carbônicos, que são utilizados genericamente para demonstrar a existência de vários compostos orgânicos que se diferem por seus radicais. Por exemplo, o ácido etanoico e o ácido propanoico suas diferenças se dão à nível molecular devido aos radicais carbônicos. FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 6 Nomes, abreviaturas e formulas estruturas dos 20 aminoácidos primários FRENTE III – QUÍMICA ORGÂNICA BIOQUÍMICA: AMINOACIDOS, PEPTIDEOS E PROTEINAS Página 7
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