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Aminoácidos Todos os aminoácidos têm um grupo carboxílico, um grupo amino, um hidrogênio e um grupo R ligado a um carbono ; O átomo de carbono alfa () é um centro quiral; O grupo R é o responsável por diferir o aminoácido; Em decorrência do arranjo tetraédrico dos orbitais de ligação em volta do carbono , os quatro ligantes podem ocupar dois arranjos. Por tanto, têm dois estereoisômeros. As duas formas representam uma classe de enantiômeros; São opticamente ativos; Nas estruturas proteicas, os aminoácidos são encontrados sempre L-estereoisômeros (L- aminoácidos); Os D-aminoácidos são encontrados apenas em alguns peptídeos de parede bacteriana e peptídeos que agem como antibióticos. Classificação: Grupos R apolares, alifáticos: Aminoácidos são apolares e hidrofóbicos As cadeias laterais de alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar no interior de proteínas, estabilizando a estrutura proteica por ligação hidrofóbica Glicina = simples e contribui pouco nas interações hidrofóbicas Metionona = grupo tioéster Prolina = reduz a flexibilidade da cadeia devido a cadeia lateral alifática com estrutura cíclica Grupos R aromáticos: Fenilalanina, tirosina e triptofano, com suas cadeias laterais aromáticas, são relativamente apolares Fenilalanina = mais polar Absorvem luz na região ultravioleta do espectro Grupos R polares, não carregados: Os grupos R são mais solúveis em água, pois contêm grupos funcionais que formam ligação de hidrogênio Serina e treonina = grupo hidroxila Cisteina = grupo sulfidrila/ oxidada a cisteina Asparagina e glutamina = grupo amida Grupos R carregados positivamente (básico): Todos tem o grupo R de seis carbonos A carga positiva se localiza no nitrogênio Arginina = grupo guanidina Histidina = grupo imidazol (pKa próximo da neutralidade) Lisina = grupo amino primário Grupos R carregados negativamente (ácido): Os grupos R mais hidrofílicos Se ionizam em pH fisiológico Glutamato Aspartano
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